- Nghiên cứu cơ bản có tính định hướng, nghiên cứu ứng dụng tổng hợp, nghiên cứu khoa học về thủy lợi, thủy điện, bảo vệ môi trường trong khu vực miền Trung và Tây nguyên, bao gồm: Chiến lược phát triển thủy lợi; Quy hoạch phát triển và quản lý, sử dụng bền vững tài nguyên nước ở các lưu vực sông; Các giải pháp kỹ thuật phòng chống lũ lụt, giảm nhẹ thiên tai, chỉnh trị sông, bảo vệ các sông, suối, vùng bờ biển; Sử dụng đất bền vững, bảo vệ và cải tạo đất, phòng chống hạn hán và sa mạc hóa; Chế độ và kỹ thuật tưới, tiêu cho các loại cây trồng; Vật liệu xây dựng, địa kỹ thuật, nền móng và kết cấu công trình; Ảnh hưởng của biến đổi khí hậu đến nguồn nước, quy hoạch, xây dựng và vận hành hệ thống thủy lợi, đê điều, thủy sản, nông nghiệp, nông thôn; Công nghệ xây dựng, thông tin và tự động hóa các hệ thống thủy lợi; Các giải pháp khai thác, sử dụng nguồn nước, nước sạch vệ sinh môi trường.- Xây dựng mô hình thử nghiệm; Chuyển giao kết quả nghiên cứu khoa học, công nghệ trong các lĩnh vực nêu trên vào sản xuất.- Sản xuất, kinh doanh, xuất nhập khẩu trong lĩnh vực nêu trên.- Dịch vụ KH&CN: Tư vấn về quy hoạch, khảo sát, thiết kế, lập dự toán đầu tư, thẩm tra dự án, giám sát, thi công, quản lý dự án và giám định chất lượng công trình xây dựng thủy lợi, thủy điện, cơ sở hạ tầng, cấp thoát nước, thủy sản; Tham gia biên soạn các quy trình, quy chuẩn kỹ thuật, tiêu chuẩn, định mức kinh tế, kỹ thuật; Thông tin, đào tạo nâng cao trình độ chuyên môn trong lĩnh vực nêu trên; Hợp tác với các tổ chức trong và ngoài nước thực hiện nhiệm vụ của Viện.
