- Nghiên cứu khoa học, thực hiện các đề tài, dự án, chương trình trong lĩnh vực: tài nguyên nước và môi trường, môi trường giao thông, thủy lợi, cấp thoát nước.
- Dịch vụ KH&CN: Tư vấn, phản biện khoa học, giám định, thiết kế, quy hoạch, khảo sát, giám sát các dự án, tuyên truyền, phổ biến kiến thức, tổ chức hội nghị, hội thảo khoa học, biên soạn tài liệu, đào tạo bồi dưỡng nâng cao trình độ chuyên môn trong lĩnh vực nghiên cứu nêu trên. 
- Hợp tác với các tổ chức, cá nhân trong và ngoài nước thực hiện nhiệm vụ của Viện.