BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  19,976,647
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Công nghệ gen; nhân dòng vật nuôi;

Nguyễn Văn Tụng, Nguyễn Thị Kim Liên(2), Dương Chí Thành, Nguyễn Thu Hiền, Nguyễn Ngọc Lan, Nguyễn Thị Thanh Ngân(1), Nguyễn Huy Hoàng, Trịnh Thị Trang, Nguyễn Hữu Ninh, Nguyễn Hữu Hùng

Lắp ráp và chú giải hệ gen tôm thẻ chân trắng (Litopenaeus vannamei) bị nhiễm virus đốm trắng ở Việt Nam

Tạp chí Công nghệ Sinh học - Viện Khoa học và Công nghệ Việt Nam

2021

2

271-277

1811-4989

Tôm thẻ chân trắng, Lắp ráp de novo, Virus đốm trắng, Hệ gen

Tôm thẻ chân trắng Thái Bình Dương (Penaeus vannamei hoặc Litopenaeus vannamei) là loài tôm có nguồn gốc từ Nam Mỹ, đang là một trong những đối tượng tôm nuôi quan trọng có giá trị kinh tế cao ở Việt Nam và nhiều nơi trên thế giới. Trong hai thập kỷ gần đây, bệnh do virus đốm trắng (white spot syndrome virus - WSSV) gây ra ảnh hưởng nghiêm trọng đến ngành nuôi tôm với tỷ lệ gây chết có thể lên đến 100% sau 3 đến 10 ngày phát bệnh. Giải trình tự và lắp ráp hệ gen là một bước quan trọng để cung cấp thông tin di truyền và nghiên cứu các cơ chế phân tử ở các loài có giá trị kinh tế cao. Do đó nghiên cứu này tiến hành giải trình tự, lắp ráp và chú giải hệ gen của tôm thẻ chân trắng nhiễm virus đốm trắng tại Việt Nam. Dữ liệu hệ gen của tôm thẻ chân trắng nhiễm virus đốm trắng được lắp ráp bằng công cụ SOAPdenovo2 thu được hệ gen có kích thước khoảng 1,67Gb với 3.180.049 scaffold với N50 là 616 bp, từ đó dự đoán được 187.948 gen. Trong đó có 133.548 gen được chú giải trên cơ sở dữ liệu UniProtKB/Swissprot và 33.611 gen được chú giải trên cơ sở dữ liệu NT. Đây là những kết quả ban đầu có ý nghĩa quan trọng cho các nghiên cứu tiếp theo về tính trạng kháng bệnh virus đốm trắng của tôm thẻ chân trắng ở Việt Nam.

TTKHCNQG, CVv 262

Xem toàn văn