HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
Lọc theo danh mục
liên kết website
Lượt truy cập
Lượt truy cập :
19,361,640
- Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam
Cây rau, cây hoa và cây ăn quả
Nguyễn Thúy Điệp, Lê Thị Thu Trang, Kiều Thị Dung(1), Đặng Thị Thanh Hà, Trần Đăng Khánh, Lã Tuấn Nghĩa, Khuất Hữu Trung
Nghiên cứu đa dạng di truyền và nhận dạng một số giống quýt bản địa của Việt Nam dựa trên trình tự ITS hệ gen nhân
Studying on diversity and identification of vietnamese native Citrus reticulata species based on ribosomal DNA intenal transcribed spacer sequence
Nông nghiệp & Phát triển nông thôn
2020
24
3 - 9
1859 - 4581
Nguồn gen quýt (C. reticulata) bản địa của Việt Nam rất đa dạng và phong phú, cần được khai thác và sử dụng, phục vụ cho phát triển kinh tế, xã hội một cách hiệu quả và bền vững. Mười bốn mẫu/giống quýt được thu thập ở 10 tỉnh/thành khác nhau đã được giải trình tự nhờ khuếch đại locus ITS trong hệ gen nhân. Đoạn trình tự ITS của 14 mẫu/giống quýt đã được so sánh trình tự với gen tham chiếu công bố trên NCBI. Kết quả so sánh cho thấy độ tương đồng về trình tự nucleotide của các mẫu/giống quýt nghiên cứu và trình tự tham chiếu đã công bố trên NCBI dao động từ 94,0% đến 99,59% với độ bao phủ dao động từ 96-97%. Hệ số tương đồng di truyền của 14 mẫu/giống quýt nghiên cứu dao động từ 93,59 - 99,73%, 14 mẫu/giống quýt nghiên cứu được phân thành 4 nhóm chính. Dựa vào sự khác biệt nucleotide ở một số vị trí trong trình tự vùng ITS, có thể nhận dạng chính xác sáu mẫu/giống quýt đó là quýt Tích Giang (Q4), quýt Hương Cần (Q5), quýt đỏ Ngọc Hội (Q9), quýt Hôi (Q11), quýt ngọt Hà Giang (Q12) và quýt Bộp (Q13). Kết quả này rất có ý nghĩa, phục vụ cho công tác bảo tồn, khai thác và sử dụng có hiệu quả nguồn gen quýt bản địa của Việt Nam.
The Vietnamese native of mandarin orange genetic sources (C. reticulata) is very diversity and plentiful, which should be exploited and used, service for effectively and sustainably socio-economic development. Fourteen mandarin orange landraces have been collected in 10 different provinces and sequenced by amplification of the ITS locus in the nuclear genome. The ITS sequences of 14 mandarin orange accessions have been compared with reference gene which published in NCBI. The results showed that similarity of the nucleotide sequence of landraces and the published reference gene on NCBI ranged f-rom 94.00% to 99.59% with coverage ranged f-rom 96.00% to 97.00%. Genetic similarity coefficients of 14 mandarin orange accessions were in range f-rom 93.59 to 99.73%, 14 mandarin orange accessions were divided into 4 main groups. Based on nucleotide differences in several positions in the ITS region sequence, six landraces have been identified correctly, include Tich Giang (Q4), Huong Can (Q5) and Do Ngoc Hoi (Q9), Quyt Hoi (Q11), Ha Giang sweet tangerine (Q12) and Quyt Bop (Q13). This result is very useful for the conservation, exploitation and effective use of this precious genetic resources in Vietnam.
TTKHCNQG, CVv 201
Xem toàn văn