Nêu một số thành tựu nổi bật khoa học công nghệ thuỷ lợi trong những năm gần đây, những tồn tại, khó khăn thách thức. Từ đó đưa ra những định hướng nhiệm vụ trọng điểm năm 2001-2005. 1.Nhiệm vụ KHCN phục vụ việc thoát lũ, chỉnh trị sông, bảo vệ bờ, chống xâm nhập mặn cho hệ thống sông. 2.Phục vụ việc phục hồi,nâng cấp cơ sở hạ tầng và từng bước hiện đại hoá công tác quản lý hệ thống thuỷ nông hiện có. 3.Phục vụ nâng cao an toàn các hồ chứa đã xây dựng. 4.Đưa tiến bộ kỹ thuật vào việc thiết kế, thi công các công trình thuỷ lợi. 5.Đẩy mạnh việc đào tạo và nâng cao trình độ cán bộ quản lý, nghiên cứu khoa học