BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  22,435,405
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

68

Cây lương thực và cây thực phẩm

Phạm Mỹ Hạnh, Vũ Minh Trung, Trần Văn Tiến, Bùi Thị Thu Hương, Nguyễn Quốc Trung, Hà Thị Quyến, Phạm Châu Thùy, Lê Thị Ngọc Quỳnh(1)

Nghiên cứu khả năng cảm ứng phytohormone và biểu hiện đặc thù của nhóm gene mã hóa enzyme trehalose-6-phosphate phosphatase ở cây Sắn (Manihot esculenta)

Study on the phytohormone responsiveness and tissue-specific expression of genes encoding trehalose-6-phosphate phosphatase in Cassava (Manihot esculenta)

Khoa học và Công nghệ Lâm nghiệp

2023

4

3-10

1859-3828

Biểu hiện, Phytohormone, sắn, Trehalose-6-phosphate phosphatase, Yếu tố điều hòa cis-.

Cassava, Cis- regulatory element. Expression, Phosphatase, Phytohormone, Trehalose-6- phosphate.

Trehalose-6-phosphate phosphatase (TPP) được ghi nhận là enzyme chính tham gia vào quá trình sinh tổng hợp trehalose. Nghiên cứu trước đây đã ghi nhận vai trò của nhóm TPP liên quan đến các quá trình sinh học diễn ra ở thực vật. Trong nghiên cứu này, tổng số 10 thành viên của nhóm TPP đã được báo cáo trong dữ liệu của cây sắn (Manihot esculenta). Thông tin chú giải và vị trí phân bố trên nhiễm sắc thể của nhóm MeTPP đã được khai thác. Các gene thành viên MeTPP phân bố rải rác trên nhiễm sắc thể trong genome của cây sắn. Cụ thể, nhiễm sắc thể số 2, 6 và 14 chứa 2 gene MeTPP. Khảo sát vùng promoter của nhóm gene MeTPP đã phát hiện sự phân bố của các nhóm yếu tố điều hòa cis- cảm ứng phytohormone. Nghiên cứu đã xác định được promoter của 8 gene MeTPP chứa ít nhất một nhóm yếu tố điều hòa cis- cảm ứng với auxin, ethylene, abscisic acid, salicylic acid, jasmonic acid và gibberellin. Phân tích dữ liệu RNA-Seq cho thấy 7 gene MeTPP có biểu hiện ở ít nhất 1 mẫu. MeTPP09 được xác định là gene có biểu hiện đặc thù ở lá và gân lá, biểu hiện mạnh ở thân, tổ chức phát sinh phôi cấu tạo soma và mô phân sinh chóp rễ, trong khi MeTPP03 và 05 có xu hướng biểu hiện mạnh ở mô sẹo phôi hóa. Kết quả của nghiên cứu này đã cung cấp những thông tin cơ bản về nhóm enzyme TPP ở cây sắn để phân tích chức năng gene MeTPP liên quan đến tính chống chịu.

Trehalose-6-phosphate phosphatase (TPP) has been regarded as one major enzyme that is directly involved in the synthesis of trehalose. The function of TPP families has been demonstrated to be related to various biological processes in higher plant species. In this study, a total of 10 members of the TPP family have been identified in the assembly of cassava (Manihot esculenta). The annotation and chromosomal distribution of the MeTPP genes have been obtained. We found that the MeTPP genes are randomly localized in the chromosomes. Particularly, chromosome 2, 6 and 14 share the highest members (2) of the MeTPP family. Analysis of the 1000 bp sequences in the promoter regions of the MeTPP gene family showed a distribution of phytohormone- responsive cis- regulatory elements. Particularly, the promoter regions of 8 MeTPP genes contain at least one cis- regulatory elements that are responsive to auxin, ethylene, abscisic acid, salicylic acid, jasmonic acid and gibberellin. Of our interest, our RNA-Seq analysis indicated that 7 MeTPP genes are expressed in at least one major organ/tissue. Interestingly, MeTPP09 is specifically expressed in leaf, mid vein samples and highly expressed in stem, somatic organized embryogenic structure and root apical meristem samples, while two genes, like MeTPP03 and 05 are tended to highly expressed in friable embryogenic callus samples. The results of this study could provide comprehensive information of the TPP family in cassava for further functional characterization of the MeTPP genes related to stress tolerance.

TTKHCNQG, CVv 421

Xem toàn văn