BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  22,568,743
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Công nghệ liên quan đến xác định chức năng của ADN, protein, enzym

Phạm Thị Hồng Nhung, Đỗ Hạnh Nguyên, Bùi Thị Yến, Đỗ Thị Lệ Hằng, Vũ Thị Thơm, Đinh Đoàn Long(1)

Xây dựng quy trình phân tích gen ITS và matK của Dây thường xuân (Hedera nepalensis K. Koch) ở Việt Nam

Tạp chí Khoa học Y dược – Đại học Quốc gia Hà Nội

2020

3

83-90

2615-9309

ITS, MatK, Dây thường xuân, PCR

Dây thường xuân (Hedera nepalensis K. Koch) là cây thuốc thuộc chi Hedera, họ Nhân sâm (Araliaceae) phân bố hẹp trên thế giới, trong đó có một số tỉnh vùng núi phía Bắc Việt Nam. Loài này được chứng minh có nhiều tác dụng dược lý như chống oxy hóa, bảo vệ thần kinh, chống viêm, giảm đau,… và đặc biệt có tiềm năng trong điều trị ung thư và đái tháo đường. Để định hướng khai thác và bảo tồn bền vững nguồn gen Dây thường xuân một cách hiệu quả, đánh giá đa dạng di truyền dựa trên chỉ thị phân tử làthực sự cần thiết. Vì vậy, chúng tôi tiến hành xây dựng quy trình nhân dòng đoạn gen ITS và matK trên 06 mẫu Hedera. Phương pháp nghiên cứu bao gồm tách chiết ADN tổng số tách từ mẫu lá khô, nhân dòng đoạn gen ITS và matK bằng phản ứng PCR dùng mồi đặc hiệu, giải trình tự và so sánh độ tương đồng với các mẫu trên Genbank. Kết quả cho thấy chúng tôi đã xây dựng thành công quy trình nhân dòng gen ITS và matK. Các mẫu nghiên cứu đều được khuếch đại và giải trình tự thành công 100% trong đó có 04 mẫu (N1-N4) có trình tự tương đồng cao với H. nepalensis và 02 mẫu (H1 và H2) có trình tự tương đồng cao với H. helix. Các kết quả này sẽ cung cấp công cụ và số liệu cho các nghiên cứu tiếp theo nhằm đánh giá đa dạng di truyền nguồn gen Dây thường xuân ở Việt Nam.

TTKHVNQG, CTv 182

Xem toàn văn
  • [1] H. Sun, W. McLewin, M.F. Fay, (2001), Molecular phylogeny of Helleborus (Ranunculaceae), with an emphasis on the East Asian‐Mediterranean disjunction,Taxon, 50 (2001) 1001-1018
  • [2] X. Lei, Y.W. Wang, S.Y. Guan, L.J. Xie, L. Xin, C.Y. Sun, (2104), Prospects and problems for identification of poisonous plants in China using DNA barcodes,Biomed Environ Sci, 27 (2014) 794-806
  • [3] P. Vargas, H.A. McAllister, C. Morton, S.L. Jury, M.J. Wilkinson, (1999), Polyploid speciation in Hedera (Araliaceae): Phylogenetic and biogeographic insights based on chromosome counts and ITS sequences,Pl Syst Evol, 219 (1999) 165-179
  • [4] S. Xu, D. Li, J. Li, X. Xiang, W. Jin, W. Huang, X. Jin, L. Huang, (2015), Evaluation of the DNA barcodes in Dendrobium (Orchidaceae) f-rom mainland Asia,PloS one, 10 (2015) e0115168
  • [5] J.H. Cota-Sánchez, K. Remarchuk, K. Ubayasena, (2006), Ready-to-use DNA extracted with a CTAB method adapted for herbarium specimens and mucilaginous plant tissue,Plant Mol Biol Rep, 24 (2006)161
  • [6] D.D. Long, (2019), Comparative analysis of different DNA extraction methods and preliminary analysis of genetic diversity of Hedera nepalensis K. Koch. in Vietnam based on GBSSI marker,VNU Journal of Science: Medical and Pharmaceutical Sciences, 35 (2019) 88-95 (in Vietnamese).
  • [7] D. Bošeľová, J. Žiarovská, L. Hlavačková, K. Ražná, M. Bežo, (2016), Comparative analysis of different methods of Hedera helix DNA extraction and molecular evidence of the functionality in PCR Acta fytotechn zootechn,19 (2016) 144-149.
  • [8] P. Cuénoud, V. Savolainen, L.W. Chatrou, M. Powell, R.J. Grayer, M.W. Chase, (2002), Molecular phylogenetics of Caryophyllales based on nuclear 18S rDNA and plastid rbcL, atpB, and matK DNA sequences,Am J Bot, 89 (2002) 132-144.
  • [9] Y. Sun, D. Skinner, G. Liang, S. Hulbert (1994), Phylogenetic analysis of Sorghum and related taxa using internal transcribed spacers of nuclear ribosomal DNA,Theor Appl Genet, 89 (1994) 26- 32
  • [10] R. Li, J. Wen (2013), Phylogeny and biogeography of Dend-ropanax (Araliaceae), an amphi-Pacific disjunct genus between tropical/subtropical Asia and the Neotropics,Syst Bot, 38 (2013) 536-551
  • [11] D. Grivet, R. Petit, (2002), Phylogeography of the common ivy (Hedera sp.) in Europe: genetic differentiation through space and time,Mol Ecol, 11 (2002) 1351-1362
  • [12] R.M. Bhagwat, B.B. Dholakia, N.Y. Kadoo, M. Balasundaran, V.S. Gupta, (2015), Two new potential barcodes to discriminate Dalbergia species,PloS one, 10 (2015) e0142965
  • [13] S. Abugalieva, L. Volkova, Y. Genievskaya, A. Ivaschenko, Y. Kotukhov, G. Sakauova, Y. Turuspekov, (2017), Taxonomic assessment of Allium species f-rom Kazakhstan based on ITS and matK markers,BMC plant biol, 17 (2017) 258
  • [14] P.Z. Goldstein, R. DeSalle, (2019), Review and interpretation of trends in DNA barcoding,Front Ecol Evol, 7 (2019) 302
  • [15] N.D. Thanh. (2014), DNA marker techniques in study and se-lection of plant,Journal of Biology. 36 (2014) 265-294 (in Vietnamese)
  • [16] H. Ismail, A. Rasheed, I.-u. Haq, L. Jafri, N. Ullah, E. Dilshad, M. Sajid, B. Mirza, (2017), Five indigenous plants of Pakistan with Antinociceptive, antiinflammatory, antidepressant, and anticoagulant properties in Sprague Dawley rats,Evid Based Complement Al-ternat Med, 2017 (2017)
  • [17] W.J. Hashmi, H. Ismail, F. Mehmood, B. Mirza, (2018), Neuroprotective, antidiabetic and antioxidant effect of Hedera nepalensis and lupeol against STZ+ AlCl 3 induced rats model,DARU, 26 (2018) 179-190
  • [18] S. Saleem, L. Jafri, I. ul Haq, L.C. Chang, D. Calderwood, B.D. Green, B. Mirza, (2014), Plants Fagonia cretica L. and Hedera nepalensis K. Koch contain natural compounds with potent dipeptidyl peptidase-4 (DPP-4) inhibitory activity,J Ethnopharmacol, 156 (2014) 26-32
  • [19] L. Jafri, S. Saleem, N. Ullah, B. Mirza, (2017), In vitro assessment of antioxidant potential and determination of polyphenolic compounds of Hedera nepalensis K. Koch,,Arab J Chem, 10 (2017) 3699-3706
  • [20] T. Li, H. Pan, Y. Feng, H. Li, Y. Zhao, (2015), Bioactivityguided isolation of anticancer constituents f-rom Hedera nepalensis K. Koch,S Afr J Bot, 100 (2015) 87-93
  • [21] A. Sadat, M. Alam, A. Rauf, W. Ullah, (2012), Biological screening of ethyl acetate extract of Hedera nepalensis stem,Afr J Pharm Pharmacol, 6 (2012) 2934-2937. https://doi.org/10.5897/AJPP12.828
  • [22] D.H. Bich, D.Q. Cuong, B.X. Chuong, N. Thuong, D. T. Dam. (2006), The medicinal plants and animals in Vietnam,
  • [23] V.V. Chi. (2012), Dictionary of Vietnamese Medicinal Plants,