BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  20,808,332
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Công nghệ gen; nhân dòng vật nuôi;

Võ Văn Hải, Trịnh Thị Bích Ngọc, Phạm Quang Hưng, Nguyễn Văn Tâm, Vũ Xuân Đăng, Bùi Trần Anh Đào(1), Lê Văn Phan(2)

Giải mã và phân tích hệ gen của Parvovirus phân lập được trên chó tại một số tỉnh phía Bắc Việt Nam

Genomic Sequencing and Analysis of Parvovirus Isolated from Dogs in some Northern Provinces of Vietnam

Khoa học Nông nghiệp Việt Nam

2022

05

614-625

2588-1299

Chó, Canine parvovirus type 2, Giả mã bộ gen, Phân tích bộ gen, CPV-2c

: Dogs, Canine parvovirus type 2, Genomic sequencing, CPV-2c.

Canine Parvovirus type 2 (CPV-2) là virus gây bệnh viêm ruột tiêu chảy cấp tính trên chó. CPV-2 là một ADN virus và dựa trên trình tự gen VP2, CPV-2 được chia thành 3 biến thể là CPV-2a, CPV-2b và CPV-2c. Hiện nay CPV-2c là biến thể đang lưu hành phổ biến trên thế giới cũng như Việt Nam. Trong nghiên cứu này, trình tự hệ gen của 8 chủng Parvovirus phân lập được từ chó tại một số tỉnh của miền Bắc trong giai đoạn 2018-2020 đã được giải trình tự. Kết quả giải trình tự hệ gen của các chủng virus trong nghiên cứu đã thu được trình tự gen có chiều dài là 4269 nucleotide (nt), trong đó trình tự gen mã hóa cho khung đọc mở (ORF) tương ứng với protein phi cấu trúc (nonstructural protein) là 2007 nt và protein cấu trúc (structural protein) là 2256 nt. Kết quả phân tích cây phả hệ dựa trên trình tự hệ gen cho thấy cả 8 chủng Parvovirus phân lập được từ chó trong nghiên cứu này đều thuộc CPV-2c, cùng nằm trong nhánh phát sinh thuộc genotype Asia-4. Trình tự hệ gen của Parvovirus gây bệnh trên chó thu được trong nghiên cứu này sẽ là nguồn dữ liệu gen quan trọng phục vụ các nghiên cứu về tiến hóa di truyền theo không gian và thời gian của các chủng Parvovirus đã và đang gây bệnh trên đàn chó tại Việt Nam.

Canine Parvovirus type 2 (CPV-2) is a virus that causes acute diarrheal enteritis in dogs. CPV-2 is a DNA virus and based on the VP2 gene sequence, CPV-2 is clasified into CPV-2a, CPV-2b and CPV-2c. Currently, CPV2c is the most popular variant circulating in the world as well as in Vietnam. In this study, the genome sequences of eight canine Parvovirus strains isolated in some northern provinces of Vietnam during 2018 - 2020 were sequenced. The results of genome sequencing of the Parvovirus strains have obtained genetic sequences of 4269 nucleotides (nt) in length, in which the gene sequence coding for the open reading frame (ORF) corresponding to the non-structural proteins was 2007 nt and structural proteins was 2256 nt in length. The phylogenetic analysis based on the full genome sequences showed that all eight present canine Parvovirus strains belonged to CPV-2c and shared the same evolutionary brand with clade Asia-4. The whole genomic sequence data of canine Parvovirus obtained in this study will be an important source for any spatial and temporal genetic evolution studies of canine Parvovirus strains circulating in Vietnam.

TTKHCNQG, CTv 169

Xem toàn văn