BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  28,107,926
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Công nghệ gen; nhân dòng vật nuôi;

Hoàng Thị Thu Yến(1), Dương Thị Hiền

Đặc điểm trình tự nuceotide của chỉ thị phân tử SSR trong gen mã hóa sucrose synthase phân lập từ giống chè trung du xanh và trung du tím

Characteristics of nucleotide sequence of SSR marker in gene coded sucrose synthase from green and purple Trung du tea varieties

Khoa học và Công nghệ - Đại học Thái Nguyên

2020

8

461-465

1859-2171

Cây chè, Camellia sinensis, Đa dạng di truyền, SSR, Microsatellite, Sucrose synthase

Tea, Camellisa sinensis, Genetics diversity, SSR, Microsatellite, Sucrose synthase

Chỉ thị SSR (single sequence repeat-SSR) có nguồn gốc từ cDNA/EST có ưu điểm giảm chi phí và thời gian xây dựng chỉ thị do các đoạn cDNA/EST liên quan trực tiếp đến các gen chức năng Trong nghiên cứu này, chúng tôi tiến hành phân lập, xác định và phân tích trình tự nucleotide chỉ thị SSR của gen mã hóa sucrose synthase - enzyme tham gia vào quá trình tổng hợp sucrose làm cơ sở nghiên cứu chỉ thị phân tử ứng dụng trong chọn tạo giống chè. Motif TTGTT thuộc đầu 3’UTR (Untranslated region) của gen mã hóa sucrose synthase được lặp lại trong hai mẫu nghiên cứu thuộc nhóm gián đoạn bởi một vài base không thuộc cấu trúc motif, trình tự motif thu được tương ứng ở chè Trung du xanh và Trung du tím lần lượt là (TTGTT)4 GTT (TTGTT)4; (TTGTT)6 GTT (TTGTT)3; (TTGTT)5 GTT (TTGTT). So sánh trình tự motif TTGTT của gen mã hóa sucrose synthase với các trình tự đã công bố cho thấy, mottif TTGTT có thể có tính bảo thủ trong giống và tính đa hình cao giữa các giống chè phân tích.

cDNA/EST - derived SSR markers (single sequence repeat-SSR) has the advantage of reducing the cost and time of directing the marker because cDNA/EST fragments are directly related to functional genes. In this study, we conducted an analysis of the nucleotide sequence of SSR marker of the gene encoding sucrose synthase - the enzyme involved in sucrose synthesis as a basis for molecular markers applied in tea breeding. Motif TTGTT belongs to 3’ UTR (untranslated region) of the gene encoding sucrose synthase was repeated in two samples of the interrupted group by a few bases that are not motif structure, the motif sequence obtained in green and purple Trung du tea, respectively (TTGTT) 4 GTT (TTGTT) 4; (TTGTT) 6 GTT (TTGTT) 3; (TTGTT) 5 GTT (TTGTT). Comparing the TTGTT sequence of the sucrose synthase encoding gene with the published sequences shows that the TTGTT mottif has a conservative in varieties and a high polymorphism among the analyzed tea varieties.

TTKHCNQG, CTv 178

Xem toàn văn
  • [1] T. T. Y. Hoang; T. H. T. Mai; T. H. Pham; T. T. H. Huynh (2017), Cloning and sequence analysis of gene encoding flavonol synthase f-rom Trung du teas growing in Thai Nguyen,Journal of science, Vietnam national unviversity, vol. 33, no. 4, pp. 127-136, 2017.
  • [2] Vi Van (2015), Improving productivity and quality of Trung du tea. Thai Nguyen,Thai Nguyen electricity newspaper, 2015
  • [3] Quan Trang (2019), Conservation and promoting the value of Trung du tea 2019,
  • [4] V. Dinh (2012), Purple Trung du tea and conservation concern. Phu Tho,Phu Tho electricity newspaper", 2012.
  • [5] V. V. Luong; H. T. Pham; H. V. Le, (2013), Technology of green tea production and processing,Agriculture Publishing House, Ha Noi, 2013
  • [6] N. Q. Do; T. K. Le (2000), Textbook of tea production, processing and consumption,Agriculture Publishing House, Ha Noi, 2000
  • [7] O. Stein;. Granot (2019), An Overview of Sucrose Synthases in Plants,Front Plant Science, vol. 10, p. 95, 2019
  • [8] T. T. Y. Hoang; T. N. Duong; T. T. H. Ha; B. V. Le; H. H. Nguyen (2017), Invectigation SSR msrrker f-rom teas (Camellia sinensis) growing in Thai Nguyen province,Journal of Biology, vol. 39, no. 1, pp. 68-79, 2017.
  • [9] D. T. Tran; T. N. La; T. T. T. Le; V. T. Nguyen (2009), Study on genetic diversity by molecular markers of tea varieties in Vietnam,Journal of agriculture & rural development, no. 4, pp. 9-13, 2009
  • [10] Y. C. Zhao; R. Fu; C. H. Mo; M. H. Li, (2008), Degradation dynamics of DDT in contaminated soil using laccase,Environmental Chemistry, vol. 27, pp. 476-480, 2008.
  • [11] F. Taniguchi; H. Fukuoka; J. Tanaka (2012), Expressed sequence tags f-rom organ-specific cDNA libraries of tea (Camellia sinensis) and polymorphisms and transferability of EST SSRs across Camellia species,Breeding Science, vol. 62, no. 2, pp. 186-195, 2012
  • [12] H. Sharma; R. Kumar; V. Sharma; V. Kumar; P. Bhardwaj; P. S. Ahuja; R. K. Sharma (2009), Identification and cross-species transferability of 112 novel unigene-derived microsatellite markers in tea (Camellia sinensis),American Journal of Botany, vol. 98, no. 6, pp. 133-138, 2009.
  • [13] J. Q. Ma; Y. H. Zhou; C. L. Ma; M. Z. Yao; J. Q. Jin; X. C. Wang; L. Chen (2010), Identification and c-haracterization of 74 novel polymorphic EST-SSR markers in the tea plant, Camellia sinensis (Theaceae),American Journal of Botany, vol. 97, no. 12, pp. 153-156, 2010
  • [14] J. Sahu; R. Sarmah; B. Dehury; K. Sarma; S. Sahoo; M. Sahu; M. Barooah; M. K. Modi; P. Sen, (2012), Mining for SSRs and FDMs f-rom expressed sequence tags of Camellia sinensis,Bioinformation, vol. 8, no. 6, pp. 260-266, 2012