BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  23,916,279
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Vi rút học

Nguyễn Thanh Việt, Trần Kiên Cường(1), Nguyễn Thị Nhã, Thân Văn Thái

Xác định đặc điểm di truyền học của Sri Lanka cassava mosaic virus gây bệnh khảm lá sắn tại Việt Nam

Genetic characterization of Sri Lanka cassava mosaic virus infecting cassava in Vietnam

Tạp chí khoa học và công nghệ - Đại học Nguyễn Tất Thành

2020

09

28-32

2615-9015

Genome A, Genome B, Bệnh khảm lá sắn

Sri Lanka cassava mosaic virus, Genome A, Genome B, Viet Nam

Bệnh khảm lá sắn (Cassava mosaic disease, CMD), do vi-rút thuộc họ Geminiviridae gây ra, là một trong 10 bệnh gây thiệt hại mùa màng lớn nhất trên thế giới. Trong nghiên cứu này, các mẫu lá sắn với bệnh tích khảm đặc trưng được thu thập tại Tây Ninh, Ninh Thuận và Củ Chi. Kết quả PCR xác định các mẫu dương tính với Sri Lanka cassava mosaic virus (SLCMV). Phân tích đặc điểm di truyền genome A và B cho thấy các chủng SLCMV nghiên cứu chia sẻ mức độ tương đồng cao về nucleotide và amino acid với nhau và cùng nhóm với các chủng SLCMV phân lập được tại Sri Lanka, Ấn Độ, Campuchia và Trung Quốc; qua đó dự đoán các chủng SLCMV này có chung nguồn gốc. Kết quả trên cũng dự đoán SLCMV lưu hành tại nước ta có thể bắt nguồn từ các quốc gia báo cáo bệnh trước đó, đặc biệt là Campuchia - quốc gia có chung đường biên giới với nước ta. Kết quả nghiên cứu này giúp đánh giá đặc điểm sinh học, di truyền học, nhằm hỗ trợ công tác kiểm soát và dự đoán xu hướng lây nhiễm của SLCMV trên cây sắn tại Việt Nam.

Cassava mosaic disease, causes by Geminiviridae family, is one of ten most importance plant viral diseases that causes heavy economic loss in crop industry all around the world. In this study, we successfully detected SLCMV from the cassava leaves with typical cassava mosaic disease collected from Tay Ninh, Ninh Thuan, Dong Nai, Ba Ria-Vung Tau, and Ho Chi Minh City. Genetic characterization of the genome A and genome B revealed that the studied SLCMV strains shared the highest nucleotide and amino acid identity each others and shared closely relationship with the SLCMV strains isolated in Sri Lanka, India, Cambodia, and China, suggesting that these strains shared common ancestor. The results also suggested that the circulating SLCMV in Vietnam may infected from SLCMV isolated in one of those contries, especially Cambodia where sharing the border with Vietnam. These results provided important information on the biological and molecular characterization of the circulating SLCMV in Vietnam, as well as the evident for control and predict the circulation of SLCMV in future.

TTKHCNQG, CVv 503

Xem toàn văn
  • [1] Tiendrebeogo, F. (2012), Evolution of African cassava mosaic virus by recombination between bipartite and monopartite begomoviruses.,Virol J (2012) 9:67.
  • [2] Saunders, K., (2002), C-haracterisation of Sri Lankan cassava mosaic virus and Indian cassava mosaic virus: evidence for acquisition of a DNA B component by a monopartite begomovirus.,Virology (2002) 293:63-74.
  • [3] Wang, D. (2018), First Report of Sri Lankan Cassava Mosaic Virus Infected Cassava in China.,Plant Disease (2018) 103
  • [4] Wang, H.L. (2016), First report of Sri Lankan cassava mosaic virus infecting cassava in Cambodia.,Plant Disease (2016) 100:1029
  • [5] Kumar, S., G. Stecher, K. Tamura (2016), MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets.,Mol Biol Evol (2016) 33:1870-1874.
  • [6] Thompson, J.D. (1997), The CLUSTAL_X windows interface: flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools.,Nucleic Acids Res (1997) 25:4876-4882.
  • [7] Hall, T.A. (1999), BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT.,Nucl Acids Symp Ser (1999) 41:95-98.
  • [8] Nguyễn, H.T.; T.N. Phạm (2019), Ảnh hưởng của bệnh khảm lá virus đến năng suất và chất lượng tinh bột của một số giống sắn tại Đông Nam bộ và Tây Nguyên.,Kỉ yếu hội thảo quốc gia bệnh hại thực vật Việt Nam lần thứ 18 (2019) 31-36.
  • [9] Briddon, R.W. (2010), Distinct evolutionary histories of the DNA-A and DNA-B components of bipartite begomoviruses.,BMC Evol Biol (2010) 10:97.
  • [10] Patil, B.L.; C.M. Fauquet (2009), Cassava mosaic geminiviruses: actual knowledge and perspectives.,Mol Plant Pathol (2009) 10:685-701.
  • [11] Dutt, N., R.W. Briddon, I. Dasgupta, (2005), Identification of a second begomovirus, Sri Lankan cassava mosaic virus, causing cassava mosaic disease in India.,Arch Virol (2005) 150:2101-2108.