BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  20,695,125
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Công nghệ gen; nhân dòng vật nuôi;

Nguyễn Thị Ngọc Lan, Phutthakone Vaciaxa, Nguyễn Thành Chung, Nguyễn Hữu Quân, Phạm Thị Thanh Nhàn(2), Vũ Thị Thu Thủy(1), Chu Hoàng Mậu

Đặc điểm và sự phát sinh của phân họ gen DREB ở đậu tương [Glycine max (L.) Meril]

Characteristics and phylogeny of DREB gene subfamily in soybeans [Glycine max (L.) Meril]

Khoa học & Công nghệ Việt Nam

2021

02

60-64

1859 - 4794

Điểm liên kết DNA, Glycine max, Miền AP2, Phân họ DREB, Phân tích phát sinh

AP2 domain, DNA binding site, DREB subfamily, Glycine max, Phylogenetic analysis

Nhân tố phiên mã DREB (Dehydration responsive element binding protein) liên kết với yếu tố tác động cis của vùng kích hoạt (promoter) có vai trò điều chỉnh sự hiển thị các gen phản ứng với stress phi sinh học của thực vật. Trong nghiên cứu này, 69 trình tự gen DREB của cây đậu tương từ cơ sở dữ liệu NCBI đã được xác định thuộc về 18 gen GmDREB (Glycine max DREB). Các gen GmDREB có từ 1 đến 8 bản copy, phân bố trên 17 nhiễm sắc thể (NST), trong đó GmDREB3 có 8 copy, còn lại các gen GmDREB khác có 1-4 copy. Miền AP2 của protein DREB phổ biến là motif PTPEMAARAYDVAALALKGPSARLNFPEL, chứa 11 điểm liên kết với promoter của các gen chức năng, với 4 dạng và phổ biến là RGRRWKERRWT (có ở 13/18 protein DREB). Cây phát sinh dựa trên trình tự nucleotide của các gen GmDREB và trình tự amino acid của miền AP2 trong protein DREB thể hiện sự tiến hóa và mối quan hệ của phân họ DREB ở đậu tương. Kết quả nghiên cứu cung cấp thông tin toàn diện về phân họ gen DREB, làm cơ sở cho các phân tích thực nghiệm nhằm làm rõ hơn chức năng của một số thành viên trong phân họ gen này.

Dehydration responsive element binding proteins (DREB) are transcription factors linked to cis-acting elements of the promoter region, which regulate plant gene expression in response to abiotic stress. In this study, 69 DREB gene sequences of soybean from NCBI belonging to 18 GmDREB (Glycine max DREB) genes of 1 to 8 copies distributed on 17 chromosomes were identified in which GmDREB3 has 8 copies and the rest consisted of 1 to 4 ones. The motif PTPEMAARAYDVAALALKGPSARLNFPEL containing 11 points associated with the promoter of functional genes existed in 4 main types with the most popular one RGRRWKERRWT found in 13/18 DREB proteins was regarded as the popular AP2 domain of DREB protein. The phylogenetic tree based on the nucleotide sequences of GmDREB genes and the amino acid sequences of the AP2 domain expresses the evolution and relationship of the DREB subfamily in soybean. This study provides comprehensive information about the DREB subfamily, which formed the basis for experimental analyses to clarify the function of some members of this subfamily.

TTKHCNQG, CVv 8

Xem toàn văn