BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  20,051,678
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

68

Di truyền và nhân giống động vật nuôi

Nguyễn Thị Quỳnh Châu, Giang Thị Thanh Nhàn, Nguyễn Văn Ba, Nguyễn Khánh Vân(1), Phạm Doãn Lân

Đa hình gen Fut1 và Tap1 ở một số giống lợn bản địa Việt Nam

Analysis of polymorphisms in the FUT1 and TAP1 genes in some Vietnamese native pig breeds

Khoa học kỹ thuật chăn nuôi

2022

283

2 - 7

1859-476X

Gen FUT1, Gen TAP1, Lợn bản địa, Đa hình gen

Gen FUT1, Gen TAP1, Indigenous pigs, Gene polymorphism

Nghiên cứu được thực hiện nhằm xác định tần số alen và tần số kiểu gen của đa hình gen alpha (1, 2) fucosyltransferase (FUT1) và gen transporter associated with antigen processing (TAP1) ở 25 giống lợn bản địa Việt Nam và 1 giống lợn ngoại. Tổng số 1.300 mẫu mô tai được thu thập và tách chiết ADN. Phương pháp PCR-RFLP được sử dụng để phân tích đa hình gen FUT1 và TAP1 bằng enzym giới hạn Hin6I và MboI tương ứng. Kết quả nghiên cứu cho thấy: đa hình gen FUT1, chỉ thu được 100% kiểu gen GG. Đối với đa hình gen TAP1, đã xác định được ba kiểu gen AA, AG, GG và hai alen A và G trong 26 giống. Trong đó, kiểu gen GG (có khả năng kháng mạnh vi khuẩn E. coli gây tiêu chảy ở lợn) xuất hiện với tần số cao ở nhiều giống lợn bản địa như CBT (82%), SDL (80%); kiểu gen AG xuất hiện với tần số cao nhất ở BBC (56%) và thấp nhất ở SDL (14%); kiểu gen AA có tần số cao nhất ở MC (60%), không xuất hiện ở bốn giống (HL, MT, CBT, DR). Alen G có tần số cao (>0,5) ở hầu hết các giống như HL (0,92), CBT (0,91), HCB (0,87), MT (0,81) ngoại trừ MC (0,20), VP (0,40), CAL (0,49). Tần số alen A chiếm thấp (<0,5) ngoại trừ MC (0,78), CAL (0,51). Kết quả giải trình tự gen FUT1 không phát hiện đột biến G/A ở vị trí M307, đã phát hiện đột biến mới thay thế nucleotide C/T cách vị trí M307 hai nucleotide và giải trình tự gen TAP1 đã xác định được đột biến điểm G/A ở vị trí G729. Ngoại trừ ba quần thể lợn SDL, OL, DR, tần số kiểu gen ở locus G729 gen TAP1 của các quần thể lợn còn lại đều ở trạng thái cân bằng Hardy-Weinberg.

The analysis of 25 native Vietnamese pig breeds and 1 foreign pig breed were carried out to assess the allele and genotype frequencies of single nucleotide polymorphisms M307, G729 present in the alpha (1, 2) fucosyltransferase (FUT1) and transporter associated with antigen processing (TAP1) gene, respectively. A total of 1300 ear tissue samples were collected and total DNA extrac-ted. The PCR-RFLP method was used to analyze the FUT1 and TAP1 gene polymorphisms using the restriction enzyme Hin6I and MboI, respectively. The results showed that: only GG genotype was obtained (100%) in the FUT1 gene polymorphism. For the TAP1 gene polymorphism, three genotypes AA, AG, GG and two alleles A and G were identified in 26 pig breeds. In native breeds, the frequencies of the favoruable GG genotype were high such as CBT (82%), SDL (80%), and the frequency of AG genotype was the highest in BBC (56%) and lowest in SDL (14%); the frequency of AA genotype was the highest MC (60%), and not found in 4 breeds (HL, MT, CBT, DR). The G allele was a high frequency (>0.5) in most breeds such as HL (0.92), CBT (0.91), HCB (0.87), MT (0.81)...except MC ( 0.20), VP (0.40), CAL (0.49), meanwhile the frequency of A allele was low (<0.5) except MC (0.78), CAL (0.51). Sequencing results of FUT1 gene were not found G/A mutation at M307, besides, a new allelic variant was identified C/T distance two nucleotide from M307. The G/A mutation at G729 TAP1 gene was detected in the sequencing results. Except for the SDL, OL, DR breeds, the frequencies of TAP1 genotypes of the rest breeds were found to be in Hardy-Wein-berg equilibrium at the G729 locus.

TTKHCNQG, CVv 345

Xem toàn văn