Nếp uốn của các protein trong điều kiện năng lượng tự do tiền hình thành

Chỉ số đề mục

30.01

Lĩnh vực nghiên cứu

Vật lý

Dạng tài liệu

Tác giả

, Phạm Đức Đan⁽¹⁾

Nhan đề

Nếp uốn của các protein trong điều kiện năng lượng tự do tiền hình thành

Nhan đề tiếng anh

Folding of proteins in presculpted free energy landscape

Nguồn trích

Communications in Physics

Năm xuất bản

2013

Số

4

Trang

313-319

ISSN

0868-3166

Từ khóa

Nếp uốn, Các protein, Điều kiện, Năng lượng tự do, Giai đoạn tiền hình thành

Từ khóa tiếng anh

Tóm tắt

Tóm tắt tiếng anh

Recent studies of the tube model of protein have indicated that the free energy landscape of proteins is presculpted by symmetry of the protein backbone and geometrical constraints played by the hydrogen bonds. In this study, the authors investigate the role of amino acid' sequences in the folding of proteins. the authors consider two models that are differed by sequence specificity: the tube HP model with hydrophobic (H) and polar (P) sequences, and the tube Go model with native-centric contact potentials. Monte Carlo simulations are carried out for two sequences of length of 48 amino acids, whose ground states are a three-helix bundle and a GEl-like structure. The results show that folding in the Go model is more cooperative than in the HP model. In the HP model the collapse transition and the folding transition are separated, whereas in the Go model the two transitions coincide.

Kí hiệu kho

TTKHCNQG, CLv 2393

File toàn văn

Xem toàn văn