



- Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam
76
BB
Trần Hồng Diễm(1), Nguyễn Thị Trúc Anh, Nguyễn Hồng Phúc, Vũ Quang Hiếu
Phát triển phương pháp khuếch đại trung gian vòng lặp cho phát hiện vi khuẩn staphylococcus aureus kháng methicillin
Detection of methicillin resistant staphylococcus aureus using loop mediated isothermal amplification
Y học Cộng đồng
2025
1
142-149
2354-0613
Phát triển phương pháp khuếch đại trung gian vòng lặp (LAMP) trong phát hiện vi khuẩn Staphylococcus aureus kháng Methicillin bằng gene mecA đặc trưng ứng dụng trong phát hiện nhanh MRSA trên mẫu phết mũi. Phương pháp: Nghiên cứu thực nghiệm được tiến hành 60 mẫu phết mũi ở nhóm người khỏe mạnh có độ tuổi từ 18-25. Thực hiện thiết kế bộ mồi đặc hiệu cho phản ứng LAMP trên phần mềm thiết kế mồi. Phản ứng LAMP được tối ưu hóa điều kiện phản ứng trong phòng thí nghiệm nhằm xác định nhiệt độ, độ đặc hiệu và giới hạn phát hiện tối thiểu của DNA (LOD). Phản ứng LAMP sau tối ưu được thử nghiệm trên 60 mẫu ly trích DNA từ mẫu phết mũi, trong đó có 30 mẫu dương tính với MRSA và 30 mẫu âm tính với MRSA. Kết quả: Các cặp mồi đặc hiệu cho gene mecA đã được thiết kế và phản ứng khuếch đại được tối ưu hóa ở 65°C trong 30 phút. Phương pháp LAMP cho kết quả nhạy, đặc hiệu cao với giới hạn phát hiện thấp nhất (LOD) là 1 pg DNA tách chiết từ MRSA có trong mỗi phản ứng và không xảy ra phản ứng chéo loài. Khi ứng dụng phương pháp LAMP trên 60 mẫu DNA tách chiết từ mẫu phết mũi, phản ứng LAMP đã cho độ nhạy, độ đặc hiệu đạt 100% và hệ số Kappa bằng 1 đạt mức tương đồng cao khi so sánh với phương pháp nuôi cấy vi sinh và PCR truyền thống. Kết luận: Nghiên cứu đã ứng dụng phương pháp LAMP trong phát hiện sự hiện diện của vi khuẩn MRSA từ các mẫu lâm sàng, với độ đặc hiệu, độ nhạy cao bằng gene mecA. Đồng thời, nghiên cứu cũng cho thấy mức độ tương đồng cao giữa phương pháp LAMP và phương pháp chẩn đoán nuôi cấy vi sinh và PCR. LAMP là một phương pháp đầy tiềm năng để phát hiện MRSA, là công cụ chẩn đoán nhanh có tính ứng dụng cao, hỗ trợ điều trị hiệu quả.
To develop a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method for detecting Methicillin - resistant Staphylococcus aureus (MRSA) using the c-haracteristic mecAgene, aimed at rapid MRSA detection in nasal swab samples. Methods: An experimental study was conducted on 60 nasal swab samples f-rom healthy individuals aged 18-25. Specific primers for the LAMP reaction were designed using primer design software. The LAMP reaction conditions were optimized in the laboratory to determine the temperature, specificity, and minimum DNA detection limit (LOD). The optimized LAMP reaction was then tested on 60 DNA extraction samples f-rom nasal swabs, including 30 MRSA-positive and 30 MRSA-negative samples. Results: Specific primers for mecA gene were successfully designed, and the amplification reaction was optimized at 65°C for 30 minutes. The LAMP method demonstrated high sensitiv-ity and specificity, with the lowest detection limit (LOD) of 1 pg of DNA extracted f-rom MRSA per reaction, and no cross-reactivity with other species was observed. When applied to 60 DNA samples extracted f-rom nasal swabs (30 MRSA-positive and 30 MRSA-negative), the LAMP reaction achieved 100% sensitivity, 100% specificity, and a Kappa coefficient of 1, indicating a high degree of agreement compared to traditional microbiological culture and PCR methods. Conclusions: The study successfully applied the LAMP method to detect the presence of MRSA in clinical samples with high sensitivity and specificity using the mecA gene. Furthermore, the study demonstrated a high level of agreement between the LAMP method, microbiological culture, and PCR diagnostics. LAMP is a promising method for MRSA detection, serving as a rapid diagnostic tool with high applicability to support effective treatment.
TTKHCNQG, CVv 417