Nghiên cứu đánh giá hiệu quả sử dụng các loại chỉ thị phân tử trong lập bản đồ gien qui định tính trạng số lượng ở bò

Chỉ số đề mục

68.39.21

Lĩnh vực nghiên cứu

Chăn nuôi

Dạng tài liệu

Tác giả

Mai Duy Minh⁽¹⁾, Goutam Sahana, Benrt Guldbrandtsen, Freddy B.Christiansen

Nhan đề

Nghiên cứu đánh giá hiệu quả sử dụng các loại chỉ thị phân tử trong lập bản đồ gien qui định tính trạng số lượng ở bò

Nhan đề tiếng anh

The effects of individual markers versus marker haplotypes on power and false discovery rate in genome - wide association studies

Nguồn trích

Nông nghiệp & Phát triển nông thôn

Năm xuất bản

2012

Số

20

Trang

60-64

ISSN

1859-4581

Từ khóa

Chỉ thị phân tử, Bản đồ gien, Bò sữa, Tính trạng, Số lượng, Sử dụng, Hiệu quả

Từ khóa tiếng anh

Tóm tắt

Tóm tắt tiếng anh

A comparison of the effects of single nucleotide polymorphism (SNP) marker, overlapping fixed-size haplotype and block constructed on the basis of non-random association of markers by genome-wide association was done. Three datasets each contains five simulated quantitative trait loci (QTL) on SNP map of Bos taurus 29 and 80 replicates were analyzed. The SNP real genotype, real pedigree and simulated phenotypes of 2,531 bulls from Danish Holstein dairy cattle were used. When marker alleles were treated as random effect, the models using individual SNP gave better results than using overlapping fixed-size haplotype or block in terms of power and false discovery rate. The power decreased while the false discovery rate increased as the size of used haplotype or block increased. The results suggest use of individual SNP rather than SNP based haplotype or block in mapping genes causing genetic variation in quantitative traits.

Kí hiệu kho

TTKHCNQG, CVv201

File toàn văn

Xem toàn văn