BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  20,679,102
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Cây công nghiệp và cây thuốc

Hà Bích Hồng(1), Nguyễn Thế Hưởng(2), Vũ Phạm Thảo Vy, Vũ Văn Thông

Xác định một số trình tự adn mã vạch của loài đinh mật (fernandoa brilletii ) tại tỉnh thái nguyên

Research for identification of some dna barcodes of fernandoa brilletii species in thai nguyen province

Khoa học và Công nghệ Lâm nghiệp

2022

4

30-39

1859-3828

ADN mã vạch, Đinh mật, ITS, matK, trnH-psbA.

DNA barcode, Fernandoa brilletii, ITS, matK, trnH-psbA

Đinh mật (Fernandoa brilletii (Dop) Steen) là loài cây đặc hữu và có giá trị kinh tế cao ở Việt Nam. Đây là loài cây đang có nguy cơ tuyệt chủng cao ngoài tự nhiên nhưng đến nay chưa có nghiên cứu đánh giá đầy đủ nhằm bảo tồn và phát triển loài cây này. Do đó, những nghiên cứu phục vụ công tác đánh giá đa dạng di truyền là rất cần thiết để kiến nghị và đưa ra biện pháp bảo tồn nguồn gen đối với loài Đinh mật trên cả nước nói chung và trên địa bàn tỉnh Thái Nguyên nói riêng. Hiện nay, ADN mã vạch đã được sử dụng như những chỉ thị phân tử có độ chính xác cao trong việc định danh loài và đánh giá đa dạng di truyền. Ở thực vật, các trình tự ADN được sử dụng làm mã vạch trong giám định hay phân loại thường là các trình tự nucleotide thuộc hệ gen lục lạp và hệ gen nhân, bao gồm cả vùng mã hóa và vùng không mã hóa. Trong nghiên cứu này, ba chỉ thị ADN mã vạch là matK, trnH-psbA và ITS được sử dụng để nghiên cứu bước đầu về ADN mã vạch cho loài Đinh mật phân bố tại tỉnh Thái Nguyên. Hiệu quả nhân bản bằng PCR và giải trình tự nucleotide của ba chỉ thị ADN mã vạch ở loài Đinh mật đều đạt 100%. Trong đó, trình tự nucleotide của đoạn gen matK và trnH-psbA của tất cả các mẫu Đinh mật tại 5 huyện của tỉnh Thái Nguyên có sự tương đồng tuyệt đối. Trong 848 nucleotide của vùng gen ITS đã xác định được hai vị trí nucleotide sai khác giữa các mẫu Đinh mật nghiên cứu. Các trình tự matK, trnH-psbA và ITS của loài Đinh mật được đăng ký thành công trên Ngân hàng gen Quốc tế (GenBank) với các mã số lần lượt là ON603621, ON603622, ON614190, ON614191. Cở sở dữ liệu về ADN mã vạch thế giới cũng như Ngân hàng gen Quốc tế chưa công bố trình tự ADN mã vạch nào của loài Đinh mật. Do đó, nghiên cứu này là nghiên cứu đầu tiên về xác định các trình tự ADN mã vạch cho loài cây gỗ quý và đặc hữu này, góp phần làm phong phú thêm cơ sở dữ liệu về ADN mã vạch cho hệ thống ADN mã vạch của thực vật.

Fernandoa brilletii (Dop) Steen is an endemic tree species in Vietnam with high economic value, its trunk is used in construction and high-class furniture making due to its beautiful wood grain and good quality. This is a highly endangered plant species in the wild but so far has not been included in the Vietnam Red Book. Therefore, studies for the evaluation of genetic diversity are necessary to propose measures to conserve the genetic resources of F. brilletii species in the whole country in general and in Thai Nguyen province in particular. Currently, barcoded DNA has been used as molecular markers with high accuracy in species identification and genetic diversity assessment. In plants, the DNA sequences used as barcoding in identification or classification are usually the nucleotide sequences of the chloroplast and nuclear genomes, including both coding and non-coding regions. In this study, three barcoded DNA marker matK, trnH-psbA and ITS were used to initially study the barcoded DNA for F. brilletii species distributed in Thai Nguyen province. The cloning efficiency by PCR and nucleotide sequencing of three barcoded DNA markers in F. brilletii species reached 100%. In which, the nucleotide sequences of matK and trnH-psbA gene segments of all F. brilletii samples in 5 districts of Thai Nguyen province have an absolute similarity. Particularly, the nucleotide sequence of the ITS barcode showed the appearance of two variants with two different nucleotide positions between the studied F. brilletii samples.
The matK, trnH-psbA, and ITS sequences of F. brilletii species were successfully registered on the international gene bank (GenBank) with codes ON603621, ON603622, ON614190, ON614191, respectively. The world database of barcoded DNA as well as the international gene bank has not yet published any barcoded DNA sequences of F. brilletii species. Therefore, this study is the first to identify barcoded DNA sequences for this precious and endemic tree species, contributing to enriching the barcode DNA database for the barcoded DNA system of plants.

TTKHCNQG, CVv 421

Xem toàn văn