BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  21,940,277
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Công nghệ gen; nhân dòng vật nuôi;

Nguyễn Văn Giáp, Cao Thị Bích Phượng, Huỳnh Thị Mỹ Lệ, Đặng Hữu Anh, Chu Thị Thanh Hương, Vũ Thị Ngọc, Võ Văn Hiểu, Tạ Thị Kim Chung, Lê Bá Hiệp, Lê Thị Trinh, Trương Quang Lâm(1), Nguyễn Thị Hoa, Lê Thị Luyên

Phân tích trình tự gen mã hóa glycoprotein của Avian Metapneumovirus phát hiện được ở một số cơ sở chăn nuôi gà tại miền Bắc

C-haracterizing Glycoprotein-gene Encoding Sequences of Avian Metapneumovirus Found in Poultry in Northern Vietnam

Khoa học nông nghiệp Việt Nam

2021

5

596-604

2588-1299

Trình tự gen G, Sinh học phân tử, Cơ sở chăn nuôi gà, Glycoprotein

G gene sequence, Molecular Biology, Chicken breeding facilities, Glycoproteins

Avian Metapneumovirus (aMPV) là một trong những căn nguyên gây bệnh hô hấp phức hợp của gà tây và gà mới được phát hiện ở Việt Nam. Do tính mới đó, hiện mới có công bố về mặt lâm sàng, tỷ lệ dương tính huyết thanh học và tỷ lệ phát hiện aMPV ở gà nuôi tại miền Bắc. Nhằm làm rõ hơn về sự lưu hành của aMPV, nghiên cứu này đã giải trình tự gen, sử dụng phương pháp tin sinh học để phân tích đặc điểm di truyền của virus. Dựa vào trình tự phân đoạn gen mã hóa protein G đã xác định 5/5 chủng aMPV thuộc subgroup B. Mặc dù 5/5 chủng aMPV nằm ở nhánh bắt nguồn từ chủng virus vacxin nhưng chúng đều mang đặc điểm biến đổi ở cấp độ nucleotide và amino khác với chủng virus vacxin Nemovac đã và đang lưu hành ở nước ta.

Avian Metapneumovirus (aMPV) is one of the causative agents of respiratory disease complex in turkeys and chickens, which has been recently detected in Vietnam. Due to its novelty, a few published papers are available on preliminary results, describing the clinical disease, sero- and viral- positivity rates. This study aimed at providing more details about the molecular c-haracterizations of the circulating virus by sequenced and then applied bioinformatics for data mining. Based on the sequence of partial attachment glycoprotein coding gene, 5/5 aMPV strains were classified as subgroup B. Though 5/5 strains belonged to the vaccine-derived lineage, all of them had differences at the nucleotide and amino acid levels compared to the attenuated strain of Nemovac vaccine available in Vietnam.

TTKHCNQG, CTv 169

Xem toàn văn
  • [1] Sun S., Chen F., Cao S., Liu J., Lei W, Li G., Song Y., Lu J., Liu C., Qin J. & Li H. (2014), Isolation and c-haracterization of a subtype C Avian Metapneumovirus circulating in Muscovy ducks in China.,Vet Res. 45(1): 74.
  • [2] Sugiyama M., Koimaru H., Shiba M., Ono E., Nagata T. & Ito T. (2006), D-rop of egg production in chickens by experimental infection with an Avian Metapneumovirus strain PLE8T1 derived f-rom swollen head syndrome and the application to evaluate vaccine,,J Vet Med Sci. 68(8): 783-7.
  • [3] Seal B.S. (1998), Matrix protein gene nucleotide and predicted amino acid sequence demonstrate that the first US Avian Pneumovirus isolate is distinct f-rom European strains.,Virus Res. 58(1-2): 45-52.
  • [4] Pommie C., Levadoux S., Sabatier R., Lefranc G. & Lefranc M.P. (2004), IMGT standardized criteria for statistical analysis of immunoglobulin VREGION amino acid properties.,J Mol Recognit. 17(1): 17-32.
  • [5] Owoade A.A., Ducatez M.F., Hubschen J.M., Sausy A., Chen H., Guan Y. & Muller C.P. (2008), Avian Metapneumovirus subtype A in China and subtypes A and B in Nigeria.,Avian Dis. 52(3): 502-6.
  • [6] Naylor C., Shaw K., Britton P. & Cavanagh D. (1997), Appearance of type B Avian Pneumovirus in great Britain.,Avian Pathol. 26(2): 327-38.
  • [7] Motamed Chaboki P., Ghalyanchilangeroudi A., Karimi V., Abdollahi H., Maghsoudloo H., Hosseini H., Khaltababdi Farahahni R., Ghafouri S.A., Falah M.H. & Rezaee H. (2018), Prevalence of Avian Metapneumovirus subtype B in live bird market iný Gilan province, Iran.,Veterinary Research Forum. 9(1): 93-97.
  • [8] Mescolini G., Lupini C., Franzo G., Quaglia, G., Legnardi M., Cecchinato M., Tucciarone C.M., Blanco A., Turblin V., Biarnes M., Tatone F., Falchieri M. & Catelli E. (2020), What is new on molecular c-haracteristics of Avian metapneumovirus strains circulating in Europe?,Transbound Emerg Dis.
  • [9] Mase M., Yamaguchi S., Tsukamoto K., Imada T., Imai K. & Nakamura K. (2003), Presence of avian pneumovirus subtypes A and B in Japan.,Avian Dis.47(2): 481-4.
  • [10] Lupini C., Cecchinato M., Ricchizzi E., Naylor C.J. & Catelli E. (2011), A turkey rhinotracheitis outbreak caused by the environmental spread of a vaccinederived Avian Metapneumovirus.,Avian Pathol. 40(5): 525-30.
  • [11] Lim A.a.S., Abu J., Choo P.Y., Seetha J. & Goh Y.M. (2009), Detection of Avian Metapneumovirus (aMPV) field infection via reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) and ELISA in two layer farms in Johor.,J. Vet. Malaysia. 21(1): 9-13.
  • [12] Lwamba H.C., Bennett R.S., Lauer D.C., Halvorson D.A. & Njenga M.K. (2002), C-haracterization of Avian Metapneumoviruses isolated in the USA.,Anim Health Res Rev. 3(2): 107-17.
  • [13] Lwamba H.C., Alvarez R., Wise M.G., Yu Q., Halvorson D., Njenga M.K. & Seal B.S. (2005), Comparison of the full-length genome sequence of Avian Metapneumovirus subtype C with other paramyxoviruses.,Virus Res. 107(1): 83-92.
  • [14] Kleven S.H. (1998), Mycoplasmas in the etiology of multifactorial respiratory disease.,Poult Sci. 77(8): 1146-9.
  • [15] Juhasz K. & Easton A.J. (1994), Extensive sequence variation in the attachment (G) protein gene of Avian Pneumovirus: evidence for two distinct subgroups.,J Gen Virol. 75(Pt 11): 2873-80
  • [16] Jardine C.M., Parmley E.J., Buchanan T., Nituch L. & Ojkic D. (2018), Avian Metapneumovirus subtype C in Wild Waterfowl in Ontario, Canada.,Transbound Emerg Dis. 65(4): 1098-1102.
  • [17] Hall T. (1999), BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT.,Nucl. Acids. Symp. Ser. 41: 95-98.
  • [18] Gharaibeh S.M. & Algharaibeh G.R. (2007), Serological and molecular detection of avian pneumovirus in chickens with respiratory disease in Jordan.,Poult Sci. 86(8): 1677-81.
  • [19] Fulton R.M. (2014), Respiratory Disease.,In: Backyard Poultry Medicine and Surgery. pp. 137-144.
  • [20] Drummond A.J., Suc-hard M.A., Xie D. & Rambaut A. (2012), Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7.,Mol Biol Evol. 29(8): 1969-73.
  • [21] Cook J.K., Chesher J., Orthel F., Woods M.A., Orbell S.J., Baxendale W. & Huggins M.B. (2000), Avian Pneumovirus infection of laying hens: experimental studies.,Avian Pathol. 29(6): 545-56.
  • [22] Chacon J.L., Mizuma M., Vejarano M.P., Toquin D., Eterradossi N., Patnayak D.P., Goyal S.M. & Ferreira A.J. (2011), Avian Metapneumovirus subtypes circulating in Brazilian vaccinated and nonvaccinated chicken and turkey farms.,Avian Dis. 55(1): 82-9.
  • [23] Cecchinato M., Lupini C., Ricchizzi E., Falchieri M., Meini A., Jones R.C. & Catelli E. (2012), Italian field survey reveals a high diffusion of Avian Metapneumovirus subtype B in layers and weaknesses in the vaccination strategy applied,Avian Dis, 56(4): 720-4.
  • [24] Cecchinato M., Catelli E., Lupini C., Ricchizzi E., Clubbe J., Battilani M. & Naylor C.J. (2010), Avian Metapneumovirus (AMPV) attachment protein involvement in probable virus evolution concurrent with mass live vaccine introduction.,Vet Microbiol. 146(1-2): 24-34.
  • [25] Catelli E., Lupini C., Cecchinato M., Ricchizzi E., Brown P. & Naylor C.J. (2010), Field Avian Metapneumovirus evolution avoiding vaccine induced immunity.,Vaccine. 28(4): 916-21.
  • [26] Catelli E., Cecchinato M., Savage C.E., Jones R.C. & Naylor C.J. (2006), Demonstration of loss of attenuation and extended field persistence of a live Avian Metapneumovirus vaccine.,Vaccine. 24(42-43): 6476-82
  • [27] Cao Thị Bích Phượng, Lê Bá Hiệp, Huỳnh Thị Mỹ Lệ & Nguyễn Văn Giáp (2020), Nghiên cứu sự lưu hành của Avian Metapneumovirus (aMPV) ở gà nuôi tại một số tỉnh miền Bắc Việt Nam.,Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam. 18(7): 520-528.
  • [28] Brown P.A., Lemaitre E., Briand F.X., Courtillon C., Guionie O., Allee C., Toquin D., Bayon-Auboyer M.H., Jestin V. & Eterradossi N. (2014), Molecular comparisons of full length metapneumovirus (MPV) genomes, including newly determined French AMPV-C and -D isolates, further supports possible subclassification within the MPV Genus.,PLoS One. 9(7): e102740.
  • [29] Brown P.A., Allee C., Courtillon C., Szerman N., Lemaitre E., Toquin D., Mangart J.M., Amelot M. & Eterradossi N. (2019), Host specificity of Avian metapneumoviruses.,Avian Pathol. 48(4): 311-318.
  • [30] Bayon-Auboyer M.H., Jestin V., Toquin D., Cherbonnel M. & Eterradossi N (1999), Comparison of F-, Gand N-based RT-PCR protocols with conventional virological procedures for the detection and typing of turkey rhinotracheitis virus.,Arch Virol. 144(6): 1091-109.
  • [31] Bayon-Auboyer M.H., Arnauld C., Toquin D. & Eterradossi N. (2000), Nucleotide sequences of the F, L and G protein genes of two non-A/non-B Avian Pneumoviruses (APV) reveal a novel APV subgroup.,J Gen Virol. 81(Pt 11): 2723-33
  • [32] Bayraktar E., Umar S., Yilmaz A., Turan N., Franzo G., Tucciarone C.M., Cecchinato M., Cakan B., Iqbal M. & Yilmaz H. (2018), First Molecular C-haracterization of Avian Metapneumovirus (aMPV) in Turkish Broiler Flocks.,Avian Dis. 62(4): 425-430.
  • [33] Aung Y.H., Liman M., Neumann U. & Rautenschlein S. (2008), Reproducibility of swollen sinuses in broilers by experimental infection with Avian Metapneumovirus subtypes A and B of turkey origin and their comparative pathogenesis.,Avian Pathol. 37(1): 65-74.