BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN QUỐC GIA VỀ KHOA HỌC, CÔNG NGHỆ VÀ ĐỔI MỚI SÁNG TẠO

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  30,060,625
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

69

Di truyền học và nhân giống thuỷ sản

BB

Quách Văn Cao Thi(1), Trần Quốc Dũng, Từ Thanh Dung

Đa dạng di truyền các chủng vi khuẩn Aeromonas hyd-rophila phân lập từ cá tra bệnh xuất huyết ở đồng bằng sông Cửu Long

Genetic diversity on Aeromonas hyd-rophila isolated f-rom hemorrhagic striped catfish in the Mekong delta

Tạp chí Khoa học và Công nghệ - Đại học Thái Nguyên

2023

05

11-18

1859-2171

Gene aerolysin, Aeromonas hyd-rophila, Cá tra, Đa dạng di truyền, Đồng bằng sông Cửu Long

Nghiên cứu được thực hiện nhằm đánh giá sự đa dạng di truyền của các chủng vi khuẩn Aeromonas hyd-rophila phân lập từ cá tra nuôi thâm canh ở Đồng bằng sông Cửu Long (ĐBSCL). Tổng số 26 chủng vi khuẩn được phân lập từ cá tra mắc bệnh xuất huyết. Tất cả các chủng vi khuẩn phân lập được định danh là A. hyd-rophila dựa trên kết quả quan sát các đặc điểm hình thái, kết hợp kiểm tra sinh hóa bằng bộ kít API 20E và kỹ thuật sinh học phân tử. Mười hai chủng A. hyd-rophila được chọn làm đại diện để giải trình tự đoạn gen aerolysin. Kết quả cho thấy, các chủng vi khuẩn phân lập đều có độ tương đồng cao từ 96,64 - 100% so với các chủng vi khuẩn A. hyd-rophila đã được công bố trên ngân hàng gen. Ngoài ra, kết quả giải trình tự các chủng vi khuẩn này còn được dùng để phân tích sự đa dạng di truyền. Kết quả cho thấy, các chủng vi khuẩn ở Tiền Giang và Trà Vinh có mối quan hệ di truyền gần gũi với nhau nhưng hình thành nhóm riêng với các chủng phân bố ở các tỉnh An Giang, Bến Tre, Đồng Tháp và Vĩnh Long. Nghiên cứu đã tìm thấy sự khác biệt di truyền giữa các chủng vi khuẩn A. hyd-rophila ở hai nhóm đại diện cho vùng sinh thái nước lợ và nước ngọt ở ĐBSCL.

This study was conducted to evaluate the genetic diversity of Aeromonas hyd-rophila isolates collected f-rom striped catfish intensively farmed in the Mekong Delta. A total of 26 bacterial isolates were obtained f-rom hemorrhagic disease-infected fish. All bacterial isolates were identified as A. hyd-rophila based on their morphological c-haracterization, API 20E kit, and molecular biology technique. Twelve strains were se-lected as representatives for sequencing the aerolysin gene; these strains had high identities (96.64 – 100%) compared with reference strains of A. hyd-rophila on Genbank. Besides, these strains were used for analyzing genetic diversity. The results indicated that the isolates f-rom Tien Giang and Tra Vinh had a close relationship and shared distant similarities with the strains f-rom An Giang, Ben Tre, Dong Thap, and Vinh Long provinces. The study has found genetic differences between A. hyd-rophila isolates in two main groups representing two ecologically different areas of brackish and fresh water in the Mekong Delta.

TTKHCNQG, CTv 178

Xem toàn văn
  • [1] M. Kupfer; P. Kuhnert; B. M. Korczak; R. Peduzzi; A. Demarta (2006), Genetic relationships of Aeromonas strains inferred from 16S rRNA, gyrB and rpoB gene sequences,International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
  • [2] K. Y. Leung; L. S. Wong; K. W. Low; Y. M. Sin (1997), Mini-Tn5 induced growth- and protease-deficient mutants of Aeromonas hydrophila as live vaccines for blue gourami (Trichogaster trichopterus),Aquaculture
  • [3] A. C. Camus; R. M. Durborow; W. G. Hemstreet; R. L. Thune; J. P. Hawke (1998), Aeromonas Bacterial Infections: Motile Aeromonad Septicemia (No. 478),Southern Regional Aquaculture Center
  • [4] M. R. Chacón; M. J. Figueras; G. Castro-Escarpulli; L. Soler; J. Guarro (2003), Distribution of virulence genes in clinical and environmental isolates of Aeromonas spp.,Antonie Van Leeuwenhoek
  • [5] M. A. Yánẽz; V. Catalán; D. Apráiz; M. J. Figueras; A. J. Martínez-Murcia (2003), Phylogenetic analysis of members of the genus Aeromonas based on gyrB gene sequences,International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
  • [6] B. K. Das; S. K. Samal; B. Samantray; P. K. Meher (2005), Protein fingerprinting profiles in different strains of Aeromonas hydrophila isolated from fresh water fish,World Journal of Microbiology and Biotechnology
  • [7] G. H. Nguyen; N. Q. Tran; T. H. Le; O. T. H. Duong (2009), Research and application of PCR procedure to diagnose Aeromonas hydrophila on the kidney of catfish (Pangasianodon hypophthalmus),National Aquaculture Conference
  • [8] D. Umesha; R. P. Srinivasa; K. P. Prasad; A. K. Reddy; K. N. Srinivas (2011), Aerolysin and Hemolysin Virulence Genes of Aeromonas hydrophila Isolated from Diseased Ornamental Freshwater Oscarfish and Goldfish by Polymerase Chain Reaction,International Journal of Advanced Science and Technology
  • [9] V. Singh; G. Rathore; D. Kapoor; B. N. Mishra; W. S. Lakra (2008), Detection of aerolysin gene in Aeromonas hydrophila isolated from fish and pond water,Indian Journal of Microbiology
  • [10] A. H. Yousr; S. Napis; G. R. A. Rusul; R. Son (2007), Detection of Aerolysin and Hemolysin Genes in Aeromonas spp. Isolated from Environmental and Shellfish Sources by Polymerase Chain Reaction,ASEAN Food Journal
  • [11] J. W. Pridgeon; P. H. Klesius (2011), Molecular identification and virulence of three Aeromonas hydrophila isolates cultured from infected channel catfish during a disease outbreak in west Alabama (USA) in 2009,Diseases of Aquatic Organisms
  • [12] M. Crumlish; T. C. Phan; J. Koesling; T. T. Vu; K. Gravnigene (2010), Experimental challenge studies in Vietnamese catfish, Pangasianodon hypophthalmus (Sauvage), exposed to Edwardsiella ictaluri and Aeromonas hydrophila,Journal of Fish Diseases
  • [13] K. Tamura; G. Stecher; D. Peterson; A. Filipski; S. Kumar (2013), MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (Version 6.0),Molecular Biology and Evolution
  • [14] N. Saitou; M. Nei (1987), The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees,Molecular Biology and Evolution
  • [15] J. D. Thompson; T. J. Gibson; F. Plewniak; F. Jeanmougin; D. G. Higgins (1997), The CLUSTAL_X windows interface: Flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools,Nucleic Acids Research
  • [16] V. S. Panangala; C. A. Shoemaker; V. L. Van Santen; K. Dybvig; P. H. Klesius (2007), Multiplex-PCR for simultaneous detection of 3 bacterial fish pathogens, Flavobacterium columnare, Edwardsiella ictaluri, and Aeromonas hydrophila,Diseases of Aquatic Organisms
  • [17] D. R. P. Pollard; W. M. Jonhson; H. Lior; S. D. Tyler; K. R. Rozee (1990), Detection of the Aerolysin Gene in Aeromonas hydrophila by the Polymerase Chain Reaction,Journal of Clinical Microbiology
  • [18] K. Bartie; O. T. H. Duong; G. Huys; C. Dickson; M. Cnockaert; J. Swings; P. T. Nguyen; A. Teale (2006), Application of REP-PCR and PFGE for typing chloramphenicol-resistant bacteria isolated at aquaculture farms in the Mekong Delta,Journal of Biotechnology
  • [19] G. I. Barrow; R. K. A. Feltham (1993), Cowan and Steel‘s manual for the identification of medical bacteria (3rd edn.),Cambridge University Press
  • [20] N. B. Buller (2014), Bacteria and fungi from fish and other aquatic animals: a practical identification manual,CABI Publishing
  • [21] G. N. Frerichs; S. D. Millar (1993), Manual for the isolation and identification of fish bacterial pathogens,Institute of Aquaculture, University of Stirling
  • [22] D. N. Tran; D. N. Tran; D. M. T. Bui; K. T. Duong (2013), Survey of lactic acid bacteria biodiversity from batch rice in three ecological regions of the Mekong Delta,Journal of Science Can Tho University
  • [23] S. Khashe; W. Hill; J. M. Janda (1996), Characterization of Aeromonas hydrophila strains of clinical, animal and environmental origin expressing the O:34 antigen,Current Microbiology
  • [24] W. P. Julia; H. K. Phillip (2011), Development and efficacy of novobiocin and rifampicin-resistant Aeromonas hydrophila as novel vaccines in channel catfish and Nile tilapia,Vaccine
  • [25] M. Nawaz; A. A. Khan; S. Khan; K. Sung; R. Steele (2008), Isolation and characterization of tetracycline-resistant Citrobacter spp. from catfish,Food Microbiology
  • [26] S. Sarter; H. N. K. Nguyen; H. T. Lam; J. Lazard; D. Montet (2007), Antibiotic resistance in Gram-negative bacteria isolated from framed catfish,Food Control
  • [27] O. T. H. Duong (2012), Isolation and determination of the hemorrhagic disease in rice eel (Monopterus albus) of Aeromonas hydrophila,Scientific Journal of Can Tho University
  • [28] H. T. M. Tran (2013), Study on the causative agent of haemorrhagic disease in sardines (Chitala chitala Hamilton, 1822),4th National Young Scientific Conference of Fisheries Industry
  • [29] T. P. Nguyen; H. V. Nguyen; T. M. Bui; L. T. Phan; V. M. Son; L. N. Nguyen; T. T. T. Nguyen; G. J. Gooley; B. A. Ingram; S. S. De Silva (2011), Better management practices for striped catfish (tra) farming in the Mekong Delta (version 3.0),Network of Aquaculture Centres in Asia-Pacific
  • [30] L. T. T. Ly; D. N. Nguyen; P. H. Vo; C. V. Doan (2009), Hemorrhage Disease of Cultured Tra Catfish (Pangasianodon hypophthalmus) in Mekong Delta,The Israeli Journal of Aquaculture - Bamidgeh