Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  24,639,962
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

62

Cây rau, cây hoa và cây ăn quả

BB

Đặc điểm hình thái và trình tự một số gen phân loại của lan hài cảnh (Paphiopedilum canhii) thu thập tại Lào

Morphological and sequence c-haracteristic of some taxonomic genes of Paphiopedilum canhii f-rom Laos

Tạp chí Khoa học và Công nghệ - Đại học Thái Nguyên

2023

01

135-143

1859-2171

Paphiopedilum là một chi nổi bật của nhóm lan Hài, đây là một chi nhỏ nhưng có hệ thống phân loại phức tạp với nhiều quan điểm khác nhau. Paphiopedilum canhii phát hiện năm 2010 và được coi là loài đặc hữu của Việt Nam. Các nghiên cứu về loài Paphiopedilum canhii cho thấy vị trí phân loại rất riêng biệt của chúng. Để phân loại chính xác loài này, người ta đã phải sử dụng nhiều tiêu chí kết hợp. Hiện nay, ngoài phương pháp phân loại truyền thống bằng hình thái, thì phương pháp phân loại bằng chỉ thị phân tử đã phát triển và thể hiện nhiều ưu điểm khi sử dụng cho các nghiên cứu phân loại học. Bài báo này trình bày kết quả phân tích hình thái thực vật của lan Hài Cảnh thu thập tại Lào; đồng thời xác định và phân tích 5 trình tự gen phân loại matK, rbcL, rpoC1, ITS và trnH-psbA. Kết quả phân tích cho thấy, hai chỉ thị ITS và trnH-psbA phù hợp khi nghiên cứu phân loại lan Hài, cây phân loại của chúng phản ánh rõ mối quan hệ họ hàng của các loài trong các tổ, phân chi đúng với hệ thống phân loại bằng hình thái. Ba chỉ thị matK, rbcL, rpoC1 cho kết quả phân nhóm pha trộn giữa các tổ và phân chi.

Paphiopedilum is a genus outstanding of Venus orchid. This is a small genus but has a complex taxonomy with many different views. Species Paphiopedilum canhii was discovered in 2010 and considered as a endemic species to Vietnam. Studies of the species Paphiopedilum canhii reveal their very distinct taxonomic position. To improve classification of this species, a combination of criteria had to be used. Currently, in addition to the traditional method of classification by morphology, the birth of DNA barcode has greatly supported taxonomic studies. This study presents the results of plant morphology analysis of Paphiopedilum canhii samples which were collected in Laos. Simultaneously identify and analyze 5 taxonomic gene sequences matK, rbcL, rpoC1, ITS and trnH-psbA. The results of analysis of gene sequences and taxa showed that ITS and trnH-psbA are suitable indicators when studying on the taxonomy of Paphiopedilum. The branches of the taxonomic tree clearly reflect the relationship of relatives and species. They are grouped in accordance with the sections, subgenus compared with the published taxonomic classification by the morphological of previous studies. Three indicators such as matK, rbcL, rpoC1 for mixed grouping results between sections and subgenus.

TTKHCNQG, CTv 178

  • [1] T. H. Y. Nguyen, X. Q. Ngo, D. T. Nguyen, T. P. Do (2021), Morphologycal characteristic and DNA trnH-psbA gene sequence in the taxonomy of P. hirsutissimun,TNU Journal of Science and Technology
  • [2] T. H. Y. Nguyen, X. Q. Ngo, D. T. Nguyen, T. P. Do, H. M. Chu (2022), A study on the coretation between DNA markers and morphology characteristics for identification of Paphiopedilum helenae Aver. of Viet Nam,TNU Journal of Science and Technology
  • [3] H. T. Vu, Q. L. Vu, T. D. Nguyen, N. Tran, T. C. Nguyen, P. N. Luu, D. D. Tran, T. K. Nguyen, L. Le (2020), Genetic Diversity and Identification of Vietnamese Paphiopedilum Species Using DNA Sequences,Biology
  • [4] H. T. Khuat, D. K. Tran, H. H. Le, D. D. Tran, K. Tran (2013), Molecular Phylogeny of the Endangered Vietnamese Paphiopedilum Species Based on the Internal Transcribed Spacer of the Nuclear Ribosomal DNA,Advanced Studies in Biology
  • [5] I. Parveen, H. K. Singh, S. Malik, S. Raghuvanshi, S. B. Babbar (2012), DNA barcoding of endangered Indian Paphiopedilum species,Molecular Ecology Resources
  • [6] F. C. Ginibun, M. R. M. Saad, T. L. Hong, R. Y. Othman, N. Khalid, S. Bhassu (2010), Chloroplast DNA Barcoding of Spathoglottis Species for Genetic Conservation,Acta Horticulturae
  • [7] G. S. W. Khew, T. F. Chia (2011), Parentage determination of Vanda Miss Joaquim (Orchidaceae) through two chloroplast genes rbcL and matK,AoB Plants
  • [8] J. S. Kim, H. T. Kim, S. W. Son, J. H. Kim (2015), Molecular identification of endangered Korean lady’s slipper orchids (Cypripedium, Orchidaceae) and related taxa,Botany
  • [9] P. Siripiyasing, K. Kaenratana, P. Mokkamul, T. Tanee, R. Sudmoon, A. Chaveerach (2012), DNA barcoding of the Cymbidium species (Orchidaceae) in Thailand,African Journal of Agricultural Research
  • [10] A. L. Dian, G. Perwitasari, S. Rohimah, T. Ratnasari, B. Sugiharto, M. Su’udi (2020), DNA Barcoding of Medicinal Orchid Dendrobium discolor Lindl. Tanimbar Using rbcL and ITS genes,Buletin Penelitian Tanaman Rempah dan Obat
  • [11] K. Tamura, M. Nei (1993), Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees,Molecular Biology and Evolution
  • [12] G. G. Collins, R. H. Symons (1992), Extraction of nuclear DNA from grape vine leaves by modified procedure,Plant Molecular Biology Reporter
  • [13] H. T. Vu, A. K. Tran, Q. L. Vu, L. Le, C. H. Pham, H. D. Tran (2019), Genetic characteristics of the endemic orchid species Paphiopedilum delenatii in Vietnam,Viet Nam Journal of Science and Technology
  • [14] P. M. Hollingsworth, L. L. Forrest, J. L. Spouge (2009), A DNA barcode for land plants,Proceedings of the National Academy of Sciences USA
  • [15] M. Bolson, E. Smidt, C. de, M. L. Brotto, V. Silva-Pereira (2015), ITS and trnH-psbA as efficient DNA Barcodes to identify threatened commercial woody angiosperms from southern Brazilian Atlantic rainforests,PLOS ONE
  • [16] M. Gorniak, D. L. Szlachetko, A. K. Kowalkowska, J. Bohdanowicz, X. C. Chu (2014), Taxonomic placement of Paphiopedilum canhii (Cypripedioideae; Orchidaceae) based on cytological, molecular and micromorphological evidence,Molecular Phylogenetics and Evolution
  • [17] G. J. Braem, O. Gruss (2011), Paphiopedilum megastaminodum G.J. Braem & O. Gruss. A new Subgenus to Accommodate Paphiopedilum canhii,Orchid Digest
  • [18] L. Averyanov (2013), New and rare orchids (Orchidaceae) in the flora of Cambodia and Lao PDR,Turczaninovia
  • [19] L. Averyanov, K. L. Phan, T. H. Nguyen, X. C. Chu, T. V. Nguyen (2011), Assessment of Current Natural Status of Critically Endangered Species - Paphiopedlum canhii for its Conservation,Unpublished report for The Rufford Small Grant Foundation & Chicago Zoological Society
  • [20] L. Averyanov, V. T. Pham, K. L. Phan, T. H. Nguyen, X. C. Chu, T. V. Nguyen, Q. H. Nguyen (2011), Paphiopedilum canhii – from Discovery to Extinction,Orchid Planet
  • [21] G. J. Braem, G. R. Gruss (2011), Paphiopedilum subgenus Megastaminodium Braem & Gruss, a new subgenus to accommodate Paphiopedilum canhii,Orchid Digest
  • [22] L. Averyanov (2010), The Orchids of Vietnam, Illustrated survey. Part 2. Subfamily Orchidoideae,Turczaninowia
  • [23] L. Averyanov, P. Cribb, K. L. Phan, T. H. Nguyen (2004), Slipper Orchids of Vietnam,BirdLife, Royal Botanic Gardens KEW, World Bank
  • [24] L. Averyanov, C. Phillip, K. L. Phan, T. H. Nguyen (2003), Slipper Orchids of Vietnam. With an Introduction to the Flora of Vietnam,Royal Botanic Gardens, Kew