BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  26,791,440
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Kỹ thuận chẩn đoán bệnh

Nguyễn Trọng Hiếu, Phan Thanh Hải, Pham Thị Thu Thủy, Jasmine Thanh Xuân, Nguyễn Văn Chủ(1), Trần Thị Thanh Hương, Nguyễn Hữu Thịnh, Trần Đức Huy, Nguyễn Duy Sinh, Nguyễn Văn Thiện Chí, Lương Bắc An, Cao Văn Thịnh, Huỳnh Quang Huy

Xây dựng quy trình sinh thiết lỏng SPOT-MAS phát hiện nhiều loại ung thư từ giai đoạn sớm

Development of SPOT-MAS liquid biopsy for earlier multi-cancer detection

Tạp chí Y học Việt Nam (Tổng hội Y học Việt Nam)

2022

1

176-180

1859-1868

Sinh thiết lỏng, ctDNA, Methyl hóa, Phát hiện sớm ung thư

Liquid biopsy, ctDNA, Early cancer detection

Trong nghiên cứu này chúng tôi phát triển một qui trình sinh thiết lỏng phát hiện ung thư giai đoạn sớm gọi là SPOT-MAS. Phương pháp: Qui trình SPOT-MAS được xây dựng dựa trên công nghệ giải trình tự thế hệ mới để phát hiện đồng thời 4 biến đổi đặc trưng của ADN khối u được phóng thích vào máu ngoại vi (gọi là circulation tumor DNA, ctDNA) bao gồm i) sự biến đổi hyper-methylation trên 450 vùng, ii) biến đổi hypo-methylation trên toàn bộ gen, iii) kích thước đặc trưng của ctDNA và iv) biến đổi số lượng bản sao và cấu trúc NST. Sự kết hợp 4 đặc tính này và mô hình máy học đã giúp gia tăng khả năng phát hiện ung thư từ giai đoạn sớm và cho phép phát hiện đồng thời 4 loại ung thư gan, phổi, vú và đại-trực tràng. Qui trình SPOT-MAS được phát triển với mẫu máu được thu nhận từ 285 bệnh nhân mắc ung thư giai đoạn I-IIIa và 222 người khoẻ mạnh. Kết quả: Độ nhạy của qui trình SPOT-MAS đạt 73,9% (95%CI: 73,2-74,6), độ đặc hiệu đạt 95,9% (95%CI: 95,8-96), giá trị tiên đoán dương là 95,4% (95%CI: 95,2-95,3) và giá trị tiên đoán âm là 75,7% (95%CI: 74,7-76). Kết luận: Phương pháp SPOT-MAS phân tích đồng thời 4 biến đổi đặc trưng của ctDNA, vì vậy giúp tăng độ chính xác trong phát hiện sớm ung thư và cho phép phát hiện đồng thời 4 loại ung thư phổ biến nhất chỉ trong một lần phân tích.

In this study, we developed a liquid biopsy assay for early multi-cancer detection, known as SPOT-MAS. Method: The SPOT-MAS uniquely combined four features of ctDNA (DNA released from tumor into the bloodstream) including 450 targeted hypermethylation regions, genome-wide hypomethylation, length profile of ctDNA and genome-wide copy number variation and advanced machine learning engine to increase the chance of detecting rare ctDNA in earlier cancer. This combinatorial analysis allows to detect multi-cancer in a single test. The blood samples were collected from 285 cancer patients and 222 healthy subjects. Results: The sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value of SPOT-MAS test were 95,9% (95%CI: 95,8-96), 95,4% (95%CI: 95,2-95,3) and 75,7% (95%CI: 74,7-76), respectively. Conclusion: The SPOT-MAS showed excellent performance in detecting earlier multi-cancer from a simple blood draw.

TTKHCNQG, CVv 46

Xem toàn văn
  • [1] Van Thuan T, Anh PT, Van Tu D (2016), Cancer control in Vietnam: whe-re are we now,Cancer Control 99:
  • [2] Torre LA, Siegel RL, Jemal A (2016), Lung cancer statistics,Lung Cancer Pers Med 1–19
  • [3] Siegel RL, Miller KD, Fuchs HE, Jemal A (2021), Cancer statistics, 2021. CA Cancer J Clin 71:7–33,
  • [4] Liu MC (2021), Transforming the landscape of early cancer detection using blood tests— Commentary on current methodologies and future prospects,Br J Cancer 124:1475–1477
  • [5] Hubbell E, Clarke CA, Aravanis AM, Berg CD (2021), Modeled Reductions in Late-stage Cancer with a Multi-Cancer Early Detection Test,Cancer Epidemiol Prev Biomark 30:460–468
  • [6] Đỗ Đình Công (2009), Các yếu tố ảnh hưởng đến chẩn đoán ung thư đại trực tràng,Y Học TPHCM 13:22–25
  • [7] Cristiano S, Leal A, Phallen J, Fiksel J, Adleff V, Bruhm DC, Jensen SØ, Medina JE, Hruban C, White JR, Palsgrove DN, Niknafs N, Anagnostou V, Forde P, Naidoo J, Marrone K, Brahmer J, Woodward BD, Husain H, van Rooijen KL (2019), Genome-wide cell-free DNA fragmentation in patients with cancer,Nature 570:385–389
  • [8] Cohen JD, Li L, Wang Y, Thoburn C, Afsari B, Danilova L, Douville C, Javed AA, Wong F, Mattox A (2018), Detection and localization of surgically resectable cancers with a multi-analyte blood test,Science 359:926–930
  • [9] Chen X, Gole J, Gore A, He Q, Lu M, Min J, Yuan Z, Yang X, Jiang Y, Zhang T, Suo C, Li X, Cheng L, Zhang Z, Niu H, Li Z, Xie Z, Shi H, Zhang X, Fan M, Wang X, Yang Y, Dang J, McConnell C, Zhang J, Wang J, Yu S, Ye W, Gao Y, Zhang K, Liu R, Jin L (2020), Noninvasive early detection of cancer four years before conventional diagnosis using a blood test,Nat Commun 11:3475