Ảnh hưởng của đột biến điểm G/T tại đầu 5’ intron 1 gen Waxy đến hàm lượng amylose và độ bền gel ở một số mẫu giống lúa Việt Nam

Chỉ số đề mục

Lĩnh vực nghiên cứu

Công nghệ gen; nhân dòng vật nuôi;

Dạng tài liệu

Tác giả

Nguyễn Quốc Trung, Lưu Thị Vân, Nguyễn Chính Việt, Tống Văn Hải⁽¹⁾

Nhan đề

Ảnh hưởng của đột biến điểm G/T tại đầu 5’ intron 1 gen Waxy đến hàm lượng amylose và độ bền gel ở một số mẫu giống lúa Việt Nam

Nhan đề tiếng anh

Nguồn trích

Khoa học nông nghiệp Việt Nam

Năm xuất bản

2021

Số

03

Trang

339-346

ISSN

2588-1299

Từ khóa

Gen Waxy, Amylose, Độ bền gel, Chỉ thị CAPS, Đa hình nucleotide đơn, Lúa

Từ khóa tiếng anh

Tóm tắt

Chất lượng nấu nướng và ăn uống của gạo bao gồm hàm lượng amylose (AC) và độ gền gel (GC) là các tiêu chí quan trọng quyết định giá thành gạo xuất khẩu của Việt Nam. Các đặc tính này chủ yếu phụ thuộc vào thành phần amylose trong nội nhũ hạt gạo và do gen Waxy quy định. Mục đích của nghiên cứu này là xác định ảnh hưởng của đột biến điểm G/T ở gen Waxy với AC và GT ở một số mẫu giống lúa của Việt Nam. Nghiên cứu tiến hành đánh giá trên 64 mẫu giống lúa thu; kết quả phân tích được 26 mẫu giống có AC cao, 5 mẫu giống có AC trung bình; 20 mẫu giống có AC thấp; 2 mẫu giống có AC rất thấp và 11 mẫu giống có AC xếp vào nhóm lúa nếp. Kết quả đánh giá GC cũng phân loại mẫu giống gồm 25 mẫu giống rất cứng; 1 mẫu giống cứng; 13 mẫu giống trung bình; 11 mẫu giống mềm và 14 mẫu giống rất mềm. Phân tích sử dụng chỉ thị CAPS (Cleaved amplified polymorphic sequence) đã phát hiện 31 mẫu giống mang SNP loại G tương ứng với alen Wxa và 33 mẫu giống mang SNP loại T tương ứng với alen Wxb. So sánh kết quả xác định kiểu gen và kiểu hình cho thấy chỉ thị PCR-AccI xác định alen Wxb của gen Waxy có độ chính xác cao cần ứng dụng trong công tác chọn tạo giống lúa có hàm lượng amylose trung bình chất lượng cao.

Tóm tắt tiếng anh

Kí hiệu kho

TTKHCNQG, CTv 169

File toàn văn

Xem toàn văn

Tài liệu tham khảo

[1] Wang Z.Y., Wu Z.L., Xing Y.Y., Zheng F.G., Guo X.L., Zhang W.G. & Hong M.M. (1990), Nucleotide sequence of rice waxy gene.,Nucleic Acids Res. 18(19): 5898.
[2] Tran N.A., Daygon V.D., Resurreccion A.P., Cuevas RP., Corpuz H.M. & Fitzgerald M.A. (2011), A single nucleotide polymorphism in the WaxyWaxy gene explainsa significant component of gel consistency.,Theoretical and Applied Genetics Theor Appl Genet. 123: 519-525
[3] Seko H. (2003), An introduction manual for determination of apparent amylose content of rice grain in the rice breeding program, Faculty of Agronomy,,
[4] Mikami I., Uwatoko N., Ikeda Y., Yamaguchi J., Hirano H., Suzuki Y., Sano Y. (2008), Allelic diversification at the wx locus in landraces of Asian rice.,Theoretical and Applied Genetics Theor Appl Genet. 116: 979-989
[5] Liu QQ., Li QF., Cai XL., Wang HM., Tang SZ., Yu HX., Wang ZY. & Gu M.H. (2006), Molecular marker-assisted se-lection for improved cooking and eating quality of two elite parents of hybrid rice.,Crop Sci. 46: 2354-2360
[6] Khush GS., Brar D.S. & Hardy B. (2003), Advances in Rice Genetic. IRRI.,
[7] Juliano B. (2007), Rice Chemistry and Quality.,Muñoz, Nueva Ecija, Philippines: Philippine Rice Research Institute.
[8] Isshiki M., Morino K., Nakajima M., Okagaki RJ., Wessler SR, Izawa T. & Shimamoto K. (1998), A naturally occurring functional allele of the rice waxy locus has a GT to TT mutation at the 50 splice site of the first intron.,Plant Journal 15: 133- 138
[9] International Rice Research Institute (1988), International Rice Testing Program: Standard Evaluation System for Rice, 3rd ed., P.O. Box 933, Manila, Philippines.,
[10] Hirano H.Y., Eiguchi M. & Sano Y. (1998), A single base change al-tered the regulation of the waxy gene at the posttranscriptional level during the domestication of rice.,Mol. Biol. Evol. 15(8): 978- 987.
[11] Doyle JJ. and Doyle JL (1990), Isolation of plant DNA f-rom fresh tissue. Focus. 12: 13-15.,
[12] Chen MH., Bergman CJ., Pinson SRM. & Fjellstrom R. (2008), WaxyWaxy gene haplotypes: associations with pasting properties in an international rice germplasm collection.,J Cereal Sci. 48:781-788
[13] Cai X.L., Wang Z.Y., Xing Y.Y., Zhang J.L. & Hong MM. (1998), Aberrant splicing of intron 1 leads to the heterogeneous 50 UTR and decreased expression of waxy gene in rice cultivars of intermediate amylose content.,Plant Journal 14: 459-465
[14] Cai X.L., Liu Q.Q., Tang S.Z., Gu M.H. & Wang Z.Y. (2002), Development of a molecular marker for screening the rice cultivars with intermediate amylose content in Oryza sativa subsp.,indica. J. Plant Physiol. Mol. Biol. 28: 137-144