So sánh và đánh giá quy trình Multiplex PCR trong phát hiện Candida spp. từ mẫu bệnh phẩm

Chỉ số đề mục

76

Lĩnh vực nghiên cứu

Kỹ thuật và thiết bị y học

Dạng tài liệu

Tác giả

Nguyễn Tú Anh⁽²⁾, Nguyễn Minh Thái⁽¹⁾, Lê Thị Thanh Thảo, Phan Cảnh Trình, Nguyễn Thị Ngọc Yến, Nguyễn Hiếu, Trần Quốc Việt, Tôn Hoàng Diệu

Nhan đề

So sánh và đánh giá quy trình Multiplex PCR trong phát hiện Candida spp. từ mẫu bệnh phẩm

Nhan đề tiếng anh

Comparison and evaluation of Multiplex PCR technique process of the identification Candida spp. from patient samples

Nguồn trích

Tạp chí Y học Việt Nam (Tổng hội Y học Việt Nam)

Năm xuất bản

2023

Số

1

Trang

77-82

ISSN

1859-1868

Từ khóa

Multiplex PCR, Mẫu bệnh phẩm, So sánh, Đánh giá, Quy trình

Từ khóa tiếng anh

Multiplex PCR, Candida, Patient samples, Comparison, Evaluation, Process

Tóm tắt

Nghiên cứu này thực hiện với 2 mục tiêu: Phát hiện 4 loài C. albicans, C. glabrata, C. tropicalis và C. parapsilosis bằng kỹ thuật multiplex PCR và bằng phương pháp truyền thống và so sánh và đánh giá quy trình phát hiện 4 loài Candida từ mẫu bệnh phẩm bằng kỹ thuật multiplex PCR. Phương pháp: Mẫu Candida spp. được thu nhận tại 3 bệnh viện tại TP. HCM từ tháng 10/2020 đến tháng 5/2021. Vi nấm được định danh 3 bằng phương pháp: (1) thử nghiệm tạo ống mầm, (2) phân lập trên môi trường CHROMagar Candida và (3) kỹ thuật multiplex PCR. Sau đó, so sánh và đánh giá quy trình phát hiện 4 loài Candida giữa kỹ thuật multiplex PCR và phương pháp phát hiện kiểu hình trên CHROMagar Candida, dựa trên độ nhạy, độ đặc hiệu, giá trị tiên đoán dương, giá trị tiên đoán âm, độ lập lại và độ chính xác. Kết quả: Kết quả phân lập trên môi trườngCHROMagar Candida cho thấy 186 chủng phân lập được với tỷ lệ nhiễm cao nhất là C. albicans 112/186 (55,45%), C. tropicalis 39/186 (19,31%), C. glabrata hoặc C. parapsilosis 35/189 (17,33%) và 16 mẫu nghi ngờ không thuộc chi Candida. Định danh bằng kỹ thuật multiplex PCR cho thấy C. albicans chiếm 112/186 (55,45%), C. tropicalis 39/186 (19,31%), C. glabrata 25/186 (12,38%), C. parapsolosis 10/189 (4,59%) và 16 mẫu không phát hiện sản phẩm PCR. Quy trình multiplex PCR phát hiện 4 loài Candida sp. đạt 5 chỉ tiêu theo yêu cầu theo hướng dẫn của Bộ Y tế (2016): độ nhạy (93,33%), độ đặc hiệu (100%), độ chính xác (96,19%), giá trị tiên đoán dương (100%), độ lặp lại (đạt), giá trị tiên đoán âm (66,67%) < 90%.

Tóm tắt tiếng anh

This study aimed to (1) Detect of 4 species of C. albicans, C. glabrata, C. tropicalis, and C. parapsilosis by multiplex PCR and traditional methods. (2) Compare and evaluate the process of detecting 4 species Candida spp. from patient samples by multiplex PCR technique. Method: Sample Candida spp. was admitted 3 hospitals in Ho Chi Minh city from October 2020 to May 2021. The fungus was detected by 3 methods: (1) Germ tube, (2) isolation on CHROMagar Candida medium, and (3) multiplex PCR technique. Then, compare the detection process of 4 species of Candida by multiplex PCR technique and detection method on CHROMagar Candida, based on sensitivity, specificity, positive predictive value, negative predictive value, repeatability, and accuracy. Results: Isolated on CHROMagar Candida medium: 186 isolates with the highest infection rate being C. albicans 112/186 (55.45%), C. tropicalis 39/186 (19.31%), C. glabrata or C. parapsilosis 35/189 (17.33%) and 16 samples suspected of not belonging Candida. Identification by multiplex PCR: 186 PCR products were detected, of which C. albicans 112/186 (55.45%), C. tropicalis 39/186 (19.31%), C. glabrata 25/ 186 (12.38%), C. parapsolosis 10/189 (4.59%) and 16 samples did not detect PCR products. Multiplex PCR procedure detected 4 species of Candida spp. The criteria were evaluated, and there were 5 satisfactory criteria according to the guidance of the Ministry of Health (2016): sensitivity (93.33%), specificity (100%), accuracy (96.19%), positive predictive value (100%), repeatability (pass), negative predictive value (66.67%) < 90%.

Kí hiệu kho

TTKHCNQG, CVv 46

File toàn văn

Xem toàn văn