BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  22,032,913
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Sinh tin học

Nguyễn Hữu Quân(1), Kiều Thị Trà Giang

Sử dụng mã vạch DNA matK để định danh mẫu sum liên thu tại tỉnh Lào Cai, Việt Nam

Use of matK DNA barcode to identify adinandra samples collected at Lao Cai, Vietnam

Khoa học và Công nghệ - Đại học Thái Nguyên

2019

4

205-210

1859-2171

Adinandra lienii, DNA barcoding, Gen matK, Giám định loài, Sum liên

Adinandra lienii, DNA barcoding, matK gene, Species identification

Loài Sum liên có tên khoa học là Adinandra lienii phân bố ở khu vực miền núi phía Bắc, Việt Nam. Mẫu Sum liên thu tại tỉnh Lao Cai, Việt Nam đã được nhận diện bằng phân tích các đặc điểm hình thái dựa trên Khóa phân loại. Để khẳng định mẫu Sum liên thu được thuộc loài Adinandra lienii, nghiên cứu này trình bày kết quả sử dụng mã vạch DNA dựa trên trình tự đoạn gen matK phân lập từ mẫu Sum liên thu tại Lào Cai, Việt Nam. Đoạn gen matK của mẫu Sum liên có kích thước 867 nucleotide. Kết quả so sánh tương đồng bằng chương trình BLAST trong NCBI cho thấy trình tự đoạn gen matK của mẫu Sum liên thu tại Lào Cai thuộc loài Adinandra lienii, chi Dương đồng (Adinandra). Kết quả nghiên cứu này đã mở ra triển vọng sử dụng mã vạch DNA với trình tự gen matK trong định danh các loài thuộc chi Adinandra.

Sum lien has scientific name as Adinandra lienii, distributed in the North of Vietnam. The Sum lien sample collected in Lao Cai, Vietnam has been identified by analyzing morphological characteristics based on Lock classification. In order to confirm the Sum lien sample obtained from Adinandra lienii, this study presents the results using DNA barcodes based on the matK gene sequence isolated from the Sum lien samples collected in Lao Cai, Vietnam. The matK gene of Sum sample has the size of 867 nucleotide. The parralel comparision by BLAST in NCBI showed that the sequence of the matK gene of Sum lien sample collected in Lao Cai is among Adinandra lienii specie, Adinandra genus. The results of this study open up the prospect of using DNA barcodes with the matK gene sequence in identifying species belonging to the Adinandra genus.

TTKHCNQG, CTv 178

Xem toàn văn
  • [1] J. W. Kress; K. J. Wurdack; E. A. Zimmer; L. A. Weigh; D. H. Janzen (2005), Use of DNA barcodes to indentify flowering plants,Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 102, pp. 8369-8374
  • [2] M. A. Shaghai-Maroof; K. M. Soliman; R. A. Jorgensen; R. W. Allard (1984), Ribosomal DNAsepacer-length polymorphism in barley: mendelian inheritance, chromosomal location, and population dynamics,Proc. Natl. Acad. Sci., 81, pp. 8014-8019
  • [3] K. Vijayan; C. H. Tsou (2010), DNA barcoding in plants: taxonomy in a new perspective,Current science, 99, pp. 1530-1540
  • [4] H. L. Yong; R. Jinlan; C. Shilin (2010), Authentication of Taxillus chinensis using DNA barcoding technique,Journal of Medicinal Plants Research, 4(24), pp. 2706 – 2709
  • [5] K. W Hilu (1997), The matK gene: sequence variation and application in plant systematics,American Journal of Botany, 84, pp. 830-839
  • [6] Phạm Hoàng Hộ (2000), Cây c iệt Nam,
  • [7] (), Thực vật chí Trung quốc,http://www.efloras. org/