Đã đánh giá một cách hệ thống chất lượng các nguồn nước tự nhiên ở thủ đô Hà Nội: nước mặt (sông, hồ) và nước dưới đất trong các thành tạo địa chất Đệ Tứ. Kết quả nghiên cứu cho thấy, nước sông Hồng, nước hồ Tây hầu như chưa bị ô nhiễm, nước dưới đất tầng sâu (tầng qp) đã có biểu hiện ô nhiễm ở một số điểm. Các nguồn nước khác ít nhiều đã có biểu hiện ô nhiễm bởi một số yếu tố. Các nguồn nước tự nhiên ở Hà Nội bị ô nhiễm chủ yếu là do ảnh hưởng của nước thải đô thị (nước thải công nghiệp và dân sinh), phân huỷ chất thải rắn (nghĩa trang, bãi rác,..) và các tác động khác của con người