Sự ra đời và hoạt động của Đảng bộ cơ quan Ngân hàng Trung ương gắn với lịch sử xây dựng, phát triển của Ngân hàng Nhà nước (NHNN) Việt Nam qua các thời kỳ cách mạng, gắn liền với lịch sử dân tộc, lịch sử toàn Đảng từ giữa thế kỷ XX. Đảng bộ cơ quan Ngân hàng Trung ương ra đời và hoạt động ngay khi cơ quan Ngân hàng Trung ương được thành lập. Từ đó đến nay, Đàng bộ cơ quan Ngân hàng Trung ương đã lần lượt trực thuộc các Đảng bộ cấp trên khác nhau như: Đảng bộ các cơ quan Chính - Dân - Đảng Trung ương; Đảng bộ Khu phố Hoàn Kiếm - Thành phố Hà Nội; Đảng bộ Khối cơ quan Phân phối lưu thông Trung ương; Đảng bộ Khối cơ quan Kinh tế Trung ương; Đảng bộ Khối các cơ quan Trung ương. Trải qua các giai đoạn cách mạng của đất nước: Cuộc kháng chiến chống thực dân Pháp; kháng chiến chống đế quốc Mỹ; thời kỳ Tổ quốc thống nhất, cả nước tiến lên chủ nghĩa xã hội; thời kỳ đổi mới toàn diện, Đảng bộ đã kịp thời đôi mới tổ chức và hoạt động cho phù hợp.