Trong nghiên cứu này, mức độ đa dạng di truyền và cấu trúc quần thể của 120 mẫu Đàn hương trắng (Santalum album L.) từ 8 nguồn giống/xuất xứ thu ở các rừng trồng tại Hòa Bình, Quảng Ninh và Bắc Giang được đánh giá thông qua sử dụng chỉ thị phân tử ISSR. Qua sàng lọc từ 20 mồi ban đầu, đã xác định được 5 chỉ thị ISSR có mức độ đa hình cao để sử dụng trong nghiên cứu này. Kết quả thu được 62 phân đoạn DNA trong đó có 41,73% phân đoạn đa hình. Các mẫu Đàn hương trắng thuộc 8 xuất xứ có mức độ đa dạng di truyền ở mức thấp với các giá trị trung bình lần lượt là Na = 1,417; Ne = 1,225; I = 0,223; h = 0,149 và P = 41,73%. Phân tích AMOVA về mức độ sai khác di truyền tối đa giữa các xuất xứ ở mức độ tương đối cao đạt 49% và mức độ sai khác di truyền giữa các mẫu trong cùng xuất xứ đạt 51% (PhiPT = 0,509). Kết hợp cây quan hệ di truyền với cấu trúc quần thể STRUCTURE đã phân chia các xuất xứ thành 3 nhóm, với nhóm I gồm 4 nguồn giống có nguồn gốc Ấn Độ (AnĐo1, AnĐo2, AnĐo3 và VNam1), nhóm II gồm 3 xuất xứ có nguồn gốc từ Indonesia (InĐo1 và InĐo2) và nhóm III gồm 2 nguồn giống có xuất xứ từ Ấn Độ là xuất xứ đã được công nhận tại Việt Nam (VNam2 và AnĐo4). Kết quả này cung cấp cơ sở di truyền trong xác địnđịnh nguồn gen tiềm năng, phục vụ công tác lưu giữ và khai thác các mẫu Đàn hương trắng nhập nội ở Việt Nam.

The best five ISSR primers, se-lected f-rom the screening of 20 primers, were used to evaluate the genetic diversity of 120 samples of Santalum album L. belonging to 8 seed sources/provenances collected at the plantations in Hoa Binh, Quang Ninh and Bac Giang provinces. The results obtained were 62 DNA fragments, including 41.73% polymorphic fragments. S. album L. s amples f-rom 8 s eedlots h ave l ow l evels o f d iversity transmission with average values such as Na = 1.417; Ne = 1.225; I = 0.223; h = 0.149 and P = 41.73%. AMOVA analysis of the maximum level of transmission bias between provenances at a relatively high level reached 49% and the level of bias between samples within the same provenance reached 51% (PhiPT = 0.509). The genetic relationship tree combined with the STRUCTURE population structure has been divided into 3 groups, with group I (AnĐo1, AnĐo2, AnĐo3 and VNam1 originating f-rom India, group II originating f-rom Indonesia (InĐo1 and InĐo2) and Group III (VNam2 and AnĐo4). This result provides foundation knowledge for future research and development programs of Santalum album L. in Vietnam.