BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  21,780,768
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Lê Chí Toàn(1), Nguyễn Văn Dư, Omollo Omondi Wyckliffe, Liu Bing

NGHIÊN CỨU PHÂN LOẠI VÀ PHÁT SINH LOÀI CỦA CHI CÓC SPONDIAS L. (ANACARDIACEAE) Ở VIỆT NAM

TAXONOMY AND PHYLOGENY OF VIETNAMESE SPONDIAS L. (ANACARDIACEAE)

Tạp chí Khoa học và Công nghệ - Đại học Thái Nguyên

2019

14

Chi Cóc (Spondias L.) là một chi nhỏ của họ Xoài. Việc sắp xếp phân loại và tìm hiểu mối quan hệ di truyền của chi Cóc ở Việt Nam là chưa rõ ràng và còn tồn tại một số vấn đề. Nghiên cứu này tiến hành phân tích mối quan hệ phát sinh loài của chi Cóc và họ hàng gần gũi của chi này dựa trên dữ liệu sinh học phân tử là các đoạn gen lục lạp rbcL, matK, và trnL-F. Kết quả phân tích dữ liệu phân tử ủng hộ mạnh mẽ rằng chi Cóc là chi đơn phát sinh với hai nhánh phát sinh chính là nhánh Cóc Nam Mỹ và nhánh Cóc châu Á; Cóc Việt Nam nằm trong nhánh Cóc châu Á. Dựa trên cả dữ liệu phân tử và hình thái, nghiên cứu này ghi nhận Cóc Việt Nam bao gồm hai loài Spondias dulcis Parkinson và Spondias pinnata (L. f.) Kurz. Khóa định loại và mô tả cho các loài Cóc Việt Nam được cung cấp. Nghiên cứu này cũng chỉ ra rằng Spondiaspetelotii là đồng nghĩa của Allospondiaslakonensis

Spondias is a small genus of Anacardiaceae. Vietnamese Spondias has remained taxonomically unresolved and the infrageneric relationship within the genus has been disputed. Here, we present molecular phylogenetic analyses of this genus and its close relatives using a combined dataset of the chloroplast rbcL, matK, and trnL-F regions. Molecular analyses strongly supported the monophyly of Spondias with two major clades and Vietnamese Spondias was placed within Asian Spondias clade. Based on both morphological and molecular data, we recognized two species of Spondias S. dulcis Parkinson and S. pinnata (L. f.) Kurz in Vietnam. The key and description for Vietnamese Spondias species were provided. We also suggested to recognize Spondiaspetelotii as a synonym of Allospondiaslakonensis

Xem toàn văn
  • [1] Pell S. K., Mitchell J. D., Miller A. J., Lobova T. A. (2011), Anacardiaceae.,In: Kubitzki K. (ed) The families and genera of vascular plants, Flowering plants: Eudicots, Sapindales, Cucurbitales, Myrtaceae Vol. 10, Springer, Hamburg, Germany, pp. 7–51
  • [2] Rambaut A., Drummond A. J. (2007), Tracer. Version 1.4.,http://beast.bio.ed.ac.uk/Tracer
  • [3] Miller M. A., Pfeiffer W., Schwartz T. (2010), Creating the CIPRES Science Gateway for inference of large phylogenetic trees in Proceedings of the gateway computing environments workshop (GCE),Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), New Orleans, USA pp. 1–8
  • [4] Ronquist F., Huelsenbeck J. P. (2003), MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models,Bioinformatics, 19, pp. 1572–1574
  • [5] Darriba D., Taboada G. L., Doallo R., Posada D. (2012), JModelTest 2: more models, new heuristics and high-performance computing,Nature Methods, 9, pp. 772
  • [6] Stamatakis A., Hoover P., Rougemont J. (2008), A rapid bootstrap algorithm for the RAxML Web servers,Systematic Biology, 57, pp. 758–771
  • [7] Stamatakis A. (2006), RAxML-VI-HPC, maximum likelihood-based phylogenetic analyses with thousands of taxa and mixed models,Bioinformatics, 22, pp. 2688–2690
  • [8] Kearse M., Moir R., Wilson A., StonesHavas S., Cheung M., Sturrock S., Buxton S., Cooper A., Markowitz S., Duran C., Thierer T., Ashton B., Mentjies P., Drummond A. (2012), Geneious basic: an integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data,Bioinformatics, 28, pp. 1647–1649
  • [9] Taberlet P., Gielly L., Pautou G., Bouvet J. (1991), Universal primers for amplification of three noncoding regions of chloroplast DNA,Plant Molecular Biology, 17, pp. 1105–1109
  • [10] Le C. T., Liu B., Barrett R. L., Lu L. M., Wen J., Chen Z. D. (2018), Phylogeny and a new tribal classification of Opiliaceae (Santalales) based on molecular and morphological evidence,Journal of Systematics and Evolution, 56, pp. 56–66
  • [11] Doyle J. J., Doyle J. L. (1987), A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue,Phytochemical Bulletin, 19, pp. 11– 15
  • [12] Pham H. H. (2003), An illustrated flora Vietnam,Young Publishing House, Hochiminh, 2, pp. 372– 373
  • [13] Nguyen T. B. (2004), Anacardiaceae in Checklist of plant species of Vietnam - Angiosperms,Agricultural Publishing House, Hanoi, 2, pp. 941– 953
  • [14] Chayamarit K. (1997), Molecular phylogeny analysis of Anacardiaceae in Thailand,Thai Forest Bulletin (BOT), 25, pp. 1–13
  • [15] Min T. L., Barfod A. (2008), Anacardiaceae,Wu CY, Raven PH (eds) Flora of China, Science Press, Beijing and Missouri Botanical Garden Press, St Louis, 11, pp. 335–357
  • [16] Kostermans A. J. G. H. (1991), Kedondong, Ambarella, Amra, the Spondiadeae (Anacardiaceae) in Asia and the Pacific area, Published by the author, printed by Rachmat O, Karya B 78 Printing Work,Jl Semboja 13: Bogor
  • [17] Kostermans A. J. G. H. (1981), Notes on Spondias L. (Anacardiaceae),Quarterly Journal of the Taiwan Museum, 34, pp. 105–111
  • [18] Airy-Shaw H. K., Forman L. L. (1967), The genus Spondias L. (Anacardiaceae) in tropical Asia,Kew Bulletin, 21, pp. 1–19
  • [19] Marchand N. L. (1869), Révision du Groupe des Anacardiacées,Baillière JB et Fils
  • [20] Bentham G., Hooker J. D. (1862), Anacardiaceae in Genera Plantarum,Reeve & Co., London, Vol. 1, pp. 415–428
  • [21] Silva J. N., Costa A. B., Silva J. V. (2015), DNA barcoding and phylogeny in Neotropical species of the genus Spondias,
  • [22] Mitchell J. D., Daly D. C. (2015), A revision of Spondias L. (Anacardiaceae) in the Neotropics,Phytokeys, 55, pp. 1–92