BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  23,874,971
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Khoa học hoá học khác

Ngô Thị Hồng Nhung, Đậu Thị Thu Hương, Nguyễn Tiến Trung(1)

Nghiên cứu cấu trúc hình học, độ bền và liên kết hydro của tương tác guanine với thymine ở mức độ phân tử bằng phương pháp hoá học tính toán

Insight into structure, stability and hydrogen bond in complexes of guanine and thymine at the molecular level using computational chemical method

Hấp phụ và Xúc tác Việt Nam

2022

1

126-133

0866-7411

Guanin, Thymine, SAPT2 +, Dịch chuyển lại liên kết hydro

Guanine, Thymine, SAPT2+, Redshifting hydrogen bond

Việc hiểu biết về các tương tác không cộng hóa trị rất cần thiết để làm sáng tỏ những bí ẩn về chức năng của tế bào nhằm tìm ra các phương thức chữa bệnh mới, giải quyết các vấn đề sức khỏe cũng như phát triển các loại thuốc và vật liệu mới phục vụ cuộc sống con người. Trong các tương tác không cộng hóa trị, liên kết hydro chiếm vị trí quan trọng bởi vai trò to lớn trong nhận dạng thông tin phân tử, quá trình cuộn gấp protein, sắp xếp lại cấu trúc của các acid nucleic, tinh thể hóa, polymer hóa, hóa học siêu phân tử, quá trình solvat hóa, hay trong tổng hợp hữu cơ[2,3] . Do đó, việc hiểu về các thuộc tính vật lý và hóa học của liên kết hydro A-H...B đã và đang là vấn đề lý thú của các nhà nghiên cứu thực nghiệm và lý thuyết

Nine stable structures of complexes formed by interaction of guanine with thymine were located on potential energy surface at B3LYP/6- 311++G(2d,2p). The complexes are quite stable with interaction energy from -5,8 to -17,7 kcal.mol-1 . Strength of complexes are contributed by hydrogen bonds, in which a pivotal role of N−HO/N overcoming C−HO/N hydrogen bond, up to to 3.5 times, determines stabilization of complexes investigated. It is found that polarity of N/C−H covalent bond over proton affinity of N/O site governs stability of hydrogen bond in the complexes. The obtained results show that the N/C−HO/N red-shifting hydrogen bonds occur in all complexes, and a larger magnitude of an elongation of N−H compared C-H bond length accompanied by a decrease of its stretching frequency is detected in the N/C−HO/N hydrogen bond upon complexation. The SAPT2+ analysis indicates the substantial contribution of attractive electrostatic energy versus the induction and dispersion terms in stabilizing the complexes.

TTKHCNQG, CVv 455

Xem toàn văn