BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  21,940,277
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Bệnh học thú y

Cao Thị Bích Phượng, Nguyễn Văn Giáp, Nguyễn Thành Trung, Mai Thị Ngân(1), Vũ Thị Ngọc, Huỳnh Thị Mỹ Lệ

Ứng dụng phản ứng PCR trực tiếp (Direct PCR) phát hiện một số vi khuẩn ở gà mắc bệnh hô hấp phức hợp tại Hà Nội và vùng phụ cận

Application of direct pcr for detection of several bacteria in chicken with respiratory disease complex in Hanoi and neighbor vicinity

Khoa học Nông nghiệp Việt Nam

2022

2

156-165

2588-1299

Bệnh hô hấp phức hợp, Gia cầm, Vi khuẩn, Kỹ thuật PCR trực tiếp

Direct PCR, Complex respiratory disease, Bacteria, Co-infection, Poultry, Hanoi

Bệnh hô hấp phức hợp đã nổi lên như một thách thức kinh tế lớn đối với ngành chăn nuôi gia cầm. Cùng với đó, các công cụ chẩn đoán hiện tại như các quy trình xét nghiệm nuôi cấy phân lập vi khuẩn, huyết thanh học hay PCR thường quy tốn nhiều thời gian & sử dụng nhiều công lao động. Chính vì vậy, nghiên cứu này thiết lập và ứng dụng phản ứng PCR trực tiếp (direct PCR) để xác định tần suất có mặt của một số vi khuẩn thường gặp ở gà mắc bệnh hô hấp phức hợp. Kết quả chỉ ra rằng mức độ đồng thuận của phương pháp PCR trực tiếp so với PCR thường quy là rất cao. Khi kiểm tra 173 gà mắc hội chứng sưng phù đầu nghi do các mầm bệnh như Mycoplasma gallisepticum (MG), Avibacterium paragallinarum (APG), Ornithobacterium rhinotracheale (ORT) và avian pathogenic Escherichia coli (APEC) bằng phản ứng PCR trực tiếp, 68% trường hợp dương tính với ít nhất một mầm bệnh khảo sát, trong khi 23% gà bị nhiễm đồng thời 2-3 mầm bệnh. Như vậy, phương pháp PCR trực tiếp có thể được sử dụng như một công cụ hiệu quả để phát hiện một số vi khuẩn ở gà mắc bệnh hô hấp phức hợp ở Hà Nội và vùng phụ cận.

The respiratory disease complex has emerged as a major economic problem for the poultry industry. In addition, the current diagnostic tools, such as bacteria isolation, serological tests, and conventional PCR are time-consuming and labor-intensive. Therefore, this study was carried out to develop the direct PCR and to apply it to investigate the presence of some common bacteria in the swollen head syndrome. Compared with the conventional PCR results, the Kappa value for direct PCR was almost in perfect agreement. Among 173 samples screening by direct PCR, 68% of cases revealed infection by at least one investigated pathogen, while 23% had concurrent infections by two to three bacteria in a single case. As a result, direct PCR is recommended to be an effective tool for detecting the concurrent infections by Mycoplasma gallisepticum (MG), Avibacterium paragallinarum (APG), Ornithobacterium rhinotracheale (ORT) and avian pathogenic Escherichia coli (APEC) of the swollen head syndrome in chickens in the vicinity of Hanoi.

TTKHCNQG, CTv 169

Xem toàn văn
  • [1] Zhong C., Gopinath S., Norona W., Ge J., Lagacé R.E., Wang D.Y., Short M.L. & Mulero J.J. (2019), Developmental validation of the Huaxia™ Platinum PCR amplification kit: A 6-dye multiplex direct amplification assay designed for Chinese reference samples.,Forensic Science International: Genetics. 42: 190-197
  • [2] Yu M., Xing L., Chang F., Bao Y., Wang S., He X., Wang J., Wang S., Liu Y., Farooque M., Pan Q., Wang Y., Gao L., Qi X., Hussain A., Li K., Liu C., Zhang Y., Cui H., Wang X. & Gao Y. (2019), Genomic sequence and pathogenicity of the first avian metapneumovirus subtype B isolated f-rom chicken in China,Vet Microbiol. 228: 32-38.
  • [3] Wilfinger W.W., Mackey K. & Chomczynski P. (1997), Effect of pH and ionic strength on the spectrophotometric assessment of nucleic acid purity.,Biotechniques. 22(3): 474-6, 478-81.
  • [4] Võ Thị Trà An, Nguyễn Thị Bích Liên, Trần Thị Ngọc Hân, Hồ Quang Dũng & Chansiripornchai, N. (2014), Nhận dạng, phân lập & xác định mước độ mẫn cảm kháng sinh của vi khuẩn Orninobacterium rhinotracheale ở gà,Tạp chí Khoa học Kỹ thuật Thú y. 21(7): 23-27.
  • [5] Van Empel P.C. & Hafez H.M. (1999), Ornithobacterium rhinotracheale: A review,Avian Pathol. 28(3): 217-27.
  • [6] Trương Hà Thái, Nguyễn Ngọc Đức, Nguyễn Văn Giáp & Chu Thị Thanh Hương (2009), Xác định tỉ lệ nhiễm Mycoplasma gallisepticum ở 2 giống gà hướng thịt Ross 308 & ISA màu nuôi công nghiệp tại một số tỉnh miền Bắc Việt Nam,Tạp chí Khoa học & Phát triển. 7(3): 306-313.
  • [7] Tanaka M., Takuma H., Kokumai N., Oishi E., Obi T., Hiramatsu K. & Shimizu Y. (1995), Turkey Rhinotracheitis Virus Isolated f-rom Broiler Chicken with Swollen Head Syndrome in Japan.,Journal of Veterinary Medical Science. 57(5): 939-941
  • [8] Samy A. & Naguib M.M. (2018), Avian respiratory coinfection and impact on avian influenza pathogenicity in domestic poultry: field and experimental findings.,Vet Sci. 5(1): 23.
  • [9] Roussan D.A., Haddad R. & Khawaldeh G. (2008), Molecular survey of avian respiratory pathogens in commercial broiler chicken flocks with respiratory diseases in Jordan,Poult Sci. 87(3): 444-8.
  • [10] Paudel S., Hess M. & Hess C. (2017), Coinfection of Avibacterium paragallinarum and Gallibacterium anatis in Specific-Pathogen-Free Chickens Complicates Clinical Signs of Infectious Coryza, Which Can Be Prevented by Vaccination.,Avian Dis. 61(1): 55-63.
  • [11] Nguyễn Thị Loan, Lê Đình Quyền, Dương Hồng Quân, Lê Huỳnh Thanh Phương, Nguyễn Bá Hiên & Lê Văn Phan (2016), Ứng dụng kỹ thuật RT-PCR để chẩn đoán bệnh viêm phế quản truyền nhiễm (Infectious bronchitis) ở gà đẻ trứng tại một số tỉnh phía Bắc Việt Nam.,Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam. 14(9): 1387-1394
  • [12] Nguyễn Thị Lan, Chu Đức Thắng, Nguyễn Bá Hiên, Phạm Hồng Ngân, Lê Văn Hùng & Nguyễn Thị Yến (2016), Đặc điểm của vi khuẩn Ornithobacterium rhinotracheale (ORT) phân lập từ đàn gà nuôi tại một số tỉnh phía Bắc Việt Nam,Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam. 14(11): 1734-1740.
  • [13] Nakamura K., Mase M., Tanimura N., Yamaguchi S. & Yuasa N. (1998), Attempts to reproduce swollen head syndrome in specific pathogen-free chickens by inoculating with Escherichia coli and/or turkey rhinotracheitis virus,Avian Pathol. 27(1): 21-7.
  • [14] Mohamed M. Shawki Lebdah M.A., Shahin A.M. & Nassif S. A. (2017), Some studies on swollen head syndrome in broiler chickens in Egypt,Zagazig Veterinary Journal. 45(S1): 132-141.
  • [15] Mcdougall J.S. & Cook J.K. (1986), Turkey rhinotracheitis: preliminary investigations,Vet Rec. 118(8): 206-7.
  • [16] Lê Văn Hùng, Nguyễn Thị Giang & Trần Danh Sơn (2019), Phân lập, xác định đặc điểm của vi khuẩn gây bệnh sổ mũi truyền nhiễm trên gà tại một số tỉnh phía Bắc Việt Nam.,Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam. 17(8): 622-629.
  • [17] Lorenz T.C. (2012), Polymerase chain reaction: basic protocol plus troubleshooting and optimization strategies.,Journal of visualized experiments: JoVE. (63): e3998-e3998
  • [18] Kaore M., Singh K., Palanivelu M., Asok Kumar M., Reddy M. & Kurkure N.V (2018), Pathoepidemiology of respiratory disease complex pathogens (RDPs) in commercial chicken,Indian J. Vet. Pathol. 42(4): 231-238.
  • [19] Kwon J.S., Lee H.J., Jeong S.H., Park J.Y., Hong Y.H., Lee Y.J., Youn H.S., Lee D.W., Do S.H., Park S.Y., Choi I.S., Lee J.B. & Song C.S. (2010), Isolation and c-haracterization of avian metapneumovirus f-rom chickens in Korea,J Vet Sci. 11(1): 59-66.
  • [20] Katcher H.L. & Schwartz I. (1994), A distinctive property of Tth DNA polymerase: enzymatic amplification in the presence of phenol.,Biotechniques. 16(1): 84-92.
  • [21] Jones R. & S.R. (2013), Diseases of poultry. In: Avian metapneumovirus:. David E. Swayne, J.R.G.,Larry R. Mcdougald, Lisa K. Nolan, David L. Suarez, Venugopal L. Nair (ed.) 13 ed.. John Wiley & Sons Inc. Iowa, USA: Iowa State Press.,
  • [22] Johnson T.J., Wannemuehler Y., Doetkott C., Johnson S.J., Rosenberger S.C. & Nolan L.K. (2008), Identification of minimal predictors of avian pathogenic Escherichia coli virulence for use as a rapid diagnostic tool,J Clin Microbiol. 46(12): 3987-96
  • [23] Gharaibeh S.M. & Algharaibeh G.R. (2007), Serological and molecular detection of avian pneumovirus in chickens with respiratory disease in Jordan,Poult Sci. 86(8): 1677-81.
  • [24] García M., Ikuta N., Levisohn S. & Kleven S.H. (2005), Evaluation and comparison of various PCR methods for detection of Mycoplasma gallisepticum infection in chickens,Avian Diseases. 49(1): 125-132.
  • [25] Goodwin M.A. & Waltman W.D. (1994), Clinical and pathological findings in young Georgia broiler chickens with oculofacial respiratory disease ("socalled swollen heads",Avian Dis. 38(2): 376-8.
  • [26] Feuerman M. & Miller A.R (2008), Relationships between statistical measures of agreement: sensitivity, specificity and kappa, J Eval Clin Pract. 14(5): 930-3.,
  • [27] Eszik I., Lantos I., Önder K., Somogyvári F., Burián K., Endrész V. & Virok D.P. (2016), High dynamic range detection of Chlamydia trachomatis growth by direct quantitative PCR of the infected cells, J Microbiol Methods. 120: 15-22,
  • [28] Đào Thị Hảo (2008), Phân lập, xác định một số đặc tính sinh học của Mycoplasma gallisepticum & chế kháng nguyên, huyết thanh chẩn đoán,Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp. Viện Thú y.
  • [29] De Oliveira A.L., Rocha D.A., Finkler F., De Moraes L.B., Barbieri N.L., Pavanelo D.B., Winkler C., Grassotti T.T., De Brito K.C., De Brito B.G. & Horn F. (2015), Prevalence of ColV plasmidlinked genes and in vivo pathogenicity of avian strains of Escherichia coli, Foodborne Pathog Dis. 12(8): 679-85.,
  • [30] De Boeck C., Kalmar I., Dumont A. & Vanrompay D. (2015), Longitudinal monitoring for respiratory pathogens in broiler chickens reveals co-infection of Chlamydia psittaci and Ornithobacterium rhinotracheale.,J Med Microbiol. 64(Pt 5): 565-574.
  • [31] David E. Swayne, Martine Boulianne, Catherine M. Logue, Larry R. McDougald, Venugopal Nair, David L. Suarez, Sjaak de Wit, Tom Grimes, Deirdre Johnson, Michelle Kromm, Teguh Yodiantara Prajitno, Ian Rubinoff & Guillermo Zavala (2020), Diseases of poultry (14th).,John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, NJ 07030, USA.
  • [32] Cao Thị Bích Phượng, Lê Bá Hiệp, Huỳnh Thị Mỹ Lệ & Nguyễn Văn Giáp (2020), Nghiên cứu sự lưu hành của avian metapneumovirus (aMPV) ở gà nuôi tại một số tỉnh miền Bắc Việt Nam,Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam. 18(7): 520-528
  • [33] Cascella R., Strafella C., Ragazzo M., Zampatti S., Borgiani P., Gambardella S., Pirazzoli A., Novelli G. & Giardina E. (2015), Direct PCR: a new pharmacogenetic approach for the inexpensive testing of HLA-B*57:01,Pharmacogenomics J. 15(2): 196-200.
  • [34] Chen X., Miflin J.K., Zhang P. & Blackall P.J. (1996), Development and application of DNA probes and PCR tests for Haemophilus paragallinarum,Avian Dis. 40(2): 398-407.
  • [35] Ben-Amar A., Oueslati S. & Mliki A (2017), Universal direct PCR amplification system: a time- and costeffective tool for high-throughput applications.,3 Biotech. 7(4): 246-246.
  • [36] Andreopoulou M., Franzo G., Tucciarone C.M., Prentza Z., Koutoulis K.C., Cecchinato M. & Chaligianni I. (2019), Molecular epidemiology of infectious bronchitis virus and avian metapneumovirus in Greece,Poult Sci. 98(11): 5374-5384
  • [37] Alshahni M.M., Makimura K., Yamada T., Satoh K., Ishihara Y., Takatori K. & Sawada T. (2009), Direct colony PCR of several medically important fungi using Ampdirect plus, Jpn J Infect Dis. 62(2): 164-7.,
  • [38] Aung Y.H., Liman M., Neumann U. & Rautenschlein,S. (2008), Reproducibility of swollen sinuses in broilers by experimental infection with avian metapneumovirus subtypes A and B of turkey origin and their comparative pathogenesis,Avian Pathol. 37(1): 65-74
  • [39] Altman D.G. & Bland J.M. (1994), Statistics Notes: Diagnostic tests 1: sensitivity and specificity. BMJ. 308(6943): 1552.,