Khảo sát điều kiện phản ứng polymerase spiral reaction trong việc phát hiện nhanh gen kháng methicillin của Staphylococcus aureus

Chỉ số đề mục

Lĩnh vực nghiên cứu

Sinh học phân tử

Dạng tài liệu

Tác giả

Vũ Quang Hiếu, Trần Thị Quỳnh Như, VŨ QUANG HIẾU⁽¹⁾

Nhan đề

Khảo sát điều kiện phản ứng polymerase spiral reaction trong việc phát hiện nhanh gen kháng methicillin của Staphylococcus aureus

Nhan đề tiếng anh

Investigating polymerase spiral reaction conditions in detecting anti-methicillin resistant gene (MecA) of Staphylococcus aureus

Nguồn trích

Tạp chí Khoa học và Công nghệ (Đại học Nguyễn Tất Thành)

Năm xuất bản

2021

Số

14

Trang

6-12

ISSN

2615-9015

Từ khóa

Staphylococcus aureus, MRSA, Polymerase Spiral Reaction, gen mecA.

Từ khóa tiếng anh

PSR (Polymerase Spiral Reaction), mecA gene

Tóm tắt

Staphylococcus aureus (S. aureus) là một trong những vi khuẩn gây bệnh nguy hiểm cho người và vật nuôi, đặc biệt là khi chúng kháng lại kháng sinh methicillin. Việc phát hiện các dòng S. aureus kháng kháng sinh methicillin (MRSA) giúp cho việc lựa chọn kháng sinh phù hợp trong điều trị. Trình tự gen mecA quy định một trong những tổ hợp kháng methicillin của MRSA được sử dụng làm biomarker cho các kĩ thuật sinh học phân tử. Phản ứng trùng hợp vòng xoắn - Polymerase spiral reaction (PSR) gây khuếch đại đoạn gen mecA trong điều kiện đẳng nhiệt và không yêu cầu trang thiết bị đắt tiền. Mục tiêu của nghiên cứu này là khảo sát điều kiện phản ứng PSR nhằm phát hiện nhanh gen mecA trên MRSA. Kết quả đã xác định được điều kiện tối ưu của phản ứng PSR là ở nhiệt độ 65 0C trong 50 phút, với nồng độ tối ưu của mồi F1+Nr/R1+N là 1,6 µM và nồng độ tối ưu của mồi F2/R2 là 0,1 µM. Giới hạn phát hiện của phản ứng PSR đối với DNA tách chiết là 10-3 ng/μL và đối với tế bào vi khuẩn là 5 tế bào/μL.

Tóm tắt tiếng anh

Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is one of the most dangerous pathogens on human and pets, especially as they can withstand methicillin. Identifying MRSA S. aureus strains can help with choosing proper antibiotics for treatment. The mecA gene that stipulates one of the methicillin resistant genetic combination is commonly used to detect MRSA in molecular biology techniques. The PSR (Polymerase Spiral Reaction) technique allows the amplification of the target gene sequence under isothermal conditions which is suitable for detection of MRSA. The results showed the optimal protocol of the PSR reaction at the temperature of 65 0C, duration of 50 minutes with the optimal primer concentration of 1,6 μM F1+Nr/R1+N and 0,1 μM F2/R2. The detection limit of extracted DNA is 10-3 ng/μL and the detection limit of bacterial cells is 5 bacterial cells/μL. The optimized PSR technique in this study was capable of detecting the mecA gene with a sensitivity and specificity of 100 %.

Kí hiệu kho

TTKHCNQG, CVv 503

File toàn văn

Xem toàn văn