Đặc trưng khai thác động vật đáy có giá trị kinh tế chủ yếu đầm Thủy Triều được xác định thông qua việc tổng hợp các tư liệu nghiên cứu trước đây và qua 4 chuyến điều tra khảo sá từ năm 2011-2015. Kết quả nghiên cứu đã xác định được 11 loài động vật đáy có giá trị kinh tế chủ yếu, trong đó giáp xác chiếm ưu thế về thành phần loài (7 loài) và sản lượng (chiếm từ 78-80 phần trăm tổng sản lượng động vật đáy theo thời gian), đặc biệt Portunus pelagicus chiếm từ 64-72 phần trăm tổng sản lượng giáp xác theo thời gian. Đa số nguồn lợi động vật đáy thuộc nhóm sống trên mặt, sinh sống ở vùng dưới triều, nơi có nhiều thảm cỏ biển, đáy cát bùn. áp lực khai thác đầm Thủy Triều khá lớn, với mật độ phương tiện, số nghề và thời gian khai thác trung bình nghề khá cao và tập trung chủ yếu vào mùa khô (chiếm gần 70 phần trăm tổng thời gian hoạt động trung bình nghề/năm), đặc biệt nghề khai thác hủy diệt tận thu như xiết điện, lưới lồng và đào (chiếm trên 70 phần trăm tổng thời gian năm). Sản lượng nghề khai thác động vật đáy chiếm ưu thế vào mùa khô (chiếm trên 81 phần trăm tổng sản lượng khai thác nghề/năm). Thành phần và sản lượng nguồn lợi động vật đáy có chiều hướng suy giảm nghiêm trọng. Nguyên nhân có thể do thời gian hoạt động trung bình/năm của các loài nghề khá cao, đặc biệt nghề khai thác mang tính hủy diệt, tận thu (lưới lồng, xiết điện). Kết quả nghiên cứu này cung cấp cơ sở khoa học cho việc nghiên cứu sâu hơn về chuỗi, lưới thức ăn và cung cấp dữ liệu cho quy hoạch, phân vùng và khai thác nguồn lợi thủy sản hợp lý).