HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
Lọc theo danh mục
liên kết website
Lượt truy cập
Lượt truy cập :
19,963,624
- Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam
Bảo vệ thực vật
Nguyễn Duy Hưng, Hà Viết Cường, Hoàng Chúng Lằm
Phát hiện các loài Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt bằng phản ứng chuỗi polymerase
Detection of Colletotrichum Species Causing Anthracnose of Chili by Polymerase Chain reaction
Khoa học nông nghiệp Việt Nam
2018
12
1025-1038
2588-1299
Bệnh thán thư do nấm Colletotrichum spp. là một trong các bệnh nguy hiểm nhất trên ớt tại Việt Nam và thế giới. Định danh loài Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt dựa trên các đặc điểm hình thái thường gây ra sự nhầm lẫn. Mục tiêu của nghiên cứu là thiết kế được các cặp mồi đặc hiệu phục vụ chẩn đoán nhanh, chính xác loài nấm Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt bằng phản ứng chuỗi polymerase (PCR. Trong nghiên cứu này dựa trên trình tự vùng Internal Transcribed Spacer (ITS) và vùng liên gen của 2 gen apn2 và MAT1-2-1 genes (ApMat) đã thiết kế được 4 cặp mồi đặc hiệu. Các cặp mồi thiết kế đã phát hiện đặc hiệu 4 loài C. truncatum, C. fructicola, C. gloeosporioides sensu stricto và C. siamense gây bệnh thán thư ớt tại đồng bằng sông Hồng và một số tỉnh. Nghiên cứu cũng chứng tỏ phương pháp chiết nhanh DNA bằng NaOH có hiệu quả cao nhằm chuẩn bị mẫu DNA từ nấm Colletotrichum cho phản ứng PCR. Phân tích PCR dùng các mồi đặc hiệu trên 52 mẫu nấm Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt thu tại 9 tỉnh đồng bằng Sông Hồng, 3 tỉnh trung du và miền núi phía Bắc và 1 tỉnh đồng bằng Sông Cửu Long đã xác định được loài phổ biến nhất là C. siamense (chiếm 51,9% tổng số mẫu), tiếp theo là C. fructicola (21,2%), C. truncatum (15,4%), và C. gloeosporioides sensu stricto (9,6%).
Anthracnose caused by Colletotrichum spp. is one of the most destructive diseases of chili in Vietnam and worldwide. Identifying Colletotrichum species that cause anthracnose based on morphological c-haracteristics often causes confusion. The objective of the study was to design specific primer pairs for rapid and accurate diagnosis of Colletotrichum fungus causing anthracnose by PCR (polymerase chain reaction). In the study, based on the Internal Transcribed Spacer (ITS) region and the intergenic region of apn2 and MAT1-2-1 genes (ApMat) four specific primer pairs were designed. Four species,i.e. C. truncatum, C. fructicola, C. gloeosporioides sensu stricto and C. siamense that cause chili anthracnose in the Red River Delta and some other provinces were detected. The study also showed that a modified rapid extraction protocol using NaOH was highly effective to prepare DNA samples f-rom Colletotrichum cultures for PCR reaction. PCR analyses using the newly designed specific primers on 52 chili Colletotrichum isolates collected f-rom 13 provinces, mainly the Red River Delta, revealed C. siamense as the most abundant species (51.9% of total isolates), followed by C. fructicola (21.2%), C. truncatum (15.4%), and C. gloeosporioides sensu stricto (9.6%).
TTKHCNQG, CTv 169
Xem toàn văn