HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
Lọc theo danh mục
liên kết website
Lượt truy cập
Lượt truy cập :
23,669,466
- Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam
67
Bảo vệ thực vật
BB
Nguyễn Thị Kim Thoa, Huỳnh Nguyễn Minh Nghĩa, Phạm Văn Hiểu, Đinh Thiện Quân, Nguyễn Xuân Dũng
Sử dụng kỹ thuật RT-PCR phát hiện Cucurbit aphidborne yellows virus gây bệnh trên dưa lưới (Cucumis melo L.)
Using RT-PCR to detect Cucurbit aphid-borne yellows virus affecting melon (Cucumis melo L.)
Khoa học (Đại học Hồng Bàng)
2025
35
185-194
2615-9686
Cucurbit aphid-borne yellows virus (CABYV) là virus thuộc chi Polerovirus, được mô tả lần đầu tiên ở Pháp vào năm 1992 và đến nay đã được ghi nhận tại nhiều quốc gia trên thế giới. CABYV gây thiệt hại lớn về năng suất trên các cây thuộc họ bầu bí, bao gồm dưa lưới với tỷ lệ thiệt hại 10 - 15%. Bài báo này trình bày kết quả phát hiện CABYV trên dưa lưới thông qua việc khuếch đại phân đoạn gen protein vỏ của chúng bằng phản ứng RTPCR. Hiệu quả phản ứng được tối ưu hóa với hai thông số nồng độ và nhiệt độ bắt cặp mồi. Độ tương đồng của phân đoạn gen khuếch đại được xác định bằng cách giải trình tự và so sánh với các trình tự gen đã được công bố trên ngân hàng gen. Phản ứng RT-PCR hoàn thiện đã được sử dụng để kiểm tra CABYV trong các mẫu dưa lưới thu thập tại Thành phố Hồ Chí Minh. Kết quả cho thấy đã thiết lập được phản ứng RT-PCR khuếch đại gen virus với nhiệt độ bắt cặp mồi: 57°C, nồng độ mồi: 0.2 μM và ngưỡng phát hiện: 10² bản sao/μL. Phân đoạn gen thu được tương đồng 95.93 - 99.42% với các trình tự gen tương ứng của CABYV đã được công bố. Sự hiện diện của CABYV được ghi nhận ở 3 trong tổng số 20 mẫu dưa lưới thu thập.
CABYV (Cucurbit aphid-borne yellows virus), a virus f-rom the polerovirus genus, was first described in France in 1992 and has been reported in various countries worldwide [1 - 5]. This virus causes significant yield losses in cucurbit crops, including melon, with a yield reduction of 10 - 15% [1]. This study presents the results of CABYV detection in melons by amplifying the coat protein gene fragment using RT-PCR. The reaction efficiency was enhanced through the optimization of two parameters: primer concentration and annealing temperature. The homology of the amplified gene segment was determined by sequencing and aligning with published sequences in GenBank. The complete RT-PCR reaction was used to test for CABYV in collected melon samples in Ho Chi Minh City. The results showed that the RT-PCR reaction amplifying the virus gene was established with a primer annealing temperature of 57°C, primer concentration of 0.2 μM, and detection threshold of 10² copies/μL. The gene segment obtained was homologous to the CABYVpublished sequences at a score of between 95.93% and 99.42%. The presence of CABYV was found in three of the 20 melon samples that were collected.
TTKHCNQG, CVv 414
Xem toàn văn