



- Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam
76
Kỹ thuật và thiết bị y học
BB
Nguyễn Hoàng Tuyết Minh, Ngô Quốc Đạt, Nguyễn Văn Thắng, Phạm Quốc Thắng, Thái Anh Tú, Phạm Minh Tâm, Phạm Văn Hùng, Đào Thị Minh Nhã, Nguyễn Thị Lệ Hương
Ứng dụng kỹ thuật Real-time PCR xác định số lượng bản sao ty thể từ mẫu mô FFPE
Application of Real-time PCR technique to determine number from FFPE samples
Tạp chí Y học Việt Nam (Tổng hội Y học Việt Nam)
2024
2
222-225
1859-1868
Ty thể là bào quan của tế bào nhân thực, chịu trách nhiệm cho việc tạo ra năng lượng. Bộ gen ty thể có cấu trúc phân tử DNA dạng vòng, dài 16569 cặp base chứa 37 gen mã hóa cho 13 protein, 22 tRNA, và 2 rRNA. Mỗi ty thể có thể chứa hàng trăm đến hàng ngàn bản sao, tùy thuộc vào loại tế bào. Tuy nhiên, sự thay đổi số lượng bản sao của DNA ty thể (mtDNA-CN) đã được chứng minh có liên quan với các trạng thái bệnh lý khác nhau bao gồm cả ung thư. Các mô cố định bằng formalin, đúc paraffin (FFPE) là nguồn vật liệu quý để chẩn đoán, nghiên cứu quá trình sinh bệnh của ung thư. Tuy nhiên, DNA được tách chiết từ các mô FFPE bị phân hủy mạnh do liên kết chéo giữa các sợi axit nucleic. Real-time PCR (Real-time PCR) là phương pháp tiêu chuẩn vàng để đo lường mtDNA-CN. Trong nghiên cứu này, chúng tôi thiết lập một phương pháp Real-time PCR sử dụng SYBR Green đơn giản để xác định mtDNA-CN từ những mẫu FFPE.
Mitochondria are organelles of eukaryotic cells responsible for energy production. The mitochondrial genome has a circular DNA structure, 16,569 base pairs long, containing 37 genes encoding 13 proteins, 22 tRNAs, and 2 rRNAs. Each mitochondrion can contain hundreds to thousands of copies, depending on the cell type. However, changes in the number of mitochondrial DNA copies (mtDNA-CN) have been shown to be associated with various pathological conditions, including cancer. Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues are valuable materials for diagnosing and studying cancer pathogenesis. However, DNA extracted from FFPE tissues is heavily degraded due to cross-linking between nucleic acid strands. Real-time PCR is the gold standard method for measuring mtDNA-CN. In this study, we established a simple SYBR Green Real-time PCR method to determine mtDNA-CN from FFPE samples.
TTKHCNQG, CVv 46