Sàng lọc và định danh các chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng sinh từ các mẫu sinh vật biển và trầm tích biển thuộc vùng biển đảo Lý Sơn, Quảng Ngãi

Chỉ số đề mục

Lĩnh vực nghiên cứu

Vi sinh vật học

Dạng tài liệu

Tác giả

Trần Thị Thanh Hoa, Lê Thị Hồng Minh, Vũ Thị Quyên, Nguyễn Mai Anh, Đoàn Thị Mai Hương, Châu Văn Minh, Phạm Văn Cường⁽¹⁾

Nhan đề

Sàng lọc và định danh các chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng sinh từ các mẫu sinh vật biển và trầm tích biển thuộc vùng biển đảo Lý Sơn, Quảng Ngãi

Nhan đề tiếng anh

Nguồn trích

Tạp chí Công nghệ Sinh học - Viện Khoa học và Công nghệ Việt Nam

Năm xuất bản

2020

Số

1

Trang

187-196

ISSN

1811-4989

Từ khóa

Xạ khuẩn, Hoạt tính kháng sinh, Sinh vật biển, Trầm tích, Định danh

Từ khóa tiếng anh

Tóm tắt

Hiện nay, xạ khuẩn biển được đánh giá là nguồn tiềm năng trong việc tìm kiếm các chất kháng sinh cũng như các chất có hoạt tính sinh học. Mục tiêu của nghiên cứu này là phân lập và sàng lọc các chủng xạ khuẩn có hoạt tính kháng khuẩn từ môi trường biển. 61 chủng xạ khuẩn đã được phân lập từ 80 mẫu sinh vật biển và trầm tích biển được thu thập từ đảo Lý Sơn, Quảng Ngãi. Các chủng được lên men trong môi trường A1, dịch lên men được chiết với ethyl acetate và làm bay hơi dung môi bằng cô quay chân không để tạo ra cặn chiết thô. Hoạt tính kháng sinh của các cặn chiết được thực hiện trên 7 chủng vi sinh vật kiểm định (VSVKĐ), gồm ba chủng vi khuẩn Gram âm (Escherichia coli ATCC25922, Pseudomonas aeruginosa ATCC27853, Salmonella enterica (ATCC13076), ba chủng Gram dương (Enterococcus faecalis ATCC29212, Stapphylococus aureus ATCC25923, Bacillus cereus ATCC 13245), và nấm men Candida albicans ATCC10231. Từ kết quả sàng lọc hoạt tính, đã chọn được 3 chủng xạ khuẩn (G330, G336 và G361) có hoạt tính kháng khuẩn cao nhất, ức chế 5/7 chủng VSVKĐ với các giá trị nồng độ ức chế tối thiểu (MIC) từ 4 đến 256 µg/ml tùy thuộc vào từng chủng kiểm định. Cụ thể, cả ba chủng này đều ức chế C. albicans ATCC10231 và ba chủng Gram dương. Ngoài ra, G330 và G336 còn thể hiện hoạt tính ức chế chủng Gram âm S. enterica ATCC13076 với giá trị MIC = 256 µg/ml và G361 có khả năng ức chế khá tốt đối với E. coli ATCC25922 với giá trị MIC là 8 µg/ml. Nghiên cứu đặc điểm hình thái và phân tích trình tự gen 16S rRNA, kết quả cho thấy chủng G330 thuộc chi Streptomyces, các chủng G336 và G361 được xác định là thành viên của chi Salinispora, với độ tương đồng hơn 99% so với các trình tự gen 16S rRNA trên ngân hàng gen quốc tế. Kết quả nghiên cứu cho thấy môi trường biển có tiềm năng lớn để phân lập các chủng xạ khuẩn cho mục đích tìm kiếm các chất kháng khuẩn cũng như các hoạt chất sinh học khác.

Tóm tắt tiếng anh

Kí hiệu kho

TTKHCNQG, CVv 262

File toàn văn

Xem toàn văn

Tài liệu tham khảo

[1] Williams PG, Asolkar RN, Kondratyuk T, Pezzuto JM, Jensen PR, Fenical W (2007), Saliniketals A and B, bicyclic polyketides f-rom the marine actinomycete Salinispora arenicola.J Nat Prod 70:83–88. DOI:10.1021/np0604580.,
[2] (2014), Antimicrobial resistance: global report on surveillance.,Switzerland: World Health Organization.
[3] Trerner HD, Buckus EJ (1963), System of color wheels for Streptomyces taxonomy.,Appl Microbiol 11: 335 – 338.
[4] Sumei L, Tian X, NiuS, Zhang W, ChenY (2011), Pseudonocardians A-C Pseudonocardians A-C, New diazaanthraquinone derivatives f-rom a deap-sea actinomycete Pseudonocardia sp.,SCSIO 01299. Marine Drugs9:1428-1439.
[5] Sunaryanto R, Marwoto B (2010), Marine actinomycetes screening of Banten west coast and their antibiotics purification.,Biodiversitas 11(4): 176-181
[6] Powers JH (2004), Antimicrobial drug developmentthe past, the present, and the future.,Clin Microbiol Infect 10(4): 23–31.
[7] Paul R J, Bradley SM, William F (2015), The marine actinomycete genus Salinispora: A model organism for secondary metabolite discovery.,Nat Prod Rep 32(5): 738–751.doi: 10.1039/c4np00167b
[8] Oskay M, Same A, Azeri C (2004), Antibacterial activity of some actinomycetes isolated f-rom farming soils of Turkey.,Afr J Biotechnol 3: 441-456.
[9] Nguyễn Vĩnh Hà (2002), Khảo sát họat tính đối kháng của các chủng nấm sợi phân lập từ rừng ngập mặn khu vực Giao Thủy, Nam Định và Thái Thụy, Thái bình,,Luận án Thạc sĩ Sinh học, Trường Đại học Sư Phạm Hà Nội: 5- 30.
[10] Mukherjee G, Sen SK (2004), C-haracterization and identification of chitinase producing Streptomyces venezulae P10.,J Exp Biol Indian 42: 541–544
[11] Maruyama HB, Suhara Y, Suzuki W, Maeshima Y, Shimizu MA (1975), New antibiotic fumaramidmycin I- Production, biological properties and c-haracterization of producer strain.,J Antibiot 28: 636–647.
[12] Matsuda S, Adachi K, Matsuo Y, Nukina M, Shizuri Y (2009), Salinisporamycin, a novel metabolite f-rom Salinispora arenicora.,J Antibiot 62:519–526. DOI: 10.1038/ja.2009.75
[13] Khan ST, Komaki H, Motohashi K, Kozone I, Mukai A, Takagi M, Shin-ya K (2011), Streptomyces associated with a marine sponge Haliclona sp. biosynthetic genes for secondary metabolites and products.,Environ Microbiol Black Sci Pub13: 391-403
[14] Janso JE, Haltli BA, Eustáquio AS, Kulowski K, Waldman AJ, Zha L, Nakamura H, Bernan VS, He H, Carter GT, Koehn FE, Balskus EP (2014), Discovery of the lomaiviticin biosynthetic gene cluster in Salinispora pacifica.,Tetrahedron 70:4156- 4164. DOI: 10.1016/j.tet.2014.03.009.
[15] Imhoff JF (2016), Natural products f-rom marine fungi-Still an underrepresented resource.,Mar Drugs 14(1): 19 https://doi.org/10.3390/md14010019.
[16] He H, Ding WD, Bernan VS, Ric-hardson AD, Ireland CM, Greenstein M, Ellestad GA, Carter GT (2001), Lomaiviticins A and B, potent antitumor antibiotics f-rom Micromonospora lomaivitiensis.,J Am Chem Soc 123:5362–5363.
[17] Hadacek F, Greger H (2000), Test of antifungal natural products methodolagies, comparability of result and assay choise.,Phytochem Anal 90: 137- 147.
[18] Goodfellow M, Davenport R, Stainsby FM, Curtis TP (1996), Actinomycete diversity associated with foaming in activated sludge plants.,Microbiol Biotechnol J Ind 17: 268-280.
[19] Cheng C, Eman M (2017), Isolation of Petrocidin A, a new cytotoxic cyclic dipeptide f-rom the marine sponge-derived bacterium Streptomyces sp.,SBT348. Mar Drugs 15(12):383 https://doi.org/10.3390/md15120383
[20] Chen L, Todd R, Kiehlbauch J, Wal-ters M, Kallen A (2017), Notes f-rom the Field: PanResistant New Delhi metallo-beta-lactamase-producing Klebsiella pneumoniae - Washoe County, Nevada, 2016.,Morb Mortal Wkly Rep 66(1): 33.
[21] Cédric O, Skylar C, Bindiya K, Mashal MA, Haipeng L, Anna O, Quan S, Van Cuong Pham, Catherine LS, Brian TM, Alexander SM (2013), Tool for c-haracterizing bacterial protein synthesis inhibitors.,Antimicrob Agent Chemother 57: 5994- 6002.
[22] Basilio A, González I, Vicente MF, Gorrochategui J, Cabello A, González A, Genilloud O. (2003), Patterns of antimicrobial activities f-rom soil actinomycetes isolated under defferent conditions of pH and salinity.,J Appl Microbiol 95: 814-823.
[23] Asolkar RN, Kirkland TN, Jensen PR, Fenical W (2010), Arenimycin, an antibiotic effective against rifampin- and methicillin-resistant Staphylococcus aureus f-rom the marine actinomycete Salinispora arenicola.,J Antibiot 63:37-39. DOI:10.1038/ja.2009.114
[24] Arai T (1975), Culture Media for Actinomycetes.,The Society for Actinomycetes Japan, Tokyo: 1-31.
[25] Arnold LD, Sergio S (2009), Microbial drug discovery: 80 years of progress.,J Antibiotics 62: 5-16.