BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  22,653,781
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

76

Ung thư học và phát sinh ung thư

Nguyễn Cường Quốc, Lê Đăng Quang, Nguyễn Duy Tuấn, Nguyễn Trọng Tuân, Bùi Thị Bửu Huê, Trần Thanh Mến, Trần Quang Đệ(1)

Nghiên cứu docking phân tử đa mục tiêu tương tác với các thụ thể ERα, PR, EGFR và CK2 của một số hợp chất N-hydroxycinnamamide

Multitargeted molecular docking study of some N-hydroxycinnamamide compounds on ERα, PR, EGFR, and CK2 receptors

Khoa học & công nghệ Việt Nam

2023

06B

47 - 51

1859-4794

Ung thư vú, Phân tử, Đa mục tiêu, Tương tác, Belinostat, Docking, GOLD 5.3, N-hydroxycinnamamide

Belinostat, Breast cancer, Docking, GOLD 5.3, N-hydroxycinnamamide

Hóa trị liệu ung thư vú được thực hiện bằng cách nhắm mục tiêu vào các thụ thể như ERα (estrogen alpha), PR (progesterone), EGFR (yếu tố tăng trưởng biểu bì) và CK2 (protein kinase). Trong nghiên cứu này, các cấu trúc của ERα, PR, EGFR và CK2 được lấy từ ngân hàng dữ liệu protein và được docking với các hợp chất tương tự belinostat bằng cách sử dụng phần mềm GOLD 5.3. Kết hợp cả hai tiêu chí phân tích điểm số gắn kết và khả năng liên kết, một số chất tương tự belinostat được cho là ứng cử viên tiềm năng để ức chế ung thư vú. Các hợp chất tiềm năng liên kết chặt chẽ với tư thế ràng buộc tương ứng trong từng thụ thể hormone, chủ yếu bằng các liên kết hydro giữa các hợp chất được nghiên cứu và các amino acid trong vị trí hoạt động. Ba hợp chất (C3, C5 và C8) cho kết quả tốt nhất. Trong số đó, hợp chất C5 là ứng cử viên tốt nhất cho nhắm mục tiêu vào thụ thể CK2. Nghiên cứu này gợi ý rằng, các hợp chất N-hydroxycinnamamide có thể được nghiên cứu và đánh giá thêm cho điều trị ung thư vú.

Breast cancer chemotherapy is marked by targeting the function of receptors such as ERα (estrogen receptor alpha), PR (progesterone receptor), EGFR (epidermal growth factor receptor), and CK2 (protein kinase receptor). In this study, the structures of ERα, PR, EGFR and CK2 were obtained f-rom the protein data bank and docked with belinostat analogues using GOLD Suite 5.3 software. Combining both docking score and binding mode analysis criteria, some belinostat analogues exhibited as potential candidates to inhibit the function of breast cancer. The potential compounds are well-bound in their respective binding pose of the hormone receptors. This is mainly based on hydrogen bond interactions between the studied compounds and in-pose amino acids. Three compounds (C3, C5 and C8) gave the best results. Among them, compound C5 stood out as the best candidate for target CK2. This study suggested that N-hydroxycinnamamide can be further investigated and evaluated for breast cancer treatment.

TTKHCNQG, CVv 8

Xem toàn văn
  • [1] Nguyễn Cường Quốc; Nguyễn Thị Huỳnh Trang; Huỳnh Thanh Ngân (2021), Tổng hợp, tiếp cận dược lý và đánh giá khả năng ức chế enzym histone deacetylase 8 (HDAC8) in silico của một số dẫn xuất tương tự belinostat.,Tạp chí Khoa học, Trường Đại học Cần Thơ, 57(2), tr.58-66.
  • [2] Nguyễn Cường Quốc; Nguyễn Thị Huỳnh Trang; Đặng Thị Thu Thảo (2020), Thiết kế, tổng hợp và đánh giá khả năng ức chế enzyme histone deacetylase (HDAC) in silico của một số dẫn xuất tương tự belinostat.,Tạp chí Khoa học, Trường Đại học Cần Thơ, 56, Chuyên đề tự nhiên, tr.1-9.
  • [3] Nguyễn Cường Quốc; Nguyễn Thị Huỳnh Trang; Đặng Thị Thu Thảo (2020), Ứng dụng phản ứng Wittig và tác nhân khử CH3 COONH4 /Zn vào tổng hợp toàn phần hoạt chất belinostat.,Tạp chí Phân tích Hóa, Lý và Sinh học, 25(4), tr.40-44.
  • [4] H. Gohlke; M. Hendlich; G. Klebe (2000), Knowledge-based scoring function to predict protein-ligand interactions.,Journal of Molecular Biology, 295(2), pp.337-356.
  • [5] J. Jiménez; M. Skalic; G. Martinez-Rosell (2018), K deep: Protein-ligand absolute binding affinity prediction via 3d-convolutional neural networks.,Journal of Chemical Information and Modeling, 58(2), pp.287-296.
  • [6] G. Jones; P. Willett; R.C. Glen (1997), Development and validation of a genetic algorithm for flexible docking.,Journal of Molecular Biology, 267(3), pp.727-748.
  • [7] G. Jones; P. Willett; R. C. Glen (1995), Molecular recognition of receptor sites using a genetic algorithm with a description of desolvation.,Journal of Molecular Biology, 245(1), pp.43-53.
  • [8] N. Guex; M.C. Peitsch (1997), SWISS-MODEL and the Swiss-Pdb Viewer: An environment for comparative protein modeling.,Electrophoresis, 18(15), pp.2714-2723.
  • [9] R. Prudent; V. Moucadel; C.H. Nguyen (2010), Antitumor activity of pyridocarbazole and benzopyridoindole derivatives that inhibit protein kinase CK2.,Cancer Research, 70(23), pp.9865-9874.
  • [10] Cai-Hong Yun; Titus J. Boggon; Yiqun Li (2007), Structures of lung cancer-derived EGFR mutants and inhibitor complexes: Mechanism of activation and insights into differential inhibitor sensitivity.,Cancer Cell, 11(3), pp.217-227.
  • [11] K.P. Madauss; S.J. Deng; R.J. Austin (2004), Progesterone receptor ligand binding pocket flexibility: Crystal structures of the norethindrone and mometasone furoate complexes.,Journal of Medicinal Chemistry, 47(13), pp.3381-3387.
  • [12] Andrew K. Shiau; Danielle Bartad; Paula M. Loria (1998), The structural basis of estrogen receptor/coactivator recognition and the antagonism of this interaction by tamoxifen.,Cell, 95(7), pp.927-937.
  • [13] Z. Wang; H. Sun; X. Yao (2016), Comprehensive evaluation of ten docking programs on a diverse set of protein-ligand complexes: The prediction accuracy of sampling power and scoring power.,Physical Chemistry Chemical Physics, 18(18), pp.12964-12975.
  • [14] N.S. Pagadala; K. Syed; J. Tuszynski (2017), Software for molecular docking: A review.,Biophysical Reviews, 9(2), pp.91-102.
  • [15] Y. Zuo; H. Xu; Z. Chen (2020), 17-AAG synergizes with Belinostat to exhibit a negative effect on the proliferation and invasion of MDA-MB-231 breast cancer cells.,Oncology Reports, 43(6), pp.1928-1944.
  • [16] P. Lu; Y. Gu; L. Li (2019), Belinostat suppresses cell proliferation by inactivating Wnt/β-catenin pathway and promotes apoptosis through regulating PKC pathway in breast cancer.,Artificial Cells, Nanomedicine and Biotechnology, 47(1), pp.3955-3960.
  • [17] J. Feng; H. Fang; X. Wang (2011), Discovery of N-hydroxy-4-(3- phenylpropanamido) benzamide derivative 5j, a novel histone deacetylase inhibitor, as a potential therapeutic agent for human breast cancer.,Cancer Biology & Therapy, 11(5), pp.477-489.
  • [18] M.K. Ediriweera; K.H. Tennekoon; S.R. Samarakoon (2019), Emerging role of histone deacetylase inhibitors as anti-breast-cancer agents.,Drug Discovery Today, 24(3), pp.685-702.
  • [19] S. Nagini (2017), Breast cancer: Current molecular therapeutic targets and new players.,Anti-Cancer Agents in Medicinal Chemistry (Formerly Current Medicinal Chemistry-Anti-Cancer Agents), 17(2), pp.152-163.
  • [20] A.J. Rabalski; L. Gyenis; D.W. Litchfield (2016), Molecular pathways: Emergence of protein kinase CK2 (CSNK2) as a potential target to inhibit survival and DNA damage response and repair pathways in cancer cells.,Clinical Cancer Research, 22(12), pp.2840-2847.
  • [21] K. Ahmed; D.A. Gerber; C. Cochet (2002), Joining the cell survival squad: An emerging role for protein kinase CK2.,Trends in Cell Biology, 12(5), pp.226- 230.
  • [22] K.L. Mueller; Z.Q. Yang; R. Haddad (2010), EGFR/Met association regulates EGFR TKI resistance in breast cancer.,Journal of Molecular Signaling, 5(1), pp.1-8.
  • [23] R. Costa; A.N. Shah; C.A. Santa-Maria (2017), Targeting epidermal growth factor receptor in triple negative breast cancer: New discoveries and practical insights for drug development.,Cancer Treatment Reviews, 53, pp.111-119.
  • [24] Z.Y. Wang; L.J.M. Yin (2015), Estrogen receptor alpha-36 (ER-α36): A new player in human breast cancer.,Molecular and Cellular Endocrinology, 418, pp.193-206.
  • [25] H. Kuhl; H.J.C. Schneider (2013), Progesterone-promoter or inhibitor of breast cancer.,Climacteric, 16(1), pp.54-68.