Xác định mã vạch ADN phục vụ giám định loài Phi điệp tím Hòa Bình (Dendrobium sp.)

Chỉ số đề mục

Lĩnh vực nghiên cứu

40601 - Công nghệ gen; nhân dòng vật nuôi;

Dạng tài liệu

Tác giả

Bùi Thị Mai Hương, Nguyễn Văn Việt⁽¹⁾, Hà Văn Huân

Nhan đề

Xác định mã vạch ADN phục vụ giám định loài Phi điệp tím Hòa Bình (Dendrobium sp.)

Nhan đề tiếng anh

Nguồn trích

Nông nghiệp & Phát triển nông thôn

Năm xuất bản

2021

Số

08

Trang

40 - 45

ISSN

1859-4581

Từ khóa

Mã vạch ADN, Giám định loài, Phi điệp tím, Dendrobium sp.

Từ khóa tiếng anh

Tóm tắt

Lan Phi điệp tím là các loài cây có giá trị kinh tế cao, làm cảnh, làm thuốc. Phi điệp tím Hòa Bình đặc trưng riêng so với các loại phi điệp có nơi phân bố khác về hình dạng, màu sắc hoa. Do vậy, việc xác định các đoạn mã vạch ADN để định danh cho loài Phi điệp tím Hòa Bình (Dendrobium sp.) phục vụ giám định loài là cần thiết. ADN tổng số được phân lập từ lá cây Phi điệp tím. Các đoạn mã vạch ADN (rbcL, TmH-psbA và ycb được nhàn bản từ ADN tổng số của Phi điệp tím bàng kỹ thuật PCR. Sản phẩm PCR chỉ ra rằng các băng thu được có kích thước giống với kích thước dự kiến, sau đó sản phẩm PCR được xác định trình tự. Kết quả phàn tích trinh tự đã chi ra, đoạn rốcL có 740 nucleotide, đoạn TmH-psbA có 844 nucleotide và đoạn ycícó 821 nucleotide. Các trinh tự này sau đó được xừ lý trên Ngân hàng Gen quốc tế (NCBI) đã tìm ra loài Phi điệp tím Hòa Bình thuộc loài Dendrobium anosmun với các tý lệ tương đồng 100% của đoạn gen rbcL, trnH-psbA và 96,16% của đoạn ycf. So sánh sự khác biệt của Phi điệp tím Hòa Bình với các loài Lan (Dendrobium tosaense) khác cho thấy đoạn gen rbcL tương đồng 100% với loài Dendrobium tosaense, đoạn gen TnM-psbA tương đồng 98,52% với loài Dendrobium tosaense, đoạn gen y c f tương đồng 92,61% với loài Dendrobium tosaense. Sử dụng chỉ thị ycf là tốt nhất làm mã vạch ADN để giám định loài Phi điệp tím ở Việt Nam.

Tóm tắt tiếng anh

Kí hiệu kho

TTKHCNQG, CVv 201

File toàn văn

Xem toàn văn

Tài liệu tham khảo

[1] Von Crautlein M. K. H.; et al. (2011), ADN barcoding: a tool for improved taxon identification and detection of species diversity.,Biodiversity and conservation 20: 373 - 389.
[2] Kress J. W; Wurdack K. J; Zimmer E. A; Weigt L. A; Janzen D. H. (2005), Use of ADN barcodes to identify flowering plants.,Proc. Natl. Acad. Sei. U.SA. 102 (23): 8369-74.
[3] Ford C. S; Ayres K. L; Toomey N et al. (2009), Se-lection of candidate coding ABN barcoding regions for use on ADN plants.,Botanical Journal of the Linnean Society. 159 (1): 1-11.
[4] Chen S. Y. H; Han J.; Liu C.; Song J.; et al. (2010), Validation of the /752 region as a novel ADN barcodes for identifying medicinal plant species.,Pios one 5: e8613.
[5] Chase M. W; et al. (2005), Land plants and ADN barcodes: Short - term and long-term goals.,Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 360:1889 - 1895.
[6] Aron J. F; Kevin S. B; Prasad R. K etal. (2008), Multiple multilocus ADN barcodes f-rom the plastid genome discriminate plant species equally well.,PLoS ONE.? (7):e2802.
[7] Alvarez I. W. J. F. (2003), Ribosomal ITS sequences and plant phylogenic inference.,Molecular phylogentics and Evolution 29: 417 - 434.
[8] Anders R. (2012), ADN barcoding as a tool for the identtfcation of unknown plant material: A case study on medicinal roots traded in the medina of Marrakech.,M.SC thesis, Uppsala University CBOL ABS Brochure.