BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  20,044,362
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

87

Sinh học biển và nước ngọt

BB

Nguyen Thi XuanThuy, Nguyen Nhat Nhu Thuy, Nguyen Trung Hieu, Nguyen Manh Linh, Cao Van Luong, Nguyen Thi My Ngan, Dao Viet Ha, Nguyen Xuan Vy, Nguyễn Mạnh Linh(1), Nguyễn Xuân Vỵ(2)

Đặc điểm cấu trúc bậc cấp ITS2 cho thấy sự khác biệt về mặt địa lý của thảm cỏ biển Halophila ovalis (Hydrocharitaceae) trên thế giới

Characterizing of ITS2 secondary structures reveals the geographical differentiation of seagrass Halophila ovalis (Hydrocharitaceae) in the world

Khoa học và Công nghệ Biển

2024

04

387-398

1859-3097

Đặc điểm, Cấu trúc, Bậc cấp ITS2, Sự khác biệt, Địa lý, Thảm cỏ biển, Thế giới

Cỏ biển Halophila là một trong những chi Hydrocharitaceae có số lượng loài nhiều nhất, khoảng 20 loài. Trong số đó, H. ovalis, H. Major, H. Minor và H. nipponica là những loài có quan hệ họ hàng gần gũi. Đây là lần đầu tiên cấu trúc thứ cấp ITS2 và tiện ích phát sinh gen của chúng trong chi này được báo cáo trên toàn thế giới. Phân tích phát sinh loài dựa trên 205 bp của ITS2 cho thấy bốn nhánh tương ứng với các loài trên. Cấu trúc thứ cấp ITS2 cho thấy cái nhìn sâu sắc về Halophila ovalis từ bờ biển phía Đông châu Phi. Halophila ovalis từ bờ biển phía Đông châu Phi cho thấy một biến thể khác biệt ở Helix 1, 2 và 3 so với quần thể trên toàn thế giới. Vì vậy, locus ITS2 nên được sử dụng làm mã vạch DNA để xác định loài Halophila.

The seagrass Halophila is one of the genera of Hydrocharitaceae that shows the highest number of species, with around 20 species. Among them, H. ovalis, H. major, H. minor, and H. nipponica are closely related species. It is the first time ITS2 secondary structures and their phylogenetic utility in this genus were reported worldwide. Phylogenetic analysis based on 205 bp of ITS2 showed four clades corresponding to above species. ITS2 secondary structures showed insight into Halophila ovalis from the East coast of Africa. Halophila ovalis from the East coast of Africa showed a distinct variant in Helix 1, 2, and 3 compared to the worldwide populations. Therefore, the ITS2 locus should be used as a DNA barcode for identifying Halophila species.

TTKHCNQG, CVv 280

Xem toàn văn