BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  26,799,688
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Cây lương thực và cây thực phẩm

Văn Quốc Giang(1), Trần In Đô(2), Nguyễn Văn Mạnh, Nguyễn Thành Tâm, Huỳnh Như Điền, Lê Thị Hồng Thanh, Huỳnh Kỳ(3)

Đa dạng di truyền của họ gene OsHKT ở 41 giống lúa địa phương Đồng bằng sông Cửu Long

The variation of OsHKT family genes in 41 Mekong delta rice varieties

Khoa học (Đại học Cần Thơ)

2021

6

224-230

1859-2333

Giống lúa bản địa, OsHKT, OsHKT 1,5, OsHKT 2,1, SNP

Local rice, OsHKT, OsHKT 1,5, OsHKT 2,1, SNP

OsHKT là họ gene đóng vai trò quan trọng trong cơ chế chống chịu mặn của cây lúa. Trong nghiên cứu này, các đoạn DNA của hai nhóm gene OsHKT1 và OsHKT2 từ 41 giống lúa địa phương vùng ĐBSCL đã được giải trình tự, nhằm tìm ra mối tương quan di truyền giữa các giống lúa. Kết quả cho thấy, sự đa hình được thể hiện nhiều nhất ở hai gene OsHKT1;5 và OsHKT2;1 với tất cả 41 giống lúa cho sự đa hình ở gene OsHKT1;5 và 25 giống lúa đối với gene OsHKT2;1. Kết quả này là cơ sở cho các nghiên cứu tiếp theo về khả năng chống chịu mặn liên quan đến họ gene OsHKT của các giống lúa địa phương vùng Đồng bằng sông Cửu Long.

OsHKT is a family of genes that play an important role in the salt tolerance mechanism of rice. In this study, DNA fragments of two gene groups OsHKT1 and OsHKT2 from 41 local rice varieties in the Mekong Delta were sequenced, in order to find out the genetic relationship among them. The results showed that the polymorphism was most expressed in the two genes OsHKT1;5 and OsHKT2;1 with all of 41 rice varieties showing polymorphisms in the OsHKT1;5 gene, and 25 rice varieties were variable in the OsHKT2;1 gene. This result is the basis for further studies on salt tolerance related to the OsHKT gene family of local rice varieties in the Mekong Delta.

TTKHCNQG, CVv 403

Xem toàn văn
  • [1] Zhu, J. K. (2001), Plant salt tolerance,Trends Plant Sci, 6(2), 66-71. doi:10.1016/s1360- 1385(00)01838-0
  • [2] Thomson, M. J., de Ocampo, M., Egdane, J., Rahman, M. A., Sajise, A. G., Adorada, D. L., Tumimbang-Raiz, E., Blumwald, E., Seraj, Z. I., Singh, R. K., Gregorio, G. B., & Ismail, A. M. (2010), C-haracterizing the Saltol Quantitative Trait Locus for Salinity Tolerance in Rice,Rice, 3(2), 148-160. doi:10.1007/s12284-010-9053-8
  • [3] Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A., & Kumar, S. (2013), MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0,Molecular Biology and Evolution, 30(12), 2725- 2729. doi:10.1093/molbev/mst197
  • [4] Schachtman, D. P., & Schroeder, J. I. (1994), Structure and transport mechanism of a highaffinity potassium uptake transporter f-rom higher plants,Nature, 370(6491), 655-658. doi:10.1038/370655a0
  • [5] Sanger, F., Nicklen, S., & Coulson, A. R. (1977), DNA sequencing with chain-terminating inhibitors,Proc Natl Acad Sci U S A, 74(12), 5463-5467. doi:10.1073/pnas.74.12.5463
  • [6] Roy, S. J., Negrão, S., & Tester, M. (2014), Salt resistant crop plants,Current Opinion in Biotechnology, 26, 115-124. doi:https://doi.org/10.1016/j.copbio.2013.12.004
  • [7] Munns, R., & Tester, M. (2008), Mechanisms of Salinity Tolerance,Annual Review of Plant Biology, 59(1), 651-681. doi:10.1146/annurev.arplant.59.032607.092911
  • [8] Mishra, S., Singh, B., Panda, K., Singh, B. P., Singh, N., Misra, P., Rai, V., & Singh, N. K. (2016), Association of SNP Haplotypes of HKT Family Genes with Salt Tolerance in Indian Wild Rice Germplasm,Rice (New York, N.Y.), 9(1), 15. doi:10.1186/s12284-016-0083-8
  • [9] Istvan Lazar Jr., P., & Istvan Lazar Sr., PhD. (2019), GelAnalyzer (Version 19.1). Retrieved fro,Retrieved f-rom http://www.gelanalyzer.com/index.html
  • [10] Hossain, H., Rahman, M. A., Alam, M. S., & Singh, R. K. (2015), Mapping of Quantitative Trait Loci Associated with Reproductive-Stage Salt Tolerance in Rice,Journal of Agronomy and Crop Science, 201(1), 17-31. doi:https://doi.org/10.1111/jac.12086
  • [11] Horie, T., Yoshida, K., Nakayama, H., Yamada, K., Oiki, S., & Shinmyo, A. (2001), Two types of HKT transporters with different properties of Na+ and K+ transport in Oryza sativa,Plant J, 27(2), 129-138. doi:10.1046/j.1365- 313x.2001.01077.x
  • [12] Heidari, P., Falaknaz, M., Mehrabi, A., Kahrizi, D., & Yari, K. (2011), Phylogenetic Study of HKTGene in Gramineae via Insilico cDNA-AFLP Analysis,American Journal of Scientific Research, 19, 6-12
  • [13] Gregorio, G. B., & Senadhira, D. (1993), Genetic analysis of salinity tolerance in rice (Oryza sativa L.),Theoretical and Applied Genetics, 86(2), 333-338. doi:10.1007/BF00222098
  • [14] Gomez-Porras, J., Riaño Pachón, D. M., Benito, B., Haro, R., Sklodowski, K., Rodríguez-Navarro, A., & Dreyer, I. (2012), Phylogenetic Analysis of K+ Transporters in Bryophytes, Lycophytes, and Flowering Plants Indicates a Specialization of Vascular Plants,Frontiers in Plant Science, 3, 167. doi:10.3389/fpls.2012.00167
  • [15] Doyle, J. J., & Doyle, J. L. (1990), Isolation of plant DNA f-rom fresh tissue,Focus, 12(1):13-15
  • [16] Cui, L., He, Y., Li, Y., & Xie, X. (2017), Expression patterns of OsHKT genes in rice,Chinese Journal of Rice Science, 31, 559-567. doi:10.16819/j.1001-7216.2017.7070
  • [17] Cotsaftis, O., Plett, D., Johnson, A. A., Walia, H., Wilson, C., Ismail, A. M., Close, T. J., Tester, M., & Baumann, U. (2011), Root-specific transcript profiling of contrasting rice genotypes in response to salinity stress,Mol Plant, 4(1), 25- 41. doi:10.1093/mp/ssq056
  • [18] Bafeel, S. (2013), Phylogeny of the Plant Salinity Tolerance Related HKT Genes,Intl. J. Biol., 5, 64-68. doi:10.5539/ijb.v5n2p64
  • [19] Amrutha, R. N., Sekhar, P. N., Varshney, R. K., & Kishor, P. B. K. (2007), Genome-wide analysis and identification of genes related to potassium transporter families in rice (Oryza sativa L.),Plant Science, 172(4), 708-721. doi:https://doi.org/10.1016/j.plantsci.2006.11.019
  • [20] Almeida, P., Katschnig, D., & de Boer, A. H. (2013), HKT transporters--state of the art,Int J Mol Sci, 14(10), 20359-20385. doi:10.3390/ijms141020359