BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  19,976,647
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Công nghệ sinh học

Võ Thị Bích Thủy(1), Nguyễn Tuấn Hùng, Nghiêm Ngọc Minh

Phân tích trình tự gen 16s rRNA từ các chủng leptospira gây bệnh của Việt Nam và dự đoán In-Silico các epitope tiềm năng trên hai Lipoprotein màng ngoài Lipl21, Lipl32

Analyzing 16S rRNA sequences from vietnamese pathogenic leptospira strains and In-silico prediction of potential antigenic epitopes on Lipl21, Lipl32 outer membrane lipoproteins

Công nghệ Sinh học

2018

16

745-756

1811-4989

Trình tự gen, Gen 16S rRNA, Leptospira, Leptospirosis, Vacxin tái tổ hợp

Antigenic genes, Leptospiraceac, Leptospirosis recombinant vaccine, 16S rRNA gene sequencing

Bệnh xoắn khuẩn (Leptospirosis) được xác định là một bệnh truyền nhiễm mới nổi, có khả năng gây bệnh trên động vật và lây lan sang người. Bệnh do Leptospira gây ra. Mặc dù đã có một số loại vacxin phòng bệnh do Leptospira nhưng đáp ứng miễn dịch không cao, thời gian bảo hộ không dài. Trong thí nghiệm này, một đoạn 550 bp của gen RNA ribosome (16S rRNA) của 6 chủng Leptospira gây bệnh xoắn khuẩn và đang được sử dụng làm chủng chế vacxin vô hoạt ở Việt Nam (bao gồm Pomona, Canicola, Mitis, Ictero haemohagiae, Bataviae, và Grippotyphosa) đã được giải trình tự. Kết quả cho thấy một mối quan hệ di truyền gần gũi của chủng L.Pomona_VN với L.Hardjo (bootstrap 99%). Ngược lại, L.Canicola_VN và L.Ictero haemohagiae_VN dường như có mối quan hệ di truyền yếu với các chủng cổ điển L.Canicola, L. Grippotyphosa (bootstrap 62%). Các chủng khác như L.Mitis_VN và L.Grippotyphosa_VN xuất hiện cùng nhánh, nhưng lại có mối quan hệ di truyền yếu với nhóm chị em của chúng là chủng L.Bataviae_VN (bootstrap 62%). Chúng tôi cũng lựa chọn 6 gen, gồm các globulin miễn dịch như protein A và B (gen LigA và LigB), protein màng ngoài (gen OmpL1), và lipopolysaccharide (gen LipL32, LipL41 và LipL21) để kiểm tra sự xuất hiện của các gen này ở các chủng Leptospira trên bằng phương pháp phản ứng chuỗi polymerase (PCR). Có 3 gen (gen LipL32, LipL21 và LigA) xuất hiện trong tất cả các chủng, riêng gen OmpL1 chỉ có ở 4 chủng (Bataviae, Canicola, Grypothyphosa và Mitis), trong khi đó gen LipL41 và LigB đã không xuất hiện trong bất kỳ chủng Leptospira nào. Một tập hợp các epitope tiềm năng trong cả tế bào lympho T và B của protein LipL21 và LipL32 đã được tìm kiếm bằng các công cụ tin sinh. Kết quả chỉ ra, có 3 vùng đa epitope (1 vùng và 95 epitope kháng nguyên cho cả hai tế bào B và T của LipL21; 2 vùng và 124 epitope kháng nguyên cho cả hai tế bào B và T của LipL32). Cần nghiên cứu sâu hơn về sinh học phân tử để tạo ra được một loại vac xin tái tổ hợp mới ứng dụng trong phòng và điều trị bệnh leptospirosis cho động vật và người ở Việt Nam.

Leptospirosis, a zoonosis caused by Leptospira, is recognized as an emergent infectious disease. In currently, the lack of adequate diagnostic tools, vaccines are an attractive intervention strategy. In this experiment, a 550 bp fragment of large ribosomal RNA gene (16S rRNA) was sequenced and constructed phylogenetic tree from a panel of six Vietnamese pathogenic strains of Leptospira spirochetes (e.g., Pomona, Canicola, Mitis, Ictero haemohagiae, Bataviae, and Grippotyphosa). The results showed a close relationship of L.Pomona_VN and L.Hardjo (bootstrap 99%). L.Canicola_VN and L.Ictero haemohagiae_VN appeared to be weak related to the classic L.Canicola, L. Grippotyphosa, these assemblage have a bootstrap support of 62%. The other strains (L.Mitis_VN and L.Grippotyphosa_VN) were appeared monophyletic, while their sister group (L.Bataviae_VN) relationship found only weak support (bootstrap 62%). We also selected six genes [e.g. the immunoglobulin like proteins A and B (LigA and LigB genes), outer membrane protein (OmpL1 gene), and lipopolysaccharide (LipL32, LipL41, and LipL21 genes)] and checked gene expression in these Leptospira strains by polymerase chain reaction (PCR) method. There were three genes (e.g., LipL32, LipL21, and LigA genes) expressed in all strains, OmpL1 gene occured in 4 strains (L.Bataviae_VN, L.Canicola_VN, L.Grippotyphosa_VN and L.Mitis_VN), whereas LipL41 and LigB genes did not appear in any Leptospira strains. A multi-antigenic epitope potential of two gene (Lip L21 and Lip L32) was predicted by bioinformatic tools for designing a recombinant vaccine against leptospirosis. There were 3 multi-epitope regions (1 region and 95 antigenic epitope for B and T cells of LipL21 peptide; 2 regions and 124 antigenic epitope for both B and T cells of LipL32 peptide). It should be more of the deeply molecular biology studies to confirm the level agglutinating, antigen cleavage, peptide specificity matrices as well as neutralizing antibodies in the immune responses of DNA vaccine of these genes.

TTKHCNQG, CVv 262

Xem toàn văn