So sánh tính hiệu quả và kinh tế của ba phương pháp ly trích ADN trên cây lúa

Chỉ số đề mục

Lĩnh vực nghiên cứu

Trồng trọt

Dạng tài liệu

Tác giả

Lã Cao Thắng⁽²⁾, Hà Minh Luân⁽³⁾, Bùi Thanh Liêm⁽¹⁾

Nhan đề

So sánh tính hiệu quả và kinh tế của ba phương pháp ly trích ADN trên cây lúa

Nhan đề tiếng anh

A comparison on efficiency and economy of three DNA extraction methods in rice

Nguồn trích

Khoa học công nghệ nông nghiệp Việt Nam

Năm xuất bản

2020

Số

6

Trang

46-49

ISSN

1859-1558

Từ khóa

Ly trích ADN, Hiệu quả, Cây lúa, PCR, NaOH-Tris

Từ khóa tiếng anh

DNA extraction, efficiency, rice, PCR

Tóm tắt

Ba phương pháp ly trích ADN được nghiên cứu để đánh giá tính hiệu quả và kinh tế khi sử dụng đánh giá kiểu gen phục vụ nghiên cứu chọn tạo giống. Mỗi phương pháp được đánh giá dựa vào khả năng khuếch đại của phản ứng PCR, thành phần hóa chất, vật tư tiêu hao cũng như thời gian thực hiện. Kết quả cho thấy phương pháp ly trích bằng NaOH-Tris cho hiệu quả kinh tế cao nhất so với phương pháp IRRI và CTAB. Kết quả sản phẩm PCR của phương pháp NaOH-Tris tương đương với hai phương pháp còn lại. Phương pháp NaOH-Tris được thực hiện trong 2 bước, hiệu quả, thời gian thực hiện ngắn nhất cũng như rẻ tiền nhất so với phương pháp IRRI và CTAB. Phương pháp ly trích ADN với NaOH-Tris thích hợp cho các nghiên cứu ứng dụng chỉ thị phân tử trong chọn tạo giống ở các phòng thí nghiệm trang bị cơ bản tại Việt Nam.

Tóm tắt tiếng anh

Three DNA extraction methods were used to assess their efficient and economical aspects for rice genotyping in breeding programs. Each method was assessed based on PCR amplification, chemical components, consumables and time requirement. The results showed that the NaOH-Tris method had the highest economical efficiency among three methods. The NaOH-Tris method was only done in two steps and consumed less reagents and consumables. This method produced nearly identical PCR amplification results to IRRI and CTAB methods. The NaOH-Tris method will be useful in Marker Assisted Breeding in basic laboratories in Vietnam.

Kí hiệu kho

TTKHCNQG, CVv 490

File toàn văn

Xem toàn văn

Tài liệu tham khảo

[1] Zheng K., Subudhi P. K., Domingo J., Maopantay G., Huang N. (1995), Rapid DNA isolation for marker-assisted se-lection in rice breeding,Rice Genet. Newslett
[2] Zhang Y., Feng C., Bie S., Wang X., Yi X., Zhang C., Qin H. (2016), An Improved TPS Method for Rapid DNA Extraction f-rom Cotton Leaves,Cotton Science
[3] Wang H., Qi M. Q., Cutler A. J. (1993), A simple method of preparing plant-samples for PCR,Nucleic Acids Res
[4] Kim S., Yang J., An G., Jena K. K. (2016), A Simple DNA Preparation Method for High Quality Polymerase Chain Reaction in Rice,Plant Breed. Biotech
[5] Ikeda N., Bautista N. S., Yamada T., Kamijima O., Ishii T. (2001), Ultra-simple DNA extraction method for marker-assisted se-lection using microsatellite markers in rice,Plant Mol. Biol. Rep
[6] Guidet F. (1994), A powerful new technique to quickly prepare hundreds of plant-extracts for PCR and RAPD analyses,Nucleic Acids Res
[7] Doyle J. J., Doyle J. L. (1990), Isolation of plant DNA f-rom fresh tissue,Focus
[8] Collard B. C. Y., Das A., Virk P. S., Mackill D. J. (2007), Evaluation of ‘quick and dirty’ DNA extraction methods for marker-assisted se-lection in rice (Oryza sativa L.),Plant Breeding