HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
Lọc theo danh mục
liên kết website
Lượt truy cập
Lượt truy cập :
22,664,645
- Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam
76
Ung thư học và phát sinh ung thư
BB
Nghiêm Xuân Hoàn, Đào Phương Giang(1), Nguyễn Nhật Hạ, Mai Thanh Bình
Lựa chọn nhóm microrna tiềm năng trong chẩn đoán ung thư dạ dày từ những cơ sở dữ liệu hiện có
Selection of potential microrna groups for gastric cancer diagnosis from existing databases
Tạp chí Y học Việt Nam (Tổng hội Y học Việt Nam)
2025
3
92-95
1859-1868
Ung thư dạ dày (UTDD) là ung thư đứng thứ 4 trong các mặt bệnh ung thư về tỷ lệ mắc mới và đứng thứ 3 vể tỷ lệ tử vong liên quan ung thư thường gặp tại Việt Nam. MicroRNA (miRNA) tham gia vào nhiều quá trình tế bào bao gồm tăng sinh, biệt hóa, apoptosis và đóng vai trò quan trọng trong sinh bệnh học của UTDD. MiRNA có tính ổn định cao trong máu và do đó chẩn đoán UTDD không xâm lấn bằng cách sử dụng miRNA lưu hành trong máu là một biện pháp đầy hứa hẹn. Phương pháp: Danh pháp miRNA, chú thích trình tự và thông tin mục tiêu có sẵn được lấy từ các nền tảng cơ sở dữ liệu sẵn có như miRBase, mirTarbase, miRCancer và KEGG. Sử dụng các công cụ tin sinh TargetScan và miRDB, phân tích các cơ sở dữ liệu miRNA đã thu thập để phân nhóm, dự báo các miRNA có liên quan chặt chẽ tới UTDD. Kết quả: Tổng số 449 miRNA được trích xuất từ miRBase, mirTarbase và miRCancer, và 302 miRNA được thu thập từ cơ sở dữ liệu KEGG liên quan tới UTDD. Sau phân tích 2 tệp dữ liệu, 8 microRNA (bao gồm hsa-miR-144-3p, hsa-miR-424-5p, hsa-miR-34a-5p, hsa-let-7f-5p, hsa-7a-5p, hsa-miR-421, hsa-miR-196b-5p và hsa-miR-193a-3p) vượt qua phân tích lựa chọn của Targetscan, và có điểm CWCS> -0,4 trên công cụ tin sinh miRDB cho thấy liên quan chặt chẽ tới UTDD. Kết luận: Sau phân tích bằng Targetscan và miRBase, tìm được một số microRNA tiềm năng có thể sử dụng để thiết kế nghiên cứu, đánh giá giá trị của microRNA trong hỗ trợ chẩn đoán UTDD.
Gastric cancer (GC) ranks as the 4th most common cancer in terms of incidence and the 3rd leading cause of cancer-related mortality in Vietnam. MicroRNAs (miRNAs) are involved in various cellular processes, including proliferation, differentiation, and apoptosis, and play a critical role in the pathogenesis of GC. Due to their high blood stability, non-invasive diagnosis of GC using circulating miRNAs is a promising approach. Methods: miRNA nomenclature, sequence annotation, and target information were retrieved from available database platforms such as miRBase, mirTarbase, miRCancer, and KEGG. Using bioinformatics tools TargetScan and miRDB, collected miRNA databases were analyzed to cluster and predict miRNAs closely associated with GC. Results: A total of 449 miRNAs were extracted from miRBase, mirTarbase, and miRCancer, while 302 miRNAs related to GC were obtained from the KEGG database. After analyzing the two datasets, eight miRNAs (including hsa-miR-144-3p, hsa-miR-424-5p, hsa-miR-34a-5p, hsa-let-7f-5p, hsa-7a-5p, hsa-miR-421, hsa-miR-196b-5p, and hsa-miR-193a-3p) passed the selection analysis in TargetScan and a CWCS score > -0.4 in the miRDB bioinformatics tool, indicating a strong association with GC. Conclusion: Following analysis with TargetScan and miRBase, several potential miRNAs were identified that could be utilized for designing studies to evaluate their diagnostic value in supporting GC diagnosis.
TTKHCNQG, CVv 46
Xem toàn văn