Bệnh bạc lá là một trong những bệnh hại chính trong sản xuất lúa (Oryza sativa) ở Việt Nam. Công nghệ chọn tạo giống hiện đại giúp phát triển các dòng lúa kháng bạc lá, tuy nhiên, cơ chế phản ứng của cây lúa với bạc lá ở cấp độ phân tử vẫn chưa được khám phá toàn diện. Nghiên cứu này được thực hiện nhằm khai thác các microarray bằng phân tích tin sinh học dữ liệu lớn để sàng lọc và đánh giá đặc tính của gene có biểu hiện khác biệt (DEG) với lây nhiễm bạc lá. Cụ thể, tổng số 1630 DEG (|fold-change| ≥ 2), bao gồm 895 gene được tăng cường biểu hiện và 735 gene bị kìm hãm biểu hiện được sàng lọc từ dữ liệu microarray GSE57670 và GSE108504 liên quan đến lây nhiễm bệnh bạc lá ở cây lúa. Trong đó, nghiên cứu đã lựa chọn 51 DEG có đáp ứng mạnh (|foldchange| ≥ 10) để phân tích biểu hiện gene, chú giải chức năng, đặc tính lý hóa và vị trí cư trú nội bào. Kết quả cho thấy, 51 DEG có biểu hiện đa dạng tại 10 vị trí chính trong điều kiện thường. Các DEG này mã hóa chủ yếu cho protein điều hòa, điển hình như enzyme, nhân tố phiên mã và protein chức năng. Phân tích cho thấy các protein có tính chất lý hóa rất đa dạng, trong khi các protein này được dự đoán là cư trú tại các bào quan chính trong tế bào. Kết quả của nghiên cứu đã cung cấp những dẫn liệu quan trọng cho phân tích chức năng gene làm cơ sở để cải thiện tính kháng bệnh bạc lá ở cây lúa.

Bacterial leaf blight has been regarded as one of the major diseases that occurred in rice (Oryza sativa) cultivation in Vietnam. Recent achievements in the development of bacterial blight-resistant rice lines have been recorded, however, the mechanism of bacterial blight responsiveness at the molecular level has been not clearly described. This current study was performed to explore the previous microarray datasets by using various big-data bioinformatics tools and characterize putative differentially expressed genes (DEG). Particularly, a total of 1630 DEGs (|fold-change| ≥ 2), including 895 up-regulated genes and 735 down-regulated genes has been obtained from two microarray datasets related to the inoculation of bacterial blight in rice plants, namely GSE57670 and GSE108504. Among them, we selected 51 putative strongly-responsive DEGs (|fold-change| ≥ 10) for further expression analysis, gene annotation, feature analysis and subcellular localization. Our study revealed that 51 DEGs exhibited a variable expression level in 10 major tissues in the normal condition. These DEGs mostly encoded regulatory proteins, especially enzymes and transcription factors, and functional proteins. Next, the physic-chemical properties of these proteins were greatly variable, while they were mostly localized in major organelles. Taken together, our study could provide important evidence for further functional characterizations toward the improvement of bacterial blight resistance in rice plants.