BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  21,940,277
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

Di truyền và nhân giống động vật nuôi

Bùi Anh Tuấn, Nguyễn Đức Hiếu, Nghiêm Ngọc Minh, Võ Thị Bích Thủy(1)

Phân tích đa dạng di truyền hệ gen ty thể và nguồn gốc tiến hóa của sáu giống lợn bản địa Việt Nam

Analyze the genetic diversity of mitochondrial genome and the evolutionary origin of six indigenous pigs in Vietnam

Khoa học & Công nghệ Việt Nam

2018

07

53-59

1859-4794

Giống lợn, Hệ gen ty thể, Tiến hóa, Di truyền, Lợn bản địa

Analysis, Genetic diversity, Mitochondrial genome, Evolutionary origin, Indigenous pigs, Vietnam

Cây phát sinh chủng loại của 33 giống lợn nhà và lợn hoang thuộc nhánh châu Âu và châu Á, trong đó có 6 giống lợn bản địa Việt Nam đã được dựng lên từ dữ liệu trình tự vùng D-loop và vùng mã hóa của hệ gen ty thể. Lần đầu tiên dữ liệu hoàn chỉnh về hệ gen ty thể của 6 giống lợn Ỉ, Móng Cái, Mường Khương, Mường Lay, Hương và Hạ Lang được công bố trên GenBank với các mã số truy cập KX094894, KU556691, KY432578, KX147101, KY964306 và KY800118. Mục tiêu của nghiên cứu này là xác định trình tự hoàn chỉnh hệ gen ty thể của cả 6 giống lợn, chú giải chức năng hệ gen, phân tích đa hình trình tự mtDNA, qua đó làm cơ sở để nghiên cứu phát sinh chủng loại, xác định về nguồn gốc và quan hệ tiến hóa của các giống lợn này với các giống lợn khác trên thế giới, phục vụ trực tiếp cho mục tiêu bảo tồn nguồn gen, Kết quả dựa trên khảo sát về khoảng cách di truyền và mối quan hệ phát sinh phân tử cho biết mối quan hệ di truyền theo dòng mẹ giữa 6 giống lợn bản địa Việt Nam và những giống lợn bản địa này có mối quan hệ gần gũi với các nhóm lợn Nam Trung Quốc và lưu vực sông Hoàng Hà. Những kết quả nghiên cứu của đề tài là nguồn dẫn liệu quan trọng cho các nghiên cứu khác về các giống lợn bản địa ở Việt Nam.

The tree derives a range of 33 domestic and wild pig breeds of European and Asian branches, including 6 indigenous Vietnamese breeds that have been built f-rom D-loop sequence data and coding region of the system. mitochondrial gene. For the first time, complete data on the mitochondrial genomes of 6 pig breeds of O, Mong Cai, Muong Khuong, Muong Lay, Huong and Ha Lang were published on GenBank with access codes KX094894, KU556691, KY432578, KX147101, KY964306 and KY800118. The objective of this study was to identify the complete mitochondrial genome of all 6 pig breeds, annotate the genome function, analyze mtDNA polymorphic sequence, thereby serving as a basis for the study of phylogenetic type, identify the origin and evolutionary relationship of these pig breeds with other pig breeds in the world, directly serving the purpose of genetic resource conservation. The results are based on the survey on genetic distance and termites. The phylogenetic relationship indicates the genetic relationship between the 6 indigenous breeds of Vietnam and these indigenous breeds have a close relationship with the South Chinese pig groups and the Yellow River basin. The results of this research are an important source for other research on indigenous pig breeds in Vietnam.

TTKHCNQG, CVv 8

Xem toàn văn
  • [1] (2016), Phê duyệt danh mục đặt hàng nhiệm vụ quỹ gen cấp quốc gia xét giao trực tiếp bắt đầu thực hiện từ năm 2016.,Quyết định số 1011/QĐ-BKHCN . http://thuvienphapluat.vn.
  • [2] Đ.T. Năm (2005), Nuôi thử nghiệm giống lợn Hương quý hiếm của Trung Quốc tại Cao Bằng,http://khcncaobang.gov.vn.
  • [3] E. Giuffra; J.M. Kijas; V. Amarger; O. Carlborg; J.T. Jeon; L. Andersson (2000), The origin of the domestic pig: independent domestication and subsequent introgression,Genetics, 154, pp.1785-1791.
  • [4] G.S. Wu; Y.G. Yao; K.X. Qu; Z.L. Ding; H. Li; M.G. Palanichamy; Z.Y. Duan; N. Li; Y.S. Chen;Y.P. Zhang (2007), Population phylogenomic analysis of mitochondrial DNA in wild boars and domestic pigs revealed multiple domestication events in East Asia,Genome Biology, 8, pp.1-12
  • [5] L.Y. Wang; Y.L. Chai; H.M. Ma (2016), The complete sequence of the mitochondrial genome of Duroc pig (Sus Scrofa),Mitochondrial DNA. Part A, DNA Mapping, Sequencing, and Analysis, 27, pp.3-4
  • [6] A.J. Drummond; M.A. Suc-hard; D. Xie; A. Rambaut (2012), Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7,Molecular Biology and Evolution, 29, pp.1969-1973
  • [7] J.P. Huelsenbeck; F. Ronquist (2001), MRBAYES: Bayesian inference of phylogenetic trees,Bioinformatics, 17, pp.754-755
  • [8] M. Hasegawa; H. Kishino; T.A. Yano (1985), Dating of the human-ape splitting by a molecular clock of mitochondrial DNA,Journal of Molecular Evolution, 22, pp.160-174.
  • [9] J. Rozas; A. Ferrer-Mata; J.C. Sanchez-DelBarrio; S. Guirao-Rico; P. Librado; S.E. Ramos-Onsins; A. Sanchez-Gracia (2017), DnaSP 6: DNA Sequence Polymorphism Analysis of Large Data Sets,Molecular Biology and Evolution, 34, pp.3299-3302
  • [10] D.A. Benson; M. Cavanaugh; K. Clark; I. Karsch-Mizrachi; D.J. Lipman; J. Ostell; E.W. Sayers (2013), GenBank,Nucleic Acids Research, 41, pp.D36-D42
  • [11] S.F. Altschul; T.L. Madden; A.A. Schäffer; J. Zhang; Z. Zhang; W. Miller; D.J. Lipman (1997), Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs,Nucleic Acids Research, 25, pp.3389-3402
  • [12] T. Seemann (2014), Prokka: rapid prokaryotic genome annotation,Bioinformatics, 30, pp.2068-2069
  • [13] M. Bernt; A. Donath; F. Jühling; F. Externbrink; C. Florentz; G. Fritzsch; J. Pütz; M. Middendorf; P.F. Stadler (2013), MITOS: Improved de novo metazoan mitochondrial genome annotation,Molecular Phylogenetics and Evolution, 69, pp.313-319
  • [14] S. Kumar; G. Stecher; K. Tamura (2016), MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets,Molecular Biology and Evolution, 33, pp.1870-1874
  • [15] J. Hein; J. Stovlbaek (1996), Combined DNA and protein alignment,Methods in Enzymology, 266, pp.402-418
  • [16] F. Sanger; S. Nicklen; A.R. Coulson (1977), DNA sequencing with chain-terminating inhibitors,Proceedings of The National Academy of Sciences, 74, pp.5463-5467.
  • [17] G. Yu; H. Xiang; J. Wang; X. Zhao (2013), The phylogenetic status of typical Chinese native pigs: analyzed by Asian and European pig mitochondrial genome sequences,Animal Science and Biotechnology, 4, pp.4-9
  • [18] N. Ishiguro; M. Sasaki; M. Iwasa, N. Shigehara; H. Hongo; T. Anezaki; V.T. Long; D.T.B. Lan; P.T. Long (2008), mtDNA variation in Vietnamese pigs, with particular emphasis on the genetic relationship between wild boars f-rom Vietnam and the Ryukyu Islands,Mammal Study, 33, pp.51-58
  • [19] H. Hongo; N. Ishiguro; T. Watanobe; N. Shigehara; T. Anezaki; V.T. Long; D.V. Binh; N.T. Tien; N.H. Nam (2002), Variation in mitochondrial DNA of Vietnamese pigs: relationships with Asian domestic pigs and Ryukyu wild boars,Zoological Science, 19, pp.1329-1335
  • [20] P.J. Piper; H. Matsumura; D. Bulbeck (2017), New perspectives in Southeast Asian and Pacific prehistory,Acton ACT: ANU Press, http://press-files.anu.edu.au/downloads/press/n2320/pdf/book.pdf?referer=2320.
  • [21] J.C. Avise (1993), Molecular Markers, Natural History and Evolution,Chapman and Hall
  • [22] W.M. Brown; M.Jr. George; A.C. Wilson (1979), Rapid evolution of animal mitochondrial DNA,Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 76, pp.1967-1971
  • [23] D.R. Wolstenholme (1992), Animal mitochondrial DNA: structure and evolution,International Review of Cytology, 141, pp.173-216
  • [24] B.M. Epstein (1986), "Pig". Evolution of Domesticated Animals,John Wiley & Sons, Incorporated, pp.145-162
  • [25] T.Q. Dang Nguyen; N.K. Tich; B.X. Nguyen; M. Ozawa; K. Kikuchi; N. Manabe; J. Ratky; Y. Kanai; T. Nagai (2010), Introduction of various vietnamese indigenous pig breeds and their conservation by using assisted reproductive techniques,Journal of Reproduction and Development, 56, pp.5-31
  • [26] (2005), Danh mục nguồn gen vật nuôi quý hiếm cần bảo tồn,Quyết định số 88/2005/QĐ-BNN