Giá trị sử dụng của phương pháp RT-qPCR tiết kiệm hóa chất chẩn đoán SARS-CoV-2 từ mẫu phết tỵ hầu

Chỉ số đề mục

Lĩnh vực nghiên cứu

Kỹ thuận chẩn đoán bệnh

Dạng tài liệu

Tác giả

Nguyễn Hưng Thịnh, Nguyễn Đoàn Huỳnh Anh Phúc, Nguyễn Hữu Ngọc Tuấn⁽¹⁾

Nhan đề

Giá trị sử dụng của phương pháp RT-qPCR tiết kiệm hóa chất chẩn đoán SARS-CoV-2 từ mẫu phết tỵ hầu

Nhan đề tiếng anh

Nguồn trích

Tạp chí Y học Việt Nam (Tổng hội Y học Việt Nam)

Năm xuất bản

2022

Số

2

Trang

130-133

ISSN

1859-1868

Từ khóa

Mẫu phết tỵ hầu, Chẩn đoán, Covid-19, SARS-CoV-2, RT-qPCR

Từ khóa tiếng anh

Tóm tắt

Thách thức lớn của việc kiểm soát dịch hiệu quả bao gồm gánh nặng về chi phí và năng lực chăm sóc sức khỏe. Xét nghiệm phát hiện RNA của virus trong mẫu phết tỵ hầu của người bằng kỹ thuật RT-qPCR là then chốt trong công tác phòng chống dịch tại Việt Nam. Tuy nhiên, kỹ thuật này đặt ra nhiều thách thức bao gồm tốc độ xét nghiệm chậm, chi phí xét nghiệm cao và sự thiếu hụt nguồn cung hóa chất và vật tư xét nghiệm. Nghiên cứu cải tiến quy trình kỹ thuật thực hiện phản ứng RT-qPCR chẩn đoán SARS-CoV-2 này nhằm nâng cao hiệu quả xét nghiệm khẳng định SARS-CoV-2. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Nghiên cứu thực nghiệm được thực hiện trên bộ sinh phẩm LightMix® Modular EAV RNA Extraction Control (Roche, Thụy Sỹ), bộ sinh phẩm TaqPath™ COVID‑19 CE‑IVD RT‑PCR Kit (ThermoFisher, Hoa Kỳ) và các mẫu RNA được ly trích từ mẫu phết tỵ hầu từ người tình nguyện. Điều kiện phản ứng liên quan đến dung tích phản ứng, nồng độ đoạn mồi và đoạn dò lần được được giảm còn 50% so với khuyến cáo. Tại mỗi điều kiện, giá trị sử dụng của phản ứng RT-qPCR được khảo sát và ghi nhận về các tiêu chí kỹ thuật của phản ứng PCR, độ chính xác, độ nhạy và độ đặc hiệu. Kết quả: Phản ứng RT-qPCR ở thể tích phản ứng 20 μL với nồng độ đoạn mồi và đoạn dò giảm đi 50% và ở thể tích phản ứng 10 μL thỏa các tiêu chí kỹ thuật của phản ứng PCR. Độ chính xác cao với CV trong một ngày và ba ngày nhỏ hơn 11%, độ nhạy và độ đặc hiệu 100%. Kết luận: Quy trình kỹ thuật RT-qPCR chẩn đoán SARS-CoV-2 từ mẫu phết tỵ hầu tiết kiệm hóa chất đạt các tiêu chí của quy trình xác nhận giá trị sử dụng của xét nghiệm, có khả năng áp dụng và chuyển giao cho các cơ sở y tế.

Tóm tắt tiếng anh

Kí hiệu kho

TTKHCNQG, CVv 46

File toàn văn

Xem toàn văn

Tài liệu tham khảo

[1] Fisher, T., (2021), Precision in qPCR.,
[2] (2021), Technical validation protocol for SARS - CoV - 2 nucleic acid detection,
[3] Mitchell, S., et al., (2020), Verification procedure for commercial tests with Emergency Use Authorization for the detection of SARS-CoV-2 RNA,
[4] Stephen Bustina, J.H., (2017), qPCR primer design revisitedBiomolecular Detection and Quantification,Biomolecular Detection and Quantification, 2017. 14: p. 19-28.
[5] Biorad (2006), Real-Time PCR Applications Guide,
[6] Bohn, M.K., et al., (2020), IFCC interim guidelines on molecular testing of SARS-CoV-2 infection,
[7] (1994), Standardization, I.O.f., ISO 5725-1: 1994: accuracy (trueness and precision) of measurement methods and results-part 1: general principles and definitions,
[8] Zhou, P., et al., (2020), A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin,