Phát hiện đột biến gen 16s rRNA và 23s rRNA trong các chủng Salmonella đa kháng thuốc được phân lập từ các nguồn khác nhau bằng phương pháp giải trình tự RNA-SEQ

Chỉ số đề mục

Lĩnh vực nghiên cứu

Công nghệ sinh học

Dạng tài liệu

Tác giả

Nhan đề

Phát hiện đột biến gen 16s rRNA và 23s rRNA trong các chủng Salmonella đa kháng thuốc được phân lập từ các nguồn khác nhau bằng phương pháp giải trình tự RNA-SEQ

Nhan đề tiếng anh

Detection of 16S rRNA and 23S rRNA gene mutations in multidrug resistant salmonella serovars isolated from different sources using rna sequencing method

Nguồn trích

Công nghệ Sinh học

Năm xuất bản

2018

Số

16

Trang

737-744

ISSN

1811-4989

Từ khóa

Salmonella đa kháng thuốc, Đột biến điểm, 16S rRNA, 23S rRNA, Giải trình tự, mRNA

Từ khóa tiếng anh

MDR Salmonella, Mutation, 16S rRNA gene, 23S rRNA gene, RNAsequencing

Tóm tắt

Sự gia tăng của vi khuẩn kháng thuốc đang xảy ra trên toàn thế giới. Kháng kháng sinh là một vấn đề nghiêm trọng đối với con người, vì các vi sinh vật gây bệnh có khả năng kháng thuốc sẽ làm mất tác dụng của kháng sinh. Cơ chế kháng thuốc ở vi khuẩn bao gồm các kênh bơm thải thuốc, cải biến và làm thoái biến thuốc, đột biến, thay đổi đích tác động của thuốc. Tuy nhiên, hiểu biết của chúng ta về cách vi khuẩn kháng kháng sinh vẫn còn rời rạc, đặc biệt là đối với các thuốc có đích tác động là ribosome. Salmonella là một nguyên nhân hàng đầu gây ô nhiễm thực phẩm trên thế giới. Số lượng vi khuẩn kháng kháng sinh này phân lập được ở người đang tăng lên, cho thấy sự lây lan của các loài vi khuẩn kháng kháng sinh là mối đe dọa lớn đối với sức khỏe cộng đồng. Salmonella thường có mặt trong một lượng lớn các loài động vật, trong thức ăn, và môi trường, nhưng kiến thức của chúng ta về cách Salmonella kháng thuốc vẫn còn chưa rõ ràng. Do đó, mục đích của nghiên cứu này là hỗ trợ trong việc nghiên cứu các cơ chế mới giúp vi khuẩn các kháng kháng sinh có đích tác động là ribosome. Chúng tôi sàng lọc biểu hiện đột biến của các gen 16S rRNA và 23S rRNA ở các loài Salmonella đa kháng kháng sinh phân lập được từ thịt bán lẻ ở khu vực Hà Nội, Việt Nam. Kết quả đã xác định được 193 đột biến điểm (64 đột biến ở gen 16S rRNA và 129 đột biến ở gen 23S rRNA). Những đột biến này có thể có vai trò trong đề kháng kháng sinh streptomycin. Kết quả này cho thấy rằng còn nhiều đột biến kháng kháng sinh vẫn còn chưa được biết đến, ngay cả đối với các kháng sinh cổ điển. Nghiên cứu này chỉ là kết quả sơ bộ, việc đánh giá thực nghiệm cần được tiến hành trước khi được áp dụng ở Salmonella và các loài vi khuẩn khác.

Tóm tắt tiếng anh

The rapid emergence of resistant bacteria is occurring worldwide. Antibiotic resistance is a serious problem for human beings because pathogenic microorganisms that acquire such resistance void antibiotic treatments. Bacterial antibiotic resistance mechanisms include efflux, reduced influx, modification and degradation of the drug, as well as mutation, modification or overexpression of the target. However, our knowledge as to how bacteria acquire antibiotic resistance is still fragmented, especially for ribosome-targeting drugs. Salmonella is a leading cause of foodborne salmonellosis in the world. The number of antibiotic resistant isolates identified in humans is steadily increasing, suggesting that the spread of antibiotic resistant strains is a major threat to public health. Salmonella is commonly identified in a wide range of animal hosts, food sources, and environments, but our knowledge as to how Salmonella resistance to antibiotics is still fragmented in this ecologically complex serovar. Therefore, the aim of this study was to support for finding novel mechanisms that render bacteria resistant to the ribosome targeting antibiotics, we screen for antibiotic resistant 16S and 23S ribosomal RNAs (rRNAs) in multidrug resistant Salmonella serovars isolated from raw retail meats isolated from Hanoi, Vietnam. Bioinformatic analysis identified 193 unknown novel mutations (64 mutations in 16S rRNA and 129 mutations in 23S rRNA genes). These mutations might play a role in streptomycin resistant in Salmonella serovars. These results suggest that uncharacterized antibiotic resistance mutations still exist, even for traditional antibiotics. This study is only a preliminary kind, further validation before they are applied in Salmonella or other closely related species are required.

Kí hiệu kho

TTKHCNQG, CVv 262

File toàn văn

Xem toàn văn