



- Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam
Ngô Đại Phú , Ngô Vĩnh Tường , Phạm Huy Hoà , Bùi Thị Hồng Nhu , Võ Thanh Nhân , Lê Quang Thanh , Lê Thái Khương , Hoàng Anh Vũ(1) , Nguyễn Duy Sinh , Hoàng Thành Chí , Nguyễn Đăng Quân , Nguyễn Trọng Bình
Preliminary study of BRCA1 and BRCA2 mutations among Vietnamese ovarian carcinomas population by using ion personal genome machine platforms
BƯỚC ĐẦU KHẢO SÁT ĐỘT BIẾN GEN BRCA1 VÀ BRCA2 TRONG QUẦN THỂ UNG THƯ BIỂU MÔ BUỒNG TRỨNG NGƯỜI VIỆT NAM BẰNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ THẾ HỆ MỚI
Tạp chí Khoa học Đại học Huế: Khoa học Tự nhiên
2020
1A
BRCA1 và BRCA2 là hai gen ức chế khối u quan trọng. Việc đột biến hai gen này ở bệnh nhân ung thư biểu mô buồng trứng dòng mầm và dòng sinh dưỡng thì đáp ứng tốt hơn với thuốc ức chế enzyme poly(ADP-ribose) polymerase inhibitor (PARPi). Gần đây, một vài thuốc PARPi, như Olaparib và Rucaparib, đã được chấp thuận dùng cho bệnh nhân ung thư buồng trứng với đột biến dòng mầm BRCA1/2 bởi Food and Drug Administration (FDA) và với đột biến dòng mầm và dòng sinh dưỡng đối với European Medicines Agency (EMA). Tuy nhiên, hiện nay Việt Nam chưa có dữ liệu nào đáng tin cậy về tình trạng đột biến hai gen này trong quần thể bệnh nhân ung thư biểu mô buồng trứng nhằm hỗ trợ cho điều trị. Do đó, chúng tôi tiến hành giải trình tự nhằm khảo sát đột biến hai gen BRCA1/2 dòng mầm và dòng sinh dưỡng ở bệnh nhân ung thư biểu mô buồng trứng người Việt Nam. Trong nghiên cứu này, chúng tôi tiến hành giải trình tự hai gen này bằng Ion Torrent PGM. Đối tượng nghiên cứu là 11 mẫu mô vùi nến được thu nhận từ Bệnh viện Từ Dũ của 11 bệnh nhân ung thư biểu mô buồng trứng. DNA từ các mẫu này và 2 mẫu đối chứng đã biết thông tin đột biến được tiến hành multilplex PCR với kit Oncomine BRCA Research Assay. Trong mười một mẫu được giải trình tự, một đột biến gây bệnh (1/11 bệnh nhân; 9,1%) đã được phát hiện trên gen BRCA1, là đột biến điểm đưa codon stop vào trình tự protein tại vị trí axit amin 1772. Tóm lại, quy trình giải trình tự của chúng tôi thành công trong việc xác định và khảo sát tỉ lệ đột biến BRCA1/2 trong một nhóm nhỏ bệnh nhân ung thư biểu mô buồng trứng với mẫu sinh phẩm là mô vùi nến.
BRCA1 and BRCA2 are two important tumor suppressor genes. The germline and somatic mutations of these two genes in ovarian carcinomas are sensitive for treatment with ADP-ribose polymerase enzyme inhibitor (PARPi). Recently, several PARPi drugs, such as Olaparib and Rucaparib, have been approved for ovarian cancer with BRCA1/2 germline mutations by Food and Drug Administration (FDA), and for both germline and somatic mutations by European Medicines Agency (EMA). However, there have no been reliable data about the prevalence of mutations of these two genes in ovarian carcinomas population for treatment in Vietnam so far. Therefore, we studied the prevalence of the BRCA1/2 germline and somatic mutations among ovarian carcinomas patients in the Vietnamese population. In this study, we sequenced these two genes by using Ion Torrent PGM. The subjects of the study are 11 formalin-fixed paraffin-embedded tumor (FFPE) samples f-rom 11 patients with ovarian carcinomas obtained f-rom Tu Du Hospital of Obstetrics and Gynecology (Vietnam). Multiplex PCR then was performed on the DNA samples and two controls containing known mutations by using Oncomine BRCA Research Assay. Of the sequenced 11 samples, a pathogenic mutation (1/11 patient, 9.1%) detected on the BRCA1 gene was a nonsense point mutation causing stop codon at the position of amino acid 1772. Consequently, our sequencing workflow shows the success in identifying and investigating the prevalence of BRCA1/2 mutation in a small group of ovarian carcinomas with FFPE tumor samples
- [1] Do H, Dobrovic A (2015), Sequence artifacts in DNA f-rom formalin-fixed tissues: Causes and strategies for minimization.,Clinical Chemistry. 2015;61(1):64-71.
- [2] (), Oncomine BRCA Research Assay for variant detection by next-generation sequencing [internet]. [cited 2019 Sep 12],Available f-rom: https://assets. thermofisher.com/TFS-Assets/CSD/ReferenceMaterials/brca-assay-variant-detection-whitepaper.pdf
- [3] Ginsburg O, Dinh N, To T, Quang L, Linh N, Duong B, Royer R, Llacuachaqui M, Tulman A, Vichodez G, Li S, Love R, Narod S (2010), Family history, BRCA mutations and breast cancer in Vietnamese women.,Clinical Genetics. 2010;80(1):89-92.
- [4] (), sbSNP [internet]; [rs80357123]. [cited 2019 Sep 12].,Available f-rom: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/ rs80357123#seq_hash
- [5] (), ClinVar [internet]; [VCV000055480.4]; 2016 [cited 2019 Sept 12].,Available f-rom: https://www.ncbi. nlm.nih.gov/clinvar/variation/VCV000055480.4
- [6] Chính LTM, Ban ĐD, Châu HMC (2004), Kết quả nghiên cứu đột biến gen BRCA1/BRCA2 ở 24 bệnh nhân ung thư vú,Trường Đại học Dược Hà Nội
- [7] Hiển PD, Tờ TV, Định NV/Việt Nam (2010), Nghiên cứu xác định đột biến gen BRCA1 và BRCA2 trong ung thư vú ở phụ nữ việt nam,Bộ Khoa học Công nghệ, Bệnh viện K
- [8] Balasubramaniam S, Beaver JA, Horton S, Fernandes LL, Tang S, Horne HN, et al. (2017), FDA Approval Summary: Rucaparib for the Treatment of Patients with De-leteriousBRCAMutation–Associated Advanced Ovarian Cancer,Clinical Cancer Research. 2017;23(23): 7165-7170
- [9] Lee J, Hays JL, Annunziata CM, Noonan AM, Minasian L, Zujewski JA, et al (2014), Phase I/Ib Study of Olaparib and Carboplatin in BRCA1 or BRCA2 Mutation-Associated Breast or Ovarian Cancer With Biomarker Analyses,JNCI: Journal of the National Cancer Institute. 2014;106(6).
- [10] Ledermann J, Harter P, Gourley C, Friedlander M, Vergote I, Rustin G, et al. (2012), Olaparib Maintenance Therapy in Platinum-Sensitive Relapsed Ovarian Cancer.,New England Journal of Medicine. 2012;366(15):1382-1392.
- [11] Moschetta M, George A, Kaye S, Banerjee S (), BRCA somatic mutations and epigenetic BRCA modifications in serous ovarian cancer,Annals of Oncology. 2016;27(8):1449-1455
- [12] Bell D, Berchuck A, Birrer M, Chien J, Cramer DW, Dao F, et al. (2011), Integrated genomic analyses of ovarian carcinoma.,Nature. 2011;474(7353):609-15.
- [13] Brett MR, Jennifer BP, Thomas AS (2017), Epidemiology of ovarian cancer: a review,Cancer Biology & Medicine. 2017;14(1):9-32.
- [14] Nguyễn Chấn Hùng, Lê Hoàng Minh, Phạm Xuân Dũng, Đặng Huy Quốc Thịnh (2008), Giải Quyết Gánh Nặng Ung Thư Cho Thành Phố Hồ Chí Minh.,Y Học Tp Hồ Chí Minh. 2008:12
- [15] Bray F, Ferlay J, Soerjomataram I, Siegel RL, Torre LA, Jemal A (2018), Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries,CA: A Cancer Journal for Clinicians. 2018;68(6):394-424.