Phân tích hệ gen biểu hiện (exome + transcriptome) của cá tra nhằm phát triển chỉ thị phân tử phục vụ chọn giống cá tra theo hướng tăng trưởng (Giai đoạn 1)

Các nhiệm vụ khác

Nghiên cứu ứng dụng công nghệ bê tông asphalt ấm cho hỗn hợp Stone Matrix Asphalt (SMA) để làm lớp mặt cho kết cấu mặt đường chịu tải trọng xe nặng ở Việt Nam
Đánh giá qui trình nuôi tôm sú (Penaeus monodon) công nghiệp có tảo và có kiểm soát mật độ tảo trên địa bàn tỉnh Trà Vinh
Nghiên cứu sản xuất phân hữu cơ vi sinh đa chức năng đặc chủng cho cây cao su vùng Tây Bắc từ than bùn và phế phụ phẩm nông nghiệp
Xây dựng mô hình ứng dụng tiến bộ khoa học và công nghệ để phát triển kinh tế tại xã Lộc Thành huyện Lộc Ninh tỉnh Bình Phước
Nghiên cứu rào cản thương mại của Ấn Độ và đề xuất giải pháp thúc đẩy xuất khẩu sang thị trường Ấn Độ
Xây dựng mô hình áp dụng tiến bộ kỹ thuật nuôi thủy sản đạt giá trị kinh tế cao ở vùng diện tích chuyển đổi xã Nhật Tân huyện Gia Lộc
Nghiên cứu bảo tồn và phát triển gắn với chuỗi giá trị cây dược liệu bản địa Hoài Sơn (Củ Mài) tại Lào Cai
Hoàn thiện quy trình công nghệ và xây dựng dây chuyền sản xuất cao chiết từ củ Đẳng Sâm (Codonopsis Javanica (Blume) Hook.F) trồng tại huyện Tây Giang - Quảng Nam
Nghiên cứu và chế tạo thực phẩm chống oxy hóa tự nhiên dựa trên sự kết hợp của hoa bụp giấm và thạch dừa
Vai trò của Trung Quốc và Mỹ đối với an ninh Đông Á từ sau Đại hội XIX ĐCS Trung Quốc: Tác động và dự báo

liên kết website

Lượt truy cập

Lượt truy cập : 28,107,926

Kết quả thực hiện nhiệm vụ

Số đăng ký KQ

2018-48-1194/KQNC

Tên nhiệm vụ

Phân tích hệ gen biểu hiện (exome + transcriptome) của cá tra nhằm phát triển chỉ thị phân tử phục vụ chọn giống cá tra theo hướng tăng trưởng (Giai đoạn 1)

Tổ chức chủ trì

Viện Nghiên cứu hệ gen

Cơ quan chủ quản

Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam

Cấp quản lý nhiệm vụ

Quốc gia

Thuộc chương trình

Chủ nhiệm nhiệm vụ

TS. Kim Thị Phương Oanh⁽¹⁾

Cán bộ phối hợp

TS. Lê Thị Nguyên Bình⁽²⁾, TS. Võ Bích Thủy, TS. Nguyễn Thùy Dương, TS. Nguyễn Đăng Tôn, PGS. TS. Nguyễn Huy Hoàng, TS. Nguyễn Văn Sáng, ThS. Nguyễn Thành Phương, ThS. Nguyễn Hoàng Vũ, KS. Nguyễn Thị Hoa

Lĩnh vực nghiên cứu

Di truyền học và nhân giống thuỷ sản

Năm viết báo cáo

2018

Nơi viết báo cáo

Hà Nội

0 (triệu đồng)

Tóm tắt

Đánh giá tính trạng sinh trưởng và thu mẫu cá tra. Giải mã genome cá tra. Dự đoán, phân tích vùng Exome và hiệu chỉnh một phần trình tự genome cá tra bằng phương pháp Sanger. : Giải mã và phân tích transcriptome ở mô cơ của các mẫu cá tra sinh trưởng nhanh và sinh trưởng chậm. Xây dựng cơ sở dữ liệu genome, transcriptome và SNPs của cá tra. Phân tích và lựa chọn các chỉ thị đa hình nucleotide đơn (SNP marker) tiềm năng liên quan đến tính trạng tăng trưởng. Kiểm nghiệm lại các chỉ thị đa hình nucleotide đơn (SNP marker) liên quan đến tính trạng tăng trưởng.
Toàn bộ công việc giải mã genome và transcriptome sẽ được thực hiện bằng công nghệ giải trình tự thế hệ mới NGS và các phương pháp phân tích hiện đại. Dữ liệu về genome và transcriptome của cá tra là thông tin quan trọng đóng góp vào ngân hàng gen quốc tế. Chỉ thị phân tử xác định được từ nghiên cứu này sẽ được sử dụng trong những nghiên cứu sâu hơn nhằm xây dựng bản đồ di truyền, nghiên cứu di truyền liên kết, di truyền quần thể, đa dạng di truyền và chọn giống.

Từ khoá

Cá tra, Hệ gen, Chỉ thị phân tử, Tăng trưởng, Phân tích.

Nơi lưu trữ

24 Lý Thường Kiệt, Hà Nội

Ký hiệu kho

15524