BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  21,935,059
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

76

Khoa học về chăm sóc sức khoẻ và dịch vụ y tế

Nguyễn Thị Hải Hà, Phạm Lê Anh Tuấn, Nguyễn Thị Tâm, Nguyễn Thị Ngọc Lan, Hoàng Hồng Thắm, Tạ Thành Văn(2), Trần Vân Khánh(1)

Xác định biến thể SARS-CoV-2 trên mẫu bệnh nhân Bắc Giang trong vụ dịch 2021 bằng công nghệ giải trình tự thế hệ mới

Tạp chí Nghiên cứu y học (Đại học Y Hà Nội)

2023

02

55-62

2354-080X

SARS-CoV-2, Giải trình tự gen thế hệ mới, Đột biến gene

Đại dịch của hội chứng viêm đường hô hấp cấp (COVID-19) do SARS-CoV-2 là mối đe dọa toàn cầu và đã gây ra những tổn thất nghiêm trọng về kinh tế và xã hội ở Việt Nam cũng như trên toàn thế giới. Việc xác định các biến thể SARS-CoV-2 đang lưu hành có ý nghĩa quan trọng trong việc theo dõi sự tiến hóa của virus, góp phần thúc đẩy nghiên cứu vắc xin và sinh phẩm chẩn đoán. Nghiên cứu này được thực hiện trên 38 bệnh nhân được chẩn đoán dương tính với SARS-CoV-2 từ khu công nghiệp tỉnh Bắc Giang với mục tiêu: Xác định biến thể SARS-CoV-2 và các biến đổi đặc thù trong bộ gen virus bằng phương pháp giải trình tự gen thế hệ mới (NGS). Độ tuổi trung bình tham gia nghiên cứu là 40,16 ± 14,07. Kết quả đã phát hiện được 38 mẫu virus SARS-CoV-2 thuộc biến chủng Delta, 16 biến đổi xuất hiện ở tất cả các mẫu bệnh phẩm, 27 biến đổi đặc thù chỉ xuất hiện ở một số mẫu trong đó có 3 biến đổi trên gen cấu trúc bao gồm S: Leu5Phe, Pro819Ser, His1101Tyr.

TTKHCNQG, CVv 251

Xem toàn văn
  • [1] Marques-Pereira C, Pires MN, Gouveia RP, et al. (2022), SARS-CoV-2 Membrane Protein: F-rom Genomic Data to Structural New Insights.,International Journal of Molecular Sciences.
  • [2] Pulakuntla S, Lokhande KB, Padmavathi P, et al. (2021), Mutational analysis in international isolates and drug repurposing against SARSCoV-2 spike protein: molecular docking and simulation approach. .,VirusDisease.
  • [3] Bascos NAD, Mirano-Bascos D, Saloma CP. (2021), Structural Analysis of Spike Protein Mutations in an Emergent SARS-CoV-2 Variant f-rom the Philippines. bioRxiv.,Published online 2021.
  • [4] Guo E, Guo H. (2020), CD8 T cell epitope generation toward the continually mutating SARS-CoV-2 spike protein in genetically diverse human population: Implications for disease control and prevention.,PLOS ONE.
  • [5] Li Q, Wu J, Nie J, et al. (2020), The Impact of Mutations in SARS-CoV-2 Spike on Viral Infectivity and Antigenicity.,Cell.
  • [6] McLean G, Kamil J, Lee B, et al. (2022), The Impact of Evolving SARS-CoV-2 Mutations and Variants on COVID-19 Vaccines.,mBio.
  • [7] Mukherjee M, Goswami S. (2020), Global cataloguing of variations in untranslated regions of viral genome and prediction of key host RNA binding protein-microRNA interactions modulating genome stability in SARS-CoV-2.,PLOS ONE.
  • [8] Ginex T, Marco-Marín C, Wieczór M, et al. (2022), The structural role of SARS-CoV-2 genetic background in the emergence and success of spike mutations: The case of the spike A222V mutation.,PLOS Pathogens.
  • [9] Muttineni R, R.N. B, Putty K, et al. (2022), SARSCoV-2 variants and spike mutations involved in second wave of COVID-19 pandemic in India.,Transboundary and Emerging Diseases.
  • [10] Guruprasad K. (2020), Geographical Distribution of Amino Acid Mutations in Human SARSCoV-2 Orf1ab Poly-Proteins Compared to the Equivalent Reference Proteins f-rom China. ChemRxiv .,Published online 2020
  • [11] Kang M, Xin H, Yuan J, et al. (2022), Transmission dynamics and epidemiological c-haracteristics of SARS-CoV-2 Delta variant infections in Guangdong, China, May to June 2021.,Eurosurveillance.
  • [12] Kushwaha S, Khanna P, Rajagopal V, Kiran T. (2021), Biological attributes of age and gender variations in Indian COVID-19 cases: A retrospective data analysis.,Clinical Epidemiology and Global Health.
  • [13] Suratekar R, Ghosh P, Niesen MJM, et al. (2022), High diversity in Delta variant across countries revealed by genome-wide analysis of SARSCoV-2 beyond the Spike protein.,Molecular Systems Biology.
  • [14] MacLean OA, Lytras S, Weaver S, et al. (2021), Natural se-lection in the evolution of SARSCoV-2 in bats cre-ated a generalist virus and highly capable human pathogen.,PLOS Biology.