Thông tin nhà nghiên cứu KH&CN

Mã NNC: CB.1306841

TS Nguyễn Hoàng Linh

Cơ quan/đơn vị công tác: Trường Đại học Duy Tân

Lĩnh vực nghiên cứu: Vật lý nguyên tử, vật lý phân tử và vật lý hóa học,

  • Danh sách các Bài báo/Công bố KH&CN
  • Danh sách các Nhiệm vụ KH&CN đã tham gia
[1]

7-Methoxytacrine and 2-Aminobenzothiazole Heterodimers: Structure–Mechanism Relationship of Amyloid Inhibitors Based on Rational Design

Gancar, Miroslav, Kiet Ho, Sk Abdul Mohid, Nguyen Quoc Thai, Zuzana Bednarikova, H. Linh Nguyen, Anirban Bhunia, Eugenie Nepovimova, Mai Suan Li, and Zuzana Gazova
ACS Chemical Neuroscience 11, no. 5 (2020): 715-729; DOI: 10.1021/acschemneuro.9b00419 - Năm xuất bản: 2020; ISSN/ISBN: 1948-7193
[2]

Alzheimer’s amyloid-β sequesters caspase-3 in vitro via its C-terminal tail

Chang, Yu-Jen, Nguyen Hoang Linh, Yao Hsiang Shih, Hui-Ming Yu, Mai Suan Li, and Yun-Ru Chen
ACS Chemical Neuroscience 7, no. 8 (2016): 1097-1106; DOI: 10.1021/acschemneuro.6b00049 - Năm xuất bản: 2016; ISSN/ISBN: 1948-7193
[3]

Amyloid β Dodecamer Disrupts the Neuronal Membrane More Strongly than the Mature Fibril: Understanding the Role of Oligomers in Neurotoxicity

Hoang Linh Nguyen, Huynh Quang Linh, Pawel Krupa, Giovanni La Penna, Mai Suan Li
The Journal of Physical Chemistry B, 126, 20, 3659-3672; DOI: 10.1021/acs.jpcb.2c01769 - Năm xuất bản: 2022; ISSN/ISBN: 1520-6106
[4]

Aβ41 aggregates more like Aβ40 than like Aβ42: in silico and in vitro study

Nguyen, Hoang Linh, Tran Thi Minh Thu, Phan Minh Truong, Pham Dang Lan, Viet Hoang Man, Phuong H. Nguyen, Ly Anh Tu, Yi-Cheng Chen, and Mai Suan Li
The Journal of Physical Chemistry B 120, no. 30 (2016): 7371-7379; DOI: 10.1021/acs.jpcb.6b06368 - Năm xuất bản: 2016; ISSN/ISBN: 1520-6106
[5]

Binding affinity of the L-742,001 inhibitor to the endonuclease domain of A/H1N1/PA influenza virus variants: Molecular simulation approaches

Hung Nguyen, Hoang Linh Nguyen, Huynh Quang Linh, Minh Tho Nguyen
Chemical Physics 500 (2018): 26-36; DOI: 10.1016/j.chemphys.2017.11.005 - Năm xuất bản: 2018; ISSN/ISBN: 1873-4421
[6]

Computational model to unravel the function of amyloid-β peptides in contact with a phospholipid membrane

Dinh Quoc Huy Pham, Pawel Krupa, Hoang Linh Nguyen, Giovanni La Penna, Mai Suan Li
The Journal of Physical Chemistry B, 124, 16, 3300–3314; DOI: 10.1021/acs.jpcb.0c00771 - Năm xuất bản: 2020; ISSN/ISBN: 1520-6106
[7]

Determination of Multidirectional Pathways for Ligand Release from the Receptor: A New Approach Based on Differential Evolution

Hoang Linh Nguyen, Nguyen Quoc Thai, Mai Suan Li
Journal of Chemical Theory and Computation, 18, 6, 3860–3872; DOI: 10.1021/acs.jctc.1c01158 - Năm xuất bản: 2022; ISSN/ISBN: 1549-9618
[8]

Does SARS-CoV-2 bind to human ACE2 more strongly than does SARS-CoV?

Hoang Linh Nguyen, Pham Dang Lan, Nguyen Quoc Thai, Daniel A Nissley, Edward P O’Brien, Mai Suan Li
The Journal of Physical Chemistry B, 124, 34, 7336–7347; DOI: 10.1021/acs.jpcb.0c04511 - Năm xuất bản: 2020; ISSN/ISBN: 1520-6106
[9]

Elastic moduli of normal and cancer cell membranes revealed by molecular dynamics simulations

Hoang Linh Nguyen, Viet Hoang Man, Mai Suan Li, Philippe Derreumaux, Junmei Wang, Phuong H Nguyen
Physical Chemistry Chemical Physics, 24, 6225-6237; DOI: 10.1039/D1CP04836H; - Năm xuất bản: 2022; ISSN/ISBN: 1463-9084
[10]

Emergence of barrel motif in amyloid-β trimer: a computational study

Hoang Linh Nguyen, Huynh Quang Linh, Paolo Matteini, Giovanni La Penna, Mai Suan Li
The Journal of Physical Chemistry B, 124, 47, 10617–10631; DOI: 10.1021/acs.jpcb.0c05508 - Năm xuất bản: 2020; ISSN/ISBN: 1520-6106
[11]

Erythromycin leads to differential protein expression through differences in electrostatic and dispersion interactions with nascent proteins

Hoang Linh Nguyen, Dang Lan Pham, Edward P O’Brien, Mai Suan Li
Scientific reports, 8,6460; DOI:10.1038/s41598-018-24344-9 - Năm xuất bản: 2018; ISSN/ISBN: 2045-2322
[12]

Erythromycin, Cethromycin and Solithromycin display similar binding affinities to the E. coli´s ribosome: A molecular simulation study

Hoang Linh Nguyen, Pham Hong An, Nguyen Quoc Thai, Huynh Quang Linh, Mai Suan Li
Journal of Molecular Graphics and Modelling, 91, 80-90; DOI: 10.1016/j.jmgm.2019.06.002 - Năm xuất bản: 2019; ISSN/ISBN: 1093-3263
[13]

Identifying inhibitors of NSP16-NSP10 of SARS-CoV-2 from large databases

Hoang Linh Nguyen, Nguyen Quoc Thai, Mai Suan Li
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics; DOI: 10.1080/07391102.2022.211494 - Năm xuất bản: 2022; ISSN/ISBN: 1538-0254
[14]

Impact of mutations at C-terminus on structures and dynamics of Aβ40 and Aβ42: a molecular simulation study

Linh, Nguyen Hoang, Tran Thi Minh Thu, LyAnh Tu, Chin-Kun Hu, and Mai Suan Li
The Journal of Physical Chemistry B 121, no. 17 (2017): 4341-4354; DOI: 10.1021/acs.jpcb.6b12888 - Năm xuất bản: 2017; ISSN/ISBN: 1520-6106
[15]

Investigation of binding affinity between potential antiviral agents and PB2 protein of influenza A: Non-equilibrium molecular dynamics simulation approach

Tri Pham, Hoang Linh Nguyen, Tuyn Phan-Toai, Hung Nguyen
International Journal of Medical Sciences, 17(13): 2031–2039; DOI: 10.7150/ijms.46231 - Năm xuất bản: 2020; ISSN/ISBN: 1449-1907
[16]

Molecular dynamics simulation of cancer cell membrane perforated by shockwave induced bubble collapse

Nguyen Hoang Linh, Viet Hoang Man, Mai Suan Li, Junmei Wang, Philippe Derreumaux, Thi Ly Mai, Phuong H. Nguyen
The journal of Chemical Physics, 157, 225102; DOI: 10.1063/5.0105675 - Năm xuất bản: 2022; ISSN/ISBN: 0021-9606
[17]

Nanomechanical stability of Aβ tetramers and fibril-like structures: molecular dynamics simulations

Adolfo B Poma, Tran Thi Minh Thu, Lam Tang Minh Tri, Hoang Linh Nguyen, Mai Suan Li
The Journal of Physical Chemistry B, 125, 28, 7628–7637; DOI: 10.1021/acs.jpcb.1c02322 - Năm xuất bản: 2021; ISSN/ISBN: 1520-6106
[18]

Protocol for fast screening of multi-target drug candidates: Application to Alzheimer’s disease

Thai, Nguyen Quoc, Hoang Linh Nguyen, Huynh Quang Linh, and Mai Suan Li
Journal of Molecular Graphics and Modelling 77 (2017): 121-129; DOI: 10.1016/j.jmgm.2017.08.002 - Năm xuất bản: 2017; ISSN/ISBN: 1873-4243
[19]

Remdesivir strongly binds to both RNA-dependent RNA polymerase and main protease of SARS-CoV-2: evidence from molecular simulations

Hoang Linh Nguyen, Nguyen Quoc Thai, Duc Toan Truong, Mai Suan Li
The Journal of Physical Chemistry B, 124, 50, 11337–11348; DOI: 10.1021/acs.jpcb.0c07312 - Năm xuất bản: 2020; ISSN/ISBN: 1520-6106
[20]

SARS-CoV-2 omicron variant binds to human cells more strongly than the wild type: Evidence from molecular dynamics simulation

Hoang Linh Nguyen, Nguyen Quoc Thai, Phuong H Nguyen, Mai Suan Li
The Journal of Physical Chemistry B, 126, 25, 4669–4678; DOI: 10.1021/acs.jpcb.2c01048 - Năm xuất bản: 2022; ISSN/ISBN: 1520-6106
[21]

Structure and physicochemical properties of the Aβ42 tetramer: multiscale molecular dynamics simulations

Hoang Linh Nguyen, Pawel Krupa, Nguyen Minh Hai, Huynh Quang Linh, Mai Suan Li
The Journal of Physical Chemistry B, 123, 34, 7253–7269; DOI: 10.1021/acs.jpcb.9b04208 - Năm xuất bản: 2019; ISSN/ISBN: 1520-6106
[1]

Xác định cấu trúc tetramer của peptide amyloid beta: mô phỏng động lực học phân tử

Cơ quan quản lý nhiệm vụ/cấp kinh phí:
Thời gian thực hiện: 2019 - 2019; vai trò: Chủ nhiệm nhiệm vụ
[2]

Ảnh hưởng của macrolide lên quá trình cuộn protein từ ribosome

Cơ quan quản lý nhiệm vụ/cấp kinh phí: Sở khoa học công nghệ TP. Hồ Chí Minh
Thời gian thực hiện: 12/2016 - 8/2018; vai trò: thành viên chính
[3]

Hiểu rõ cơ chế tương tác của Thioflavin-T với amyloid beta (1-42) bằng phương pháp mô phỏng động học

Cơ quan quản lý nhiệm vụ/cấp kinh phí: Sở khoa học công nghệ TP. Hồ Chí Minh
Thời gian thực hiện: 4/2020 - 4/2021; vai trò: thành viên chính
[4]

Khảo sát ái lực liên kết của các chất ức chế azaindole và hydroxymethyl azaindole lên protein cúm PB2: tiếp cận mô phỏng Steered Molecular Dynamics

Cơ quan quản lý nhiệm vụ/cấp kinh phí: Sở khoa học công nghệ TP. Hồ Chí Minh
Thời gian thực hiện: 12/2018 - 12/2019; vai trò: thành viên
[5]

Phát triển các phương pháp tính toán để đưa thuốc một cách hiệu quả vào tế bào ung thư

Cơ quan quản lý nhiệm vụ/cấp kinh phí: Sở khoa học công nghệ TP. Hồ Chí Minh
Thời gian thực hiện: 4/2020 - 2/2022; vai trò: thành viên chính
[6]

Tương tác của các peptide amyloid beta với màng lipid và ion đồng: Mô phỏng máy tính

Cơ quan quản lý nhiệm vụ/cấp kinh phí: Sở khoa học công nghệ TP. Hồ Chí Minh
Thời gian thực hiện: 1/2019 - 9/2020; vai trò: thành viên chính
[7]

Xác định cấu trúc tetramer của peptide amyloid beta: mô phỏng động lực học phân tử

Cơ quan quản lý nhiệm vụ/cấp kinh phí: Sở khoa học công nghệ TP. Hồ Chí Minh
Thời gian thực hiện: 12/2018 - 12/2019; vai trò: Chủ nhiệm đề tài
[8]

Động lực học phân tử có định hướng: Kéo đa hướng ở tốc độ thấp

Cơ quan quản lý nhiệm vụ/cấp kinh phí: Sở khoa học công nghệ TP. Hồ Chí Minh
Thời gian thực hiện: 10/2019 - 10/2021; vai trò: thành viên chính